45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2983 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2983  preprotein translocase SecG subunit  100 
 
 
80 aa  144  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.536026  normal  0.0158601 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2014  preprotein translocase subunit SecG  59.42 
 
 
79 aa  82.4  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.136616  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2050  preprotein translocase, SecG subunit  67.92 
 
 
77 aa  76.3  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13140  protein translocase subunit secG  55.71 
 
 
77 aa  75.5  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1551  preprotein translocase, SecG subunit  57.35 
 
 
80 aa  74.3  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3322  preprotein translocase, SecG subunit  65.75 
 
 
86 aa  74.3  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.363921  hitchhiker  0.00119755 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3095  preprotein translocase, SecG subunit  64.1 
 
 
86 aa  73.9  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111238  normal  0.0631232 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0434  preprotein translocase subunit SecG  51.47 
 
 
82 aa  72.4  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00104862  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3007  preprotein translocase, SecG subunit  61.11 
 
 
78 aa  71.2  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0874625 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11468  preprotein translocase subunit SecG  57.35 
 
 
77 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000326275  normal  0.980006 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2168  preprotein translocase, SecG subunit  60.71 
 
 
81 aa  71.2  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.143214  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1259  preprotein translocase, SecG subunit  52.94 
 
 
81 aa  70.9  0.000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.520413  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2453  preprotein translocase subunit SecG  56.72 
 
 
77 aa  67.4  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.628392 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2447  preprotein translocase subunit SecG  56.72 
 
 
77 aa  67.4  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2407  preprotein translocase subunit SecG  56.72 
 
 
77 aa  67.4  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2533  protein translocase subunit secG  62.69 
 
 
76 aa  65.5  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1640  preprotein translocase subunit SecG  60.29 
 
 
76 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476969  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2201  preprotein translocase, SecG subunit  60.87 
 
 
80 aa  65.1  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000169069  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2928  preprotein translocase subunit SecG  56.6 
 
 
83 aa  65.1  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6035  protein translocase subunit secG  58.82 
 
 
76 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.977593  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3953  preprotein translocase, SecG subunit  44.93 
 
 
82 aa  64.7  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5605  preprotein translocase, SecG subunit  54.05 
 
 
81 aa  63.9  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.278961  normal  0.762128 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0906  preprotein translocase, SecG subunit  61.7 
 
 
82 aa  62.4  0.000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2803  preprotein translocase, SecG subunit  60.29 
 
 
78 aa  62.4  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000076727  hitchhiker  0.00000696704 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15900  preprotein translocase subunit SecG  61.76 
 
 
76 aa  61.2  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.330495  normal  0.548909 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1940  preprotein translocase, SecG subunit  54.72 
 
 
81 aa  60.5  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.30341  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1121  preprotein translocase, SecG subunit  59.52 
 
 
75 aa  60.1  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0046107 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11380  protein translocase subunit secG  47.89 
 
 
83 aa  58.9  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.500271  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10170  protein translocase, SecG subunit  44.26 
 
 
84 aa  57.8  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000553201  hitchhiker  0.000000506561 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20000  protein translocase subunit secG  58.82 
 
 
83 aa  57  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1753  preprotein translocase, SecG subunit  40.68 
 
 
84 aa  55.1  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000258746  normal  0.08391 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2066  preprotein translocase subunit SecG  61.76 
 
 
76 aa  54.7  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.517126  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1990  preprotein translocase subunit SecG  61.11 
 
 
76 aa  53.5  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.372044  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2090  preprotein translocase subunit SecG  62.26 
 
 
85 aa  52  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.192234  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1831  preprotein translocase subunit SecG  60.38 
 
 
85 aa  51.6  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000888635 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2366  preprotein translocase, SecG subunit  62.69 
 
 
79 aa  51.2  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.323764  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07170  protein translocase, SecG subunit  41.82 
 
 
84 aa  50.8  0.000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000216048  normal  0.678062 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0921  preprotein translocase, SecG subunit  40.62 
 
 
83 aa  50.4  0.000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.255471 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5196  preprotein translocase subunit SecG  60.38 
 
 
77 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.508963  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2537  preprotein translocase, SecG subunit  65.96 
 
 
81 aa  48.1  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.000769427  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15230  protein translocase subunit secG  59.32 
 
 
99 aa  47  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0112894  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2706  preprotein translocase subunit SecG  56.6 
 
 
77 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.606041 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0852  preprotein translocase, SecG subunit  42.37 
 
 
75 aa  43.5  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3707  preprotein translocase subunit SecG  54.72 
 
 
78 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42850  preprotein translocase subunit SecG  34.38 
 
 
129 aa  40  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>