47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4063 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4063  hypothetical protein  100 
 
 
280 aa  563  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.867603  normal  0.860094 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0636  hypothetical protein  93.93 
 
 
280 aa  533  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.954622  normal  0.171978 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0361  hypothetical protein  82.86 
 
 
280 aa  477  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0172  hypothetical protein  69.23 
 
 
304 aa  401  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0830  hypothetical protein  69.23 
 
 
304 aa  401  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2382  hypothetical protein  69.23 
 
 
304 aa  401  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0667  hypothetical protein  69.23 
 
 
304 aa  401  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0651  hypothetical protein  69.23 
 
 
304 aa  401  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2302  hypothetical protein  69.23 
 
 
304 aa  401  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.998774  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2777  hypothetical protein  69.23 
 
 
304 aa  401  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0540  hypothetical protein  67.75 
 
 
312 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2663  hypothetical protein  70.04 
 
 
280 aa  391  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2772  hypothetical protein  70.04 
 
 
280 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2746  hypothetical protein  70.04 
 
 
280 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6074  hypothetical protein  69.68 
 
 
280 aa  391  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.586519 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2796  hypothetical protein  70.4 
 
 
280 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.882251  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2134  hypothetical protein  70.04 
 
 
280 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0553  hypothetical protein  68.71 
 
 
281 aa  388  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3557  hypothetical protein  46.42 
 
 
268 aa  238  9e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2994  hypothetical protein  48.47 
 
 
261 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1668  hypothetical protein  46.79 
 
 
259 aa  224  1e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4409  hypothetical protein  46.43 
 
 
308 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4039  hypothetical protein  46.07 
 
 
308 aa  221  9e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0341392  normal  0.412965 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6722  hypothetical protein  43.64 
 
 
310 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0587678  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0062  hypothetical protein  44.53 
 
 
265 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4132  hypothetical protein  45.76 
 
 
280 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.300024  hitchhiker  0.00562733 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6529  hypothetical protein  43.96 
 
 
310 aa  211  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0442021  normal  0.054525 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3960  hypothetical protein  45 
 
 
278 aa  208  8e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4521  hypothetical protein  45.36 
 
 
312 aa  205  8e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.402167  normal  0.226498 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1085  hypothetical protein  42.91 
 
 
301 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40280  hypothetical protein  43.89 
 
 
263 aa  198  9e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.497545  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2287  putative protease  40.66 
 
 
281 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.12246  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3414  hypothetical protein  43.51 
 
 
263 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0625  hypothetical protein  44.04 
 
 
312 aa  195  7e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.349481  normal  0.521008 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2860  hypothetical protein  44.96 
 
 
263 aa  194  9e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2425  LasA  39.63 
 
 
290 aa  193  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.930714  normal  0.104179 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03447  LasA  45.42 
 
 
264 aa  188  8e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0958  hypothetical protein  42.8 
 
 
280 aa  181  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00310371 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0871  hypothetical protein  37.29 
 
 
326 aa  179  4.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.105725 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1567  hypothetical protein  35 
 
 
275 aa  170  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.801283  normal  0.0222121 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2872  hypothetical protein  36.36 
 
 
269 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.737038  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2317  hypothetical protein  31.44 
 
 
258 aa  108  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3624  hypothetical protein  29.1 
 
 
288 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.287398  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2939  hypothetical protein  32.28 
 
 
276 aa  99.4  6e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.306086 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1840  hypothetical protein  26.45 
 
 
254 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0489  hypothetical protein  26.45 
 
 
283 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.170905  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0629  hypothetical protein  24.29 
 
 
254 aa  71.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.898659 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>