49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4039 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4039  hypothetical protein  100 
 
 		 308 aa  594  1e-169  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0341392  normal  0.412965 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4409  hypothetical protein  99.68 
 
 		 308 aa  593  1e-169  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4521  hypothetical protein  95.42 
 
 		 312 aa  541  1e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.402167  normal  0.226498 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0625  hypothetical protein  70.74 
 
 		 312 aa  363  2e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.349481  normal  0.521008 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6722  hypothetical protein  66.03 
 
 		 310 aa  363  2e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0587678  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6529  hypothetical protein  67.75 
 
 		 310 aa  334  9e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0442021  normal  0.054525 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0871  hypothetical protein  43.93 
 
 		 326 aa  238  9e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.105725 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2994  hypothetical protein  50.72 
 
 		 261 aa  230  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4063  hypothetical protein  46.07 
 
 		 280 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.867603  normal  0.860094 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3557  hypothetical protein  47.43 
 
 		 268 aa  216  4e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0958  hypothetical protein  47.39 
 
 		 280 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00310371 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0636  hypothetical protein  45.71 
 
 		 280 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.954622  normal  0.171978 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0361  hypothetical protein  45.13 
 
 		 280 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1668  hypothetical protein  48.88 
 
 		 259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0553  hypothetical protein  42.76 
 
 		 281 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0667  hypothetical protein  44.3 
 
 		 304 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0172  hypothetical protein  44.3 
 
 		 304 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0830  hypothetical protein  44.3 
 
 		 304 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2382  hypothetical protein  44.3 
 
 		 304 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0651  hypothetical protein  44.3 
 
 		 304 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2302  hypothetical protein  44.3 
 
 		 304 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.998774  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2777  hypothetical protein  44.3 
 
 		 304 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1085  hypothetical protein  41.43 
 
 		 301 aa  208  1e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6074  hypothetical protein  42.61 
 
 		 280 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.586519 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2134  hypothetical protein  43.06 
 
 		 280 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2772  hypothetical protein  43.06 
 
 		 280 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2746  hypothetical protein  43.06 
 
 		 280 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2796  hypothetical protein  43.06 
 
 		 280 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.882251  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0540  hypothetical protein  42.22 
 
 		 312 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2663  hypothetical protein  43.06 
 
 		 280 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2860  hypothetical protein  45.65 
 
 		 263 aa  200  3e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1567  hypothetical protein  44.53 
 
 		 275 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.801283  normal  0.0222121 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0062  hypothetical protein  44.93 
 
 		 265 aa  199  7e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03447  LasA  47.17 
 
 		 264 aa  199  7e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2425  LasA  38.31 
 
 		 290 aa  193  4e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.930714  normal  0.104179 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3414  hypothetical protein  43.12 
 
 		 263 aa  192  6e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40280  hypothetical protein  42.75 
 
 		 263 aa  189  5e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.497545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4132  hypothetical protein  43.2 
 
 		 280 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.300024  hitchhiker  0.00562733 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3960  hypothetical protein  44.57 
 
 		 278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2287  putative protease  37.67 
 
 		 281 aa  179  4.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.12246  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2939  hypothetical protein  45.35 
 
 		 276 aa  133  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.306086 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2872  hypothetical protein  35.91 
 
 		 269 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.737038  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3624  hypothetical protein  30.69 
 
 		 288 aa  93.6  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.287398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2317  hypothetical protein  29.14 
 
 		 258 aa  87.8  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1840  hypothetical protein  29.22 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0489  hypothetical protein  29.22 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.170905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0629  hypothetical protein  30.67 
 
 		 254 aa  69.3  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.898659 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3309  hypothetical protein  24.39 
 
 		 277 aa  44.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.287596  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0529  hypothetical protein  23.93 
 
 		 261 aa  42.7  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>