48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1259 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1259  preprotein translocase, SecG subunit  100 
 
 
81 aa  155  2e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.520413  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1551  preprotein translocase, SecG subunit  66.25 
 
 
80 aa  106  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2168  preprotein translocase, SecG subunit  65 
 
 
81 aa  101  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.143214  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13140  protein translocase subunit secG  54.55 
 
 
77 aa  90.1  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11380  protein translocase subunit secG  50 
 
 
83 aa  89.7  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.500271  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20000  protein translocase subunit secG  69.62 
 
 
83 aa  89.4  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2928  preprotein translocase subunit SecG  56.25 
 
 
83 aa  80.5  0.000000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0434  preprotein translocase subunit SecG  51.28 
 
 
82 aa  80.5  0.000000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00104862  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2014  preprotein translocase subunit SecG  54.93 
 
 
79 aa  80.1  0.000000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.136616  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3953  preprotein translocase, SecG subunit  46.91 
 
 
82 aa  75.9  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1940  preprotein translocase, SecG subunit  60 
 
 
81 aa  72.4  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.30341  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2983  preprotein translocase SecG subunit  52.94 
 
 
80 aa  70.9  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.536026  normal  0.0158601 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2201  preprotein translocase, SecG subunit  56.16 
 
 
80 aa  68.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000169069  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0906  preprotein translocase, SecG subunit  57.5 
 
 
82 aa  68.6  0.00000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3007  preprotein translocase, SecG subunit  60.78 
 
 
78 aa  68.2  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0874625 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2533  protein translocase subunit secG  59.09 
 
 
76 aa  65.1  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1640  preprotein translocase subunit SecG  54.79 
 
 
76 aa  60.8  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476969  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3322  preprotein translocase, SecG subunit  58.33 
 
 
86 aa  58.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.363921  hitchhiker  0.00119755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5605  preprotein translocase, SecG subunit  52.94 
 
 
81 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.278961  normal  0.762128 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6035  protein translocase subunit secG  52.05 
 
 
76 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.977593  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3095  preprotein translocase, SecG subunit  57.53 
 
 
86 aa  58.2  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111238  normal  0.0631232 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2050  preprotein translocase, SecG subunit  46.3 
 
 
77 aa  55.5  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11468  preprotein translocase subunit SecG  40 
 
 
77 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000326275  normal  0.980006 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1753  preprotein translocase, SecG subunit  43.28 
 
 
84 aa  52.4  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000258746  normal  0.08391 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2447  preprotein translocase subunit SecG  43.94 
 
 
77 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2453  preprotein translocase subunit SecG  43.94 
 
 
77 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.628392 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2407  preprotein translocase subunit SecG  43.94 
 
 
77 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1121  preprotein translocase, SecG subunit  41.67 
 
 
75 aa  50.4  0.000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0046107 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15900  preprotein translocase subunit SecG  50 
 
 
76 aa  50.4  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.330495  normal  0.548909 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0921  preprotein translocase, SecG subunit  35.9 
 
 
83 aa  49.7  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.255471 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1831  preprotein translocase subunit SecG  50.62 
 
 
85 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000888635 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2090  preprotein translocase subunit SecG  49.38 
 
 
85 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.192234  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15230  protein translocase subunit secG  51.52 
 
 
99 aa  49.7  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0112894  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10170  protein translocase, SecG subunit  32.91 
 
 
84 aa  45.1  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000553201  hitchhiker  0.000000506561 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1990  preprotein translocase subunit SecG  54.72 
 
 
76 aa  45.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.372044  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2803  preprotein translocase, SecG subunit  45.83 
 
 
78 aa  45.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000076727  hitchhiker  0.00000696704 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2066  preprotein translocase subunit SecG  49.32 
 
 
76 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.517126  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07170  protein translocase, SecG subunit  37.88 
 
 
84 aa  42.7  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000216048  normal  0.678062 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0814  preprotein translocase, SecG subunit  42.03 
 
 
107 aa  42.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294174 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5280  preprotein translocase subunit SecG  39.68 
 
 
77 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000776832  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1052  preprotein translocase, SecG subunit  38.81 
 
 
114 aa  42  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5216  preprotein translocase subunit SecG  39.68 
 
 
77 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5234  preprotein translocase subunit SecG  39.68 
 
 
77 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0501312  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5336  preprotein translocase subunit SecG  39.68 
 
 
77 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0258454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4820  preprotein translocase subunit SecG  39.68 
 
 
77 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00111592  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4810  preprotein translocase subunit SecG  39.68 
 
 
77 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.114878  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4958  preprotein translocase subunit SecG  39.68 
 
 
77 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00170035  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0852  preprotein translocase, SecG subunit  39.34 
 
 
75 aa  41.6  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>