More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1857 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_1857  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 
466 aa  942    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0473556  normal  0.430164 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0127  glutathione-disulfide reductase  48.56 
 
 
448 aa  400  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2534  NADPH-glutathione reductase  48.22 
 
 
451 aa  395  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.23107 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2174  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  45.45 
 
 
457 aa  389  1e-107  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2516  glutathione-disulfide reductase  46.02 
 
 
446 aa  365  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0140  glutathione reductase  43.33 
 
 
456 aa  363  4e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01560  glutathione-disulfide reductase, putative  44.95 
 
 
479 aa  359  5e-98  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3543  glutathione reductase  43.49 
 
 
451 aa  356  5.999999999999999e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3660  glutathione reductase  42.6 
 
 
451 aa  355  1e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.150077  normal  0.767021 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0366  glutathione reductase  47.01 
 
 
449 aa  350  3e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.736055  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0536  glutathione-disulfide reductase  47.01 
 
 
449 aa  350  3e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00586443  unclonable  0.0000000000392976 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2004  glutathione reductase  43.36 
 
 
451 aa  345  8.999999999999999e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0977143 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0142  glutathione reductase  42.83 
 
 
451 aa  345  1e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35819  glutathione reductase  43.17 
 
 
496 aa  343  2.9999999999999997e-93  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3845  glutathione reductase  42.16 
 
 
451 aa  342  8e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3938  glutathione reductase  42.16 
 
 
451 aa  342  1e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4702  glutathione reductase  41.94 
 
 
451 aa  341  2e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0121  glutathione reductase  42.6 
 
 
451 aa  341  2e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4054  glutathione reductase  42.16 
 
 
451 aa  341  2e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0120  glutathione reductase  44.03 
 
 
451 aa  340  2.9999999999999998e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1375  glutathione reductase  42.04 
 
 
449 aa  340  2.9999999999999998e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.013918  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1693  glutathione reductase  43.49 
 
 
451 aa  340  4e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03497  glutathione reductase  42.92 
 
 
449 aa  340  4e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4714  glutathione reductase  43.17 
 
 
450 aa  340  4e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4206  glutathione-disulfide reductase  44.15 
 
 
449 aa  340  5e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.486383  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0084  glutathione reductase  42.6 
 
 
451 aa  339  5.9999999999999996e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4984  glutathione reductase  43.01 
 
 
454 aa  338  8e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4068  glutathione reductase  42.16 
 
 
451 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0507  glutathione-disulfide reductase  43.08 
 
 
452 aa  336  3.9999999999999995e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.243892  normal  0.086285 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4471  glutathione reductase  43.81 
 
 
450 aa  336  5e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108339  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4395  glutathione reductase  42.29 
 
 
452 aa  336  5e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0630  glutathione reductase  41.46 
 
 
452 aa  336  5.999999999999999e-91  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4049  glutathione reductase  43.81 
 
 
450 aa  335  7e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1106  glutathione reductase  43.33 
 
 
456 aa  336  7e-91  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4186  glutathione reductase  43.58 
 
 
450 aa  335  1e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4220  glutathione reductase  42.07 
 
 
452 aa  335  1e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0121  glutathione reductase  42.07 
 
 
451 aa  335  1e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.848122  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2396  glutathione-disulfide reductase  46.36 
 
 
453 aa  335  1e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2568  glutathione reductase  43.36 
 
 
451 aa  334  2e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0614  glutathione reductase  41.24 
 
 
452 aa  334  2e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2356  glutathione-disulfide reductase  44.37 
 
 
465 aa  334  2e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4084  glutathione reductase  43.58 
 
 
450 aa  333  3e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.451157 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0114  glutathione reductase  43.58 
 
 
450 aa  333  3e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4259  glutathione reductase  42.07 
 
 
452 aa  333  4e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3877  glutathione reductase  41.63 
 
 
451 aa  332  6e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0014  glutathione reductase  43.58 
 
 
450 aa  332  7.000000000000001e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6145  glutathione-disulfide reductase  43.05 
 
 
449 aa  332  1e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03349  glutathione reductase  43.64 
 
 
450 aa  330  2e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.470564  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0215  glutathione-disulfide reductase  43.64 
 
 
450 aa  331  2e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0216  glutathione reductase  43.86 
 
