25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2091 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2091  hypothetical protein  100 
 
 
267 aa  545  1e-154  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.506486  normal  0.797935 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2633  hypothetical protein  31.69 
 
 
270 aa  71.2  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3624  hypothetical protein  26.67 
 
 
288 aa  53.1  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.287398  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2317  hypothetical protein  29.41 
 
 
258 aa  51.6  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2425  LasA  26.44 
 
 
290 aa  50.4  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.930714  normal  0.104179 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2663  hypothetical protein  24.03 
 
 
280 aa  49.3  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2796  hypothetical protein  24.03 
 
 
280 aa  49.3  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.882251  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6074  hypothetical protein  34.48 
 
 
280 aa  46.6  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.586519 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2134  hypothetical protein  34.48 
 
 
280 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2746  hypothetical protein  34.48 
 
 
280 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2772  hypothetical protein  34.48 
 
 
280 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0553  hypothetical protein  24.42 
 
 
281 aa  46.2  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0842  hypothetical protein  25.15 
 
 
220 aa  45.4  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9665e-36 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0529  hypothetical protein  27.38 
 
 
261 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0651  hypothetical protein  34.48 
 
 
304 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2382  hypothetical protein  34.48 
 
 
304 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0667  hypothetical protein  34.48 
 
 
304 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0172  hypothetical protein  34.48 
 
 
304 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2302  hypothetical protein  34.48 
 
 
304 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.998774  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2777  hypothetical protein  34.48 
 
 
304 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0830  hypothetical protein  34.48 
 
 
304 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0540  hypothetical protein  34.48 
 
 
312 aa  43.1  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03447  LasA  36.84 
 
 
264 aa  43.1  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1164  hypothetical protein  27.45 
 
 
213 aa  42.7  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000515055  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2086  hypothetical protein  23.42 
 
 
260 aa  42.4  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.353027  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>