45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2533 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2533  protein translocase subunit secG  100 
 
 
76 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2014  preprotein translocase subunit SecG  67.14 
 
 
79 aa  97.1  8e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.136616  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13140  protein translocase subunit secG  64.62 
 
 
77 aa  89.7  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1551  preprotein translocase, SecG subunit  54.79 
 
 
80 aa  86.3  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2983  preprotein translocase SecG subunit  62.69 
 
 
80 aa  85.5  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.536026  normal  0.0158601 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2928  preprotein translocase subunit SecG  74.07 
 
 
83 aa  84.7  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1259  preprotein translocase, SecG subunit  59.09 
 
 
81 aa  83.6  8e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.520413  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2168  preprotein translocase, SecG subunit  54.17 
 
 
81 aa  83.6  8e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.143214  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2201  preprotein translocase, SecG subunit  73.33 
 
 
80 aa  82.4  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000169069  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3007  preprotein translocase, SecG subunit  71.15 
 
 
78 aa  80.9  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0874625 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3322  preprotein translocase, SecG subunit  71.21 
 
 
86 aa  78.6  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.363921  hitchhiker  0.00119755 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3095  preprotein translocase, SecG subunit  71.21 
 
 
86 aa  77.8  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111238  normal  0.0631232 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6035  protein translocase subunit secG  65.33 
 
 
76 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.977593  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1640  preprotein translocase subunit SecG  66.67 
 
 
76 aa  72.8  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476969  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0434  preprotein translocase subunit SecG  41.67 
 
 
82 aa  72  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00104862  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2050  preprotein translocase, SecG subunit  62.26 
 
 
77 aa  71.6  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11380  protein translocase subunit secG  49.32 
 
 
83 aa  70.5  0.000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.500271  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11468  preprotein translocase subunit SecG  52.63 
 
 
77 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000326275  normal  0.980006 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3953  preprotein translocase, SecG subunit  47.76 
 
 
82 aa  70.1  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5605  preprotein translocase, SecG subunit  62.32 
 
 
81 aa  69.7  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.278961  normal  0.762128 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15900  preprotein translocase subunit SecG  61.64 
 
 
76 aa  69.7  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.330495  normal  0.548909 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0906  preprotein translocase, SecG subunit  54.55 
 
 
82 aa  69.3  0.00000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1940  preprotein translocase, SecG subunit  57.41 
 
 
81 aa  68.2  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.30341  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20000  protein translocase subunit secG  64.71 
 
 
83 aa  68.2  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2407  preprotein translocase subunit SecG  52.63 
 
 
77 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2453  preprotein translocase subunit SecG  52.63 
 
 
77 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.628392 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2447  preprotein translocase subunit SecG  52.63 
 
 
77 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1121  preprotein translocase, SecG subunit  56.25 
 
 
75 aa  62.4  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0046107 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1990  preprotein translocase subunit SecG  73.58 
 
 
76 aa  60.5  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.372044  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10170  protein translocase, SecG subunit  39.19 
 
 
84 aa  60.5  0.000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000553201  hitchhiker  0.000000506561 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1753  preprotein translocase, SecG subunit  39.34 
 
 
84 aa  58.5  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000258746  normal  0.08391 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2803  preprotein translocase, SecG subunit  54.05 
 
 
78 aa  58.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000076727  hitchhiker  0.00000696704 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2090  preprotein translocase subunit SecG  66.67 
 
 
85 aa  57.4  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.192234  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1831  preprotein translocase subunit SecG  62.96 
 
 
85 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000888635 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15230  protein translocase subunit secG  67.8 
 
 
99 aa  54.3  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0112894  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0921  preprotein translocase, SecG subunit  34.78 
 
 
83 aa  53.9  0.0000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.255471 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2066  preprotein translocase subunit SecG  59.46 
 
 
76 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.517126  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2366  preprotein translocase, SecG subunit  65.62 
 
 
79 aa  51.2  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.323764  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2537  preprotein translocase, SecG subunit  62 
 
 
81 aa  49.7  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.000769427  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0852  preprotein translocase, SecG subunit  54.39 
 
 
75 aa  47.8  0.00005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07170  protein translocase, SecG subunit  36.07 
 
 
84 aa  47.4  0.00007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000216048  normal  0.678062 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5196  preprotein translocase subunit SecG  62.75 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.508963  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1402  protein translocase subunit secG  38.36 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0700818  normal  0.793248 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1884  protein translocase subunit secG  41.27 
 
 
124 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00110105  normal  0.520144 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2706  preprotein translocase subunit SecG  53.7 
 
 
77 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.606041 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>