158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_2003 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2003  ferritin  100 
 
 
195 aa  400  1e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1579  ferritin  65.97 
 
 
194 aa  268  5e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.605912  normal  0.0212795 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17691  ferritin  59.14 
 
 
192 aa  229  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.932316 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09561  ferritin  57.39 
 
 
183 aa  219  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.134957  hitchhiker  0.000171994 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08441  ferritin  52.46 
 
 
183 aa  204  7e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.786758  hitchhiker  0.00432039 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0212  ferritin  51.91 
 
 
183 aa  203  1e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.793431  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08681  ferritin  52.87 
 
 
184 aa  196  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08651  ferritin  53.53 
 
 
184 aa  195  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00188359  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0812  ferritin  53.29 
 
 
184 aa  192  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0258851  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07771  ferritin  51.79 
 
 
184 aa  189  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17741  Ferritin  34.93 
 
 
177 aa  105  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.970261 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0668  Ferritin, Dps family protein  31.61 
 
 
173 aa  89.7  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000253889  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3808  Ferroxidase  30.57 
 
 
166 aa  89  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.057799  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1381  ferroxidase  28.03 
 
 
162 aa  86.3  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000220076  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0118  Ferritin, Dps family protein  30.41 
 
 
172 aa  84.7  7e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.38357  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1855  ferroxidase  29.94 
 
 
167 aa  84.3  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.185397  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0328  ferroxidase  26.95 
 
 
170 aa  84.3  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.962185  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3287  ferroxidase  28.66 
 
 
167 aa  83.6  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4070  Ferroxidase  27.27 
 
 
163 aa  82.4  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000582999  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1983  Ferritin Dps family protein  29.52 
 
 
172 aa  80.1  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0282013  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1580  Ferroxidase  27.04 
 
 
161 aa  80.5  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2418  Ferritin Dps family protein  28.85 
 
 
165 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.47265 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1417  Ferritin, Dps family protein  31.21 
 
 
477 aa  79.3  0.00000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.672338  normal  0.285216 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0514  Ferroxidase  28.3 
 
 
171 aa  78.6  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0298672  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1791  ferritin  32.52 
 
 
186 aa  78.2  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000512633  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0428  Ferritin, Dps family protein  26.92 
 
 
175 aa  78.2  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0183  Ferroxidase  27.39 
 
 
171 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000415099 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2519  Ferritin Dps family protein  28.66 
 
 
172 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00323772  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1617  ferroxidase  28.22 
 
 
163 aa  77.4  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0879  Ferroxidase  27.81 
 
 
171 aa  77.4  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000223127  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2778  Ferritin and Dps  30.38 
 
 
168 aa  77  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0794  Ferritin, Dps family protein  29.3 
 
 
162 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.413552  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0136  ferroxidase  25.32 
 
 
163 aa  77  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1683  ferroxidase  28.22 
 
 
163 aa  76.6  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1199  ferroxidase  27.71 
 
 
169 aa  76.3  0.0000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0733743  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1700  Ferroxidase  28.66 
 
 
172 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000548628 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0556  Ferroxidase  27.39 
 
 
164 aa  75.1  0.0000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.729145 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1236  ferritin family protein  27.71 
 
 
170 aa  75.1  0.0000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000720561  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1307  ferritin  29.53 
 
 
173 aa  74.7  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.757359  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2466  Ferroxidase  28.03 
 
 
168 aa  74.3  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00000323257  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1047  ferritin family protein  27.71 
 
 
170 aa  73.9  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000219081  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1512  Ferritin Dps family protein  25.64 
 
 
175 aa  74.3  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1120  Ferritin and Dps  27.39 
 
 
176 aa  73.2  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1570  Ferritin Dps family protein  28.15 
 
 
170 aa  72.8  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2555  cytoplasmic ferritin (an iron storage protein)  27.88 
 
 
174 aa  71.2  0.000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000856866  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1965  Ferritin, Dps family protein  27.67 
 
 
177 aa  71.2  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0407  Ferritin Dps family protein  24.5 
 
 
175 aa  70.9  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.179307  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0596  Ferritin, Dps family protein  26.11 
 
 
164 aa  69.7  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0479  Ferritin Dps family protein  24.83 
 
