86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3095 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3095  preprotein translocase, SecG subunit  100 
 
 
86 aa  166  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111238  normal  0.0631232 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3322  preprotein translocase, SecG subunit  96.51 
 
 
86 aa  136  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.363921  hitchhiker  0.00119755 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2983  preprotein translocase SecG subunit  64.1 
 
 
80 aa  98.2  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.536026  normal  0.0158601 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1259  preprotein translocase, SecG subunit  57.53 
 
 
81 aa  84  6e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.520413  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0434  preprotein translocase subunit SecG  52.7 
 
 
82 aa  82  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00104862  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1551  preprotein translocase, SecG subunit  63.89 
 
 
80 aa  82.4  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2014  preprotein translocase subunit SecG  55.07 
 
 
79 aa  80.9  0.000000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.136616  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13140  protein translocase subunit secG  59.38 
 
 
77 aa  80.1  0.000000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2050  preprotein translocase, SecG subunit  68.52 
 
 
77 aa  79.7  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2168  preprotein translocase, SecG subunit  56.52 
 
 
81 aa  75.9  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.143214  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2928  preprotein translocase subunit SecG  59.65 
 
 
83 aa  75.5  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2533  protein translocase subunit secG  71.21 
 
 
76 aa  75.1  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1640  preprotein translocase subunit SecG  67.16 
 
 
76 aa  73.6  0.0000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476969  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3007  preprotein translocase, SecG subunit  64.15 
 
 
78 aa  72  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0874625 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11468  preprotein translocase subunit SecG  53.42 
 
 
77 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000326275  normal  0.980006 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2447  preprotein translocase subunit SecG  56.34 
 
 
77 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2453  preprotein translocase subunit SecG  56.34 
 
 
77 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.628392 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2407  preprotein translocase subunit SecG  56.34 
 
 
77 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2201  preprotein translocase, SecG subunit  63.77 
 
 
80 aa  69.7  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000169069  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6035  protein translocase subunit secG  59.7 
 
 
76 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.977593  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2803  preprotein translocase, SecG subunit  66.67 
 
 
78 aa  67  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000076727  hitchhiker  0.00000696704 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3953  preprotein translocase, SecG subunit  46.48 
 
 
82 aa  67.4  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15900  preprotein translocase subunit SecG  61.43 
 
 
76 aa  65.5  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.330495  normal  0.548909 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0906  preprotein translocase, SecG subunit  54.9 
 
 
82 aa  63.9  0.0000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1121  preprotein translocase, SecG subunit  56.25 
 
 
75 aa  62.4  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0046107 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5605  preprotein translocase, SecG subunit  60 
 
 
81 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.278961  normal  0.762128 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11380  protein translocase subunit secG  45 
 
 
83 aa  62.8  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.500271  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1940  preprotein translocase, SecG subunit  51.79 
 
 
81 aa  60.5  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.30341  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2537  preprotein translocase, SecG subunit  70.37 
 
 
81 aa  60.1  0.000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.000769427  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20000  protein translocase subunit secG  59.15 
 
 
83 aa  60.1  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2366  preprotein translocase, SecG subunit  61.76 
 
 
79 aa  58.2  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.323764  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10170  protein translocase, SecG subunit  40 
 
 
84 aa  57  0.00000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000553201  hitchhiker  0.000000506561 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2066  preprotein translocase subunit SecG  64.79 
 
 
76 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.517126  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0921  preprotein translocase, SecG subunit  38.24 
 
 
83 aa  55.8  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.255471 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1990  preprotein translocase subunit SecG  64.15 
 
 
76 aa  56.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.372044  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1052  preprotein translocase, SecG subunit  40.85 
 
 
114 aa  54.7  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1753  preprotein translocase, SecG subunit  47.92 
 
 
84 aa  52  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000258746  normal  0.08391 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2090  preprotein translocase subunit SecG  55.56 
 
 
85 aa  51.6  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.192234  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1831  preprotein translocase subunit SecG  53.7 
 
 
85 aa  50.8  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000888635 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5196  preprotein translocase subunit SecG  68 
 
 
77 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.508963  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0820  preprotein translocase, SecG subunit  44 
 
 
114 aa  48.5  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1402  protein translocase subunit secG  32.05 
 
