49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4521 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_4521  hypothetical protein  100 
 
 
312 aa  596  1e-169  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.402167  normal  0.226498 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4409  hypothetical protein  95.1 
 
 
308 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4039  hypothetical protein  95.42 
 
 
308 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0341392  normal  0.412965 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0625  hypothetical protein  72.26 
 
 
312 aa  364  1e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.349481  normal  0.521008 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6722  hypothetical protein  68.2 
 
 
310 aa  363  1e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0587678  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6529  hypothetical protein  68.12 
 
 
310 aa  335  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0442021  normal  0.054525 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0871  hypothetical protein  44.24 
 
 
326 aa  237  2e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.105725 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2994  hypothetical protein  51.44 
 
 
261 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3557  hypothetical protein  46.79 
 
 
268 aa  220  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1668  hypothetical protein  49.28 
 
 
259 aa  219  6e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4063  hypothetical protein  45.36 
 
 
280 aa  217  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.867603  normal  0.860094 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0958  hypothetical protein  47.75 
 
 
280 aa  217  2e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00310371 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0361  hypothetical protein  44.4 
 
 
280 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0636  hypothetical protein  43.93 
 
 
280 aa  210  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.954622  normal  0.171978 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0553  hypothetical protein  41.72 
 
 
281 aa  209  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1085  hypothetical protein  42.14 
 
 
301 aa  208  1e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0172  hypothetical protein  43.32 
 
 
304 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2382  hypothetical protein  43.32 
 
 
304 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0667  hypothetical protein  43.32 
 
 
304 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0651  hypothetical protein  43.32 
 
 
304 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2302  hypothetical protein  43.32 
 
 
304 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.998774  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2777  hypothetical protein  43.32 
 
 
304 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0830  hypothetical protein  43.32 
 
 
304 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1567  hypothetical protein  45.32 
 
 
275 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.801283  normal  0.0222121 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0540  hypothetical protein  42.22 
 
 
312 aa  204  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03447  LasA  47.76 
 
 
264 aa  202  5e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2860  hypothetical protein  45.29 
 
 
263 aa  202  6e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0062  hypothetical protein  44.2 
 
 
265 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6074  hypothetical protein  41.24 
 
 
280 aa  200  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.586519 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2746  hypothetical protein  41.67 
 
 
280 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2772  hypothetical protein  41.67 
 
 
280 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2134  hypothetical protein  41.67 
 
 
280 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2796  hypothetical protein  41.67 
 
 
280 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.882251  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3414  hypothetical protein  44.2 
 
 
263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2663  hypothetical protein  41.67 
 
 
280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2425  LasA  40.07 
 
 
290 aa  195  8.000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.930714  normal  0.104179 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40280  hypothetical protein  43.84 
 
 
263 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.497545  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4132  hypothetical protein  43.88 
 
 
280 aa  192  7e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.300024  hitchhiker  0.00562733 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3960  hypothetical protein  46.38 
 
 
278 aa  189  5e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2287  putative protease  38.36 
 
 
281 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.12246  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2939  hypothetical protein  44.63 
 
 
276 aa  132  5e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.306086 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2872  hypothetical protein  38.01 
 
 
269 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.737038  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3624  hypothetical protein  29.93 
 
 
288 aa  95.5  9e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.287398  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2317  hypothetical protein  28.33 
 
 
258 aa  82.8  0.000000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1840  hypothetical protein  27.82 
 
 
254 aa  66.6  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0489  hypothetical protein  27.82 
 
 
283 aa  66.2  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.170905  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0629  hypothetical protein  28.57 
 
 
254 aa  59.3  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.898659 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3309  hypothetical protein  25 
 
 
277 aa  45.4  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.287596  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0529  hypothetical protein  25.61 
 
 
261 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>