 
168 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.918864  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0449  ferritin, putative  27.74 
 
 
160 aa  69.3  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000133256  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1565  Ferritin, Dps family protein  27.01 
 
 
169 aa  68.6  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.464439  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0617  Ferritin Dps family protein  27.39 
 
 
165 aa  68.2  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.433385 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30880  ferritin-like protein  27.95 
 
 
173 aa  67.4  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2683  Ferritin Dps family protein  24.39 
 
 
168 aa  67.4  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000192038  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2260  Ferritin Dps family protein  27.52 
 
 
170 aa  65.9  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739627  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2915  Ferritin Dps family protein  26.35 
 
 
172 aa  65.5  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0133  Ferritin, Dps family protein  26.8 
 
 
178 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416166 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0127  Ferritin, Dps family protein  26.8 
 
 
178 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0132  Ferritin, Dps family protein  26.8 
 
 
178 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0123196 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2910  ferroxidase  25.5 
 
 
171 aa  64.7  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00246323  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0866  ferroxidase  22.64 
 
 
172 aa  63.9  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761126  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0573  Ferritin Dps family protein  25.48 
 
 
171 aa  64.3  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0043  Ferritin Dps family protein  26.11 
 
 
171 aa  63.2  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2947  ferritin-1  26.11 
 
 
175 aa  63.2  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0940  Ferritin Dps family protein  26.11 
 
 
162 aa  63.5  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0847106  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15640  ferritin-like protein  25.32 
 
 
172 aa  63.5  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00614251  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4783  ferritin  26.15 
 
 
168 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31249  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0016  Ferritin and Dps  24.18 
 
 
159 aa  62.8  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0129  ferroxidase  25.16 
 
 
175 aa  62.8  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3795  Ferritin Dps family protein  26.67 
 
 
164 aa  63.2  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01880  ferritin-like protein  23.65 
 
 
171 aa  62.8  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0139  ferritin  26.14 
 
 
178 aa  62  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0136  Ferroxidase  26.14 
 
 
178 aa  62  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1703  Ferroxidase  23.18 
 
 
164 aa  62.4  0.000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.428586  hitchhiker  0.0000000000044787 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4222  ferroxidase  26.14 
 
 
178 aa  62  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0301  Ferritin Dps family protein  28 
 
 
171 aa  62  0.000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.384105 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0132  ferroxidase  26.14 
 
 
178 aa  62  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0137  ferroxidase  26.14 
 
 
178 aa  62  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0042  Ferritin, Dps family protein  24.24 
 
 
174 aa  61.6  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.97905  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5211  ferritin  26.45 
 
 
168 aa  61.2  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000025071  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0132  Ferritin, Dps family protein  25.73 
 
 
178 aa  61.2  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1431  ferritin family protein  26.75 
 
 
166 aa  61.2  0.000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.858938  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1697  Ferritin, Dps family protein  25 
 
 
173 aa  61.2  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000265061  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1860  Ferritin Dps family protein  25.48 
 
 
164 aa  61.2  0.000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00316362  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0044  Ferritin and Dps  28.14 
 
 
175 aa  60.1  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.311572 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0308  ferritin  23.29 
 
 
162 aa  60.1  0.00000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.25083  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0804  ferritin  24.03 
 
 
164 aa  60.1  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001945  ferritin-like protein 2  24.53 
 
 
175 aa  60.1  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5196  ferritin  25 
 
 
168 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00124859  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4919  ferritin  25 
 
 
168 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4764  ferritin  25 
 
 
168 aa  59.7  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000763521  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5296  ferritin  25 
 
 
168 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123556  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0046  ferritin  25 
 
 
168 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000030835  hitchhiker  1.9165399999999998e-20 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5164  ferritin  25 
 
 
168 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.57868e-47 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5201  ferritin  25 
 
 
168 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000941544  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1942  ferroxidase  26.75 
 
 
172 aa  59.7  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295968 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4880  Ferritin Dps family protein  25 
 
 
168 aa  59.3  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00199979  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2222  Ferritin Dps family protein  23.57 
 
 
176 aa  59.3  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000624545  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0141  ferritin  23.57 
 
 
175 aa  58.9  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2438  ferroxidase  24.2 
 
 
169 aa  58.9  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>