 
450 aa  331  2e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.96555 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3789  glutathione reductase  44.08 
 
 
450 aa  331  2e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.459077 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03302  hypothetical protein  43.64 
 
 
450 aa  330  2e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.60445  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3700  glutathione reductase  43.86 
 
 
450 aa  331  2e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3982  glutathione reductase  43.64 
 
 
450 aa  330  2e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00523  glutathione reductase  42.79 
 
 
464 aa  331  2e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3911  glutathione reductase  43.86 
 
 
450 aa  331  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.239209  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3972  glutathione reductase  43.86 
 
 
450 aa  331  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3822  glutathione reductase  43.64 
 
 
450 aa  331  2e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3869  glutathione reductase  43.86 
 
 
450 aa  330  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3803  glutathione reductase  43.64 
 
 
450 aa  330  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001954  glutathione reductase  42.48 
 
 
451 aa  330  3e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3791  glutathione reductase  43.64 
 
 
450 aa  330  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.020575  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1966  glutathione reductase  41.59 
 
 
451 aa  330  4e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4847  glutathione reductase  43.86 
 
 
450 aa  330  4e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.652539 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0013  glutathione reductase  43.3 
 
 
450 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.607831  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6438  glutathione-disulfide reductase  42.6 
 
 
449 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.515437 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3592  glutathione reductase  40.84 
 
 
452 aa  324  2e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0447  glutathione reductase  41.72 
 
 
450 aa  324  2e-87  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.026364  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2883  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  41.56 
 
 
452 aa  322  9.000000000000001e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3913  glutathione reductase  42.76 
 
 
450 aa  313  2.9999999999999996e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00932  hypothetical glutathione reductase (Eurofung)  41.99 
 
 
557 aa  308  2.0000000000000002e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0509896 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_42900  glutathione reductase  37.65 
 
 
489 aa  304  3.0000000000000004e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.113846 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1095  glutathione-disulfide reductase  40.09 
 
 
460 aa  302  7.000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.223789  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2363  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.45 
 
 
457 aa  293  3e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.651152  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0643  NADPH-glutathione reductase  37.97 
 
 
459 aa  291  2e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3819  glutathione reductase  40.4 
 
 
451 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218299  normal  0.718715 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2244  glutathione reductase  37.69 
 
 
458 aa  290  5.0000000000000004e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1950  glutathione reductase  40.18 
 
 
451 aa  285  9e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.447652  normal  0.37845 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3535  glutathione reductase  39.73 
 
 
451 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0669246 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49167  glutathione-disulfide reductase  39.74 
 
 
507 aa  285  1.0000000000000001e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0842  glutathione reductase  39.64 
 
 
446 aa  285  1.0000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.118007 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4780  glutathione-disulfide reductase  40.18 
 
 
466 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.325962  normal  0.417103 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1608  glutathione reductase  37.39 
 
 
452 aa  283  5.000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.128494  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1851  glutathione reductase  38.89 
 
 
449 aa  282  8.000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.893411 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4955  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.29 
 
 
452 aa  282  9e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201124  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1957  NADPH-glutathione reductase  39.15 
 
 
451 aa  281  2e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.168279 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4747  glutathione reductase  38.84 
 
 
447 aa  281  2e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0317  glutathione-disulfide reductase  37.61 
 
 
453 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0303  glutathione-disulfide reductase  37.61 
 
 
453 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3362  glutathione-disulfide reductase  37.61 
 
 
453 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0498  glutathione-disulfide reductase  37.61 
 
 
453 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2063  glutathione-disulfide reductase  37.61 
 
 
453 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3188  glutathione reductase  39.29 
 
 
451 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2222  glutathione-disulfide reductase  37.61 
 
 
453 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.363669  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3030  glutathione-disulfide reductase  37.61 
 
 
453 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.944241  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2002  glutathione-disulfide reductase  39.69 
 
 
452 aa  278  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0884  glutathione-disulfide reductase  39.42 
 
 
452 aa  278  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.508454 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0434  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.12 
 
 
466 aa  277  3e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.531083  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1810  NADPH-glutathione reductase  38.41 
 
 
453 aa  276  7e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.251452  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0358  NADPH-glutathione reductase  39.69 
 
 
452 aa  275  8e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>