48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2317 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2317  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  509  1e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3624  hypothetical protein  48.52 
 
 		 288 aa  217  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.287398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1840  hypothetical protein  44.7 
 
 		 254 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0489  hypothetical protein  44.7 
 
 		 283 aa  156  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.170905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0629  hypothetical protein  44.24 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.898659 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2287  putative protease  33.76 
 
 		 281 aa  119  7e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.12246  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2425  LasA  34.93 
 
 		 290 aa  118  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.930714  normal  0.104179 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0636  hypothetical protein  31.15 
 
 		 280 aa  108  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.954622  normal  0.171978 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4063  hypothetical protein  31.44 
 
 		 280 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.867603  normal  0.860094 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0361  hypothetical protein  30.12 
 
 		 280 aa  104  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03447  LasA  34.84 
 
 		 264 aa  103  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6074  hypothetical protein  30.56 
 
 		 280 aa  102  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.586519 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2796  hypothetical protein  30.26 
 
 		 280 aa  102  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.882251  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2663  hypothetical protein  30.26 
 
 		 280 aa  102  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2746  hypothetical protein  29.82 
 
 		 280 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2134  hypothetical protein  29.82 
 
 		 280 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2772  hypothetical protein  29.82 
 
 		 280 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0553  hypothetical protein  30.47 
 
 		 281 aa  101  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1085  hypothetical protein  33.33 
 
 		 301 aa  97.8  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2994  hypothetical protein  32.42 
 
 		 261 aa  93.2  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2939  hypothetical protein  32.41 
 
 		 276 aa  90.5  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.306086 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0667  hypothetical protein  28.17 
 
 		 304 aa  90.1  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2872  hypothetical protein  30.25 
 
 		 269 aa  90.1  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.737038  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2382  hypothetical protein  28.17 
 
 		 304 aa  90.1  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0651  hypothetical protein  28.17 
 
 		 304 aa  90.1  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0172  hypothetical protein  28.17 
 
 		 304 aa  90.1  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2302  hypothetical protein  28.17 
 
 		 304 aa  90.1  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.998774  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2777  hypothetical protein  28.17 
 
 		 304 aa  90.1  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0830  hypothetical protein  28.17 
 
 		 304 aa  90.1  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1668  hypothetical protein  31.84 
 
 		 259 aa  89.4  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4409  hypothetical protein  29.14 
 
 		 308 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4039  hypothetical protein  29.14 
 
 		 308 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0341392  normal  0.412965 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6722  hypothetical protein  30.11 
 
 		 310 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0587678  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0540  hypothetical protein  26.92 
 
 		 312 aa  85.5  8e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1567  hypothetical protein  32.77 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.801283  normal  0.0222121 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40280  hypothetical protein  35.92 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.497545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0871  hypothetical protein  28.35 
 
 		 326 aa  82.8  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.105725 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3557  hypothetical protein  30.23 
 
 		 268 aa  82.4  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0958  hypothetical protein  31.47 
 
 		 280 aa  82.8  0.000000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00310371 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4132  hypothetical protein  32.64 
 
 		 280 aa  82  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.300024  hitchhiker  0.00562733 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3414  hypothetical protein  35.21 
 
 		 263 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4521  hypothetical protein  28.32 
 
 		 312 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.402167  normal  0.226498 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3960  hypothetical protein  32.43 
 
 		 278 aa  80.9  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6529  hypothetical protein  32.52 
 
 		 310 aa  79  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0442021  normal  0.054525 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0625  hypothetical protein  31.14 
 
 		 312 aa  78.6  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.349481  normal  0.521008 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2860  hypothetical protein  28.31 
 
 		 263 aa  72  0.000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0062  hypothetical protein  26.13 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2091  hypothetical protein  30.09 
 
 		 267 aa  50.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.506486  normal  0.797935 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>