 
137 aa  47.4  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0700818  normal  0.793248 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2706  preprotein translocase subunit SecG  60.38 
 
 
77 aa  47  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.606041 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3707  preprotein translocase subunit SecG  58.49 
 
 
78 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07170  protein translocase, SecG subunit  35.59 
 
 
84 aa  45.8  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000216048  normal  0.678062 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0816  preprotein translocase, SecG subunit  37.97 
 
 
106 aa  45.4  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000238414  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0926  preprotein translocase subunit SecG  31.25 
 
 
122 aa  45.1  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00206751  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0569  preprotein translocase subunit SecG  36.49 
 
 
110 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.403182  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0805  preprotein translocase subunit SecG  36.49 
 
 
110 aa  43.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.367958  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0814  preprotein translocase, SecG subunit  36.67 
 
 
107 aa  42.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294174 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0852  preprotein translocase, SecG subunit  47.46 
 
 
75 aa  42.7  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3564  preprotein translocase subunit SecG  42.62 
 
 
113 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.202883  hitchhiker  0.00000390785 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2830  preprotein translocase subunit SecG  37.31 
 
 
114 aa  42.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000815505  hitchhiker  0.00315875 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3063  preprotein translocase subunit SecG  38.81 
 
 
111 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000201334  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3511  preprotein translocase subunit SecG  35.48 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3392  preprotein translocase subunit SecG  40.3 
 
 
115 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000462887  hitchhiker  0.000698491 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15230  protein translocase subunit secG  52.54 
 
 
99 aa  42  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0112894  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3595  preprotein translocase subunit SecG  40 
 
 
110 aa  41.6  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0141427  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03040  protein-export membrane protein  40 
 
 
110 aa  41.6  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.339668  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3367  preprotein translocase subunit SecG  40 
 
 
110 aa  41.6  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000380668  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3660  preprotein translocase subunit SecG  40 
 
 
110 aa  41.6  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000383987  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1027  preprotein translocase subunit SecG  33.33 
 
 
125 aa  41.6  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000322315  normal  0.29727 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02991  hypothetical protein  40 
 
 
110 aa  41.6  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375701  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0525  preprotein translocase subunit SecG  40 
 
 
110 aa  41.6  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000320453 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4497  preprotein translocase subunit SecG  40 
 
 
110 aa  41.6  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0118643  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0532  preprotein translocase, SecG subunit  40 
 
 
110 aa  41.6  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.598556  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3471  preprotein translocase subunit SecG  40 
 
 
110 aa  41.6  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00419057  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0987  preprotein translocase subunit SecG  40.98 
 
 
111 aa  41.6  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000357257  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1004  preprotein translocase subunit SecG  42.62 
 
 
110 aa  40.8  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.03745  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0486  preprotein translocase subunit SecG  38.33 
 
 
111 aa  40.8  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.065883  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3482  preprotein translocase subunit SecG  38.33 
 
 
110 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0810868  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3482  preprotein translocase subunit SecG  38.33 
 
 
110 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3588  preprotein translocase subunit SecG  38.33 
 
 
110 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3552  preprotein translocase subunit SecG  38.33 
 
 
110 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3650  preprotein translocase subunit SecG  38.33 
 
 
110 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3349  preprotein translocase, SecG subunit  36.67 
 
 
135 aa  40.4  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389296  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3988  preprotein translocase subunit SecG  36.67 
 
 
111 aa  40.4  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000109182  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3599  preprotein translocase subunit SecG  36.67 
 
 
111 aa  40.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000162935  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3733  preprotein translocase subunit SecG  36.67 
 
 
111 aa  40.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0213713  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0960  preprotein translocase subunit SecG  28.75 
 
 
118 aa  40.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0514774  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3420  preprotein translocase subunit SecG  36.67 
 
 
111 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000118136  decreased coverage  0.0000944454 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3242  preprotein translocase subunit SecG  36.67 
 
 
111 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000345429  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2250  preprotein translocase subunit SecG  31.94 
 
 
125 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000247894  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1638  preprotein translocase subunit SecG  31.94 
 
 
125 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.000000000164362  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1125  preprotein translocase subunit SecG  36.67 
 
 
111 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000669441  unclonable  0.00000000000376809 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3468  preprotein translocase, SecG subunit  37.7 
 
 
111 aa  40  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>