47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0625 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0625  hypothetical protein  100 
 
 
312 aa  597  1e-170  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.349481  normal  0.521008 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4039  hypothetical protein  70.74 
 
 
308 aa  404  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0341392  normal  0.412965 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4409  hypothetical protein  70.42 
 
 
308 aa  404  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4521  hypothetical protein  72.26 
 
 
312 aa  388  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.402167  normal  0.226498 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6722  hypothetical protein  65.79 
 
 
310 aa  354  8.999999999999999e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0587678  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6529  hypothetical protein  66.3 
 
 
310 aa  335  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0442021  normal  0.054525 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0871  hypothetical protein  45 
 
 
326 aa  236  4e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.105725 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0958  hypothetical protein  50.71 
 
 
280 aa  225  9e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00310371 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4063  hypothetical protein  45.14 
 
 
280 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.867603  normal  0.860094 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0636  hypothetical protein  43.58 
 
 
280 aa  223  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.954622  normal  0.171978 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2994  hypothetical protein  47.33 
 
 
261 aa  218  8.999999999999998e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0361  hypothetical protein  42.57 
 
 
280 aa  215  7e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1668  hypothetical protein  48.23 
 
 
259 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3557  hypothetical protein  44.06 
 
 
268 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1085  hypothetical protein  41.75 
 
 
301 aa  211  2e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2134  hypothetical protein  41.46 
 
 
280 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2772  hypothetical protein  41.46 
 
 
280 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2746  hypothetical protein  41.46 
 
 
280 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2796  hypothetical protein  40.77 
 
 
280 aa  206  5e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.882251  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2663  hypothetical protein  40.77 
 
 
280 aa  205  7e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0651  hypothetical protein  41.14 
 
 
304 aa  205  8e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2382  hypothetical protein  41.14 
 
 
304 aa  205  8e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0667  hypothetical protein  41.14 
 
 
304 aa  205  8e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0172  hypothetical protein  41.14 
 
 
304 aa  205  8e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0830  hypothetical protein  41.14 
 
 
304 aa  205  8e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2302  hypothetical protein  41.14 
 
 
304 aa  205  8e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.998774  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2777  hypothetical protein  41.14 
 
 
304 aa  205  8e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6074  hypothetical protein  40.77 
 
 
280 aa  204  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.586519 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0553  hypothetical protein  40.97 
 
 
281 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0540  hypothetical protein  39.41 
 
 
312 aa  200  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1567  hypothetical protein  43.57 
 
 
275 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.801283  normal  0.0222121 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2860  hypothetical protein  45.76 
 
 
263 aa  196  3e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0062  hypothetical protein  43.26 
 
 
265 aa  192  5e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4132  hypothetical protein  45.49 
 
 
280 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.300024  hitchhiker  0.00562733 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03447  LasA  44.65 
 
 
264 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3960  hypothetical protein  46.29 
 
 
278 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40280  hypothetical protein  43.06 
 
 
263 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.497545  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3414  hypothetical protein  42.7 
 
 
263 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2425  LasA  37.87 
 
 
290 aa  181  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.930714  normal  0.104179 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2287  putative protease  36.61 
 
 
281 aa  169  7e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.12246  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2939  hypothetical protein  40.45 
 
 
276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.306086 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2872  hypothetical protein  37.3 
 
 
269 aa  107  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.737038  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3624  hypothetical protein  35.8 
 
 
288 aa  93.6  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.287398  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2317  hypothetical protein  29.43 
 
 
258 aa  80.5  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0489  hypothetical protein  26.42 
 
 
283 aa  63.9  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.170905  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1840  hypothetical protein  26.42 
 
 
254 aa  64.3  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0629  hypothetical protein  26.83 
 
 
254 aa  60.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.898659 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>