47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1085 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1085  hypothetical protein  100 
 
 		 301 aa  603  9.999999999999999e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2994  hypothetical protein  45.38 
 
 		 261 aa  212  7e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1668  hypothetical protein  45.95 
 
 		 259 aa  211  7.999999999999999e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6722  hypothetical protein  41.55 
 
 		 310 aa  209  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0587678  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4409  hypothetical protein  41.43 
 
 		 308 aa  207  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4039  hypothetical protein  41.43 
 
 		 308 aa  208  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0341392  normal  0.412965 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6529  hypothetical protein  44.15 
 
 		 310 aa  205  6e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0442021  normal  0.054525 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0636  hypothetical protein  44.03 
 
 		 280 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.954622  normal  0.171978 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3960  hypothetical protein  47.51 
 
 		 278 aa  202  4e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40280  hypothetical protein  45.25 
 
 		 263 aa  202  5e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.497545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3414  hypothetical protein  45.42 
 
 		 263 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4063  hypothetical protein  42.91 
 
 		 280 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.867603  normal  0.860094 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2425  LasA  42.34 
 
 		 290 aa  198  1.0000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.930714  normal  0.104179 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0553  hypothetical protein  40.14 
 
 		 281 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0871  hypothetical protein  38.62 
 
 		 326 aa  197  1.0000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.105725 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2772  hypothetical protein  40 
 
 		 280 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2746  hypothetical protein  40 
 
 		 280 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2134  hypothetical protein  40 
 
 		 280 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4521  hypothetical protein  42.14 
 
 		 312 aa  194  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.402167  normal  0.226498 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6074  hypothetical protein  39.63 
 
 		 280 aa  193  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.586519 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0361  hypothetical protein  41.04 
 
 		 280 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2796  hypothetical protein  39.26 
 
 		 280 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.882251  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2663  hypothetical protein  39.26 
 
 		 280 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0062  hypothetical protein  40.38 
 
 		 265 aa  187  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0625  hypothetical protein  42.38 
 
 		 312 aa  186  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.349481  normal  0.521008 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0958  hypothetical protein  38.52 
 
 		 280 aa  185  8e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00310371 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2860  hypothetical protein  42.19 
 
 		 263 aa  181  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2287  putative protease  38.24 
 
 		 281 aa  179  5.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.12246  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3557  hypothetical protein  39.85 
 
 		 268 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03447  LasA  42.19 
 
 		 264 aa  178  8e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1567  hypothetical protein  39.19 
 
 		 275 aa  178  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.801283  normal  0.0222121 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0540  hypothetical protein  36.15 
 
 		 312 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0172  hypothetical protein  37.63 
 
 		 304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0830  hypothetical protein  37.63 
 
 		 304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2777  hypothetical protein  37.63 
 
 		 304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2302  hypothetical protein  37.63 
 
 		 304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.998774  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0651  hypothetical protein  37.63 
 
 		 304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0667  hypothetical protein  37.63 
 
 		 304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2382  hypothetical protein  37.63 
 
 		 304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4132  hypothetical protein  38.25 
 
 		 280 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.300024  hitchhiker  0.00562733 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2872  hypothetical protein  40.72 
 
 		 269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.737038  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2939  hypothetical protein  34.91 
 
 		 276 aa  122  6e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.306086 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3624  hypothetical protein  32.85 
 
 		 288 aa  103  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.287398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2317  hypothetical protein  33.33 
 
 		 258 aa  97.8  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0629  hypothetical protein  27.02 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.898659 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0489  hypothetical protein  25.29 
 
 		 283 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.170905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1840  hypothetical protein  25.29 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>