48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1001 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1001  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  326  1.0000000000000001e-88  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.379029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0906  hypothetical protein  90.12 
 
 		 163 aa  299  1e-80  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0209666  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18271  hypothetical protein  77.12 
 
 		 156 aa  255  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.146013 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0819  hypothetical protein  69.62 
 
 		 160 aa  230  6e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.490622  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16701  hypothetical protein  65.82 
 
 		 162 aa  221  4e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15561  hypothetical protein  63.75 
 
 		 161 aa  207  6e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00215073  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15711  hypothetical protein  63.12 
 
 		 161 aa  205  2e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.627984  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14221  hypothetical protein  62.66 
 
 		 158 aa  202  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045747 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15341  hypothetical protein  59.38 
 
 		 161 aa  201  4e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1658  hypothetical protein  63.09 
 
 		 152 aa  199  9.999999999999999e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.962451 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1465  hypothetical protein  64.43 
 
 		 161 aa  196  9e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00433461  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_86791  predicted protein  44.14 
 
 		 183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63840  hypothetical protein  41.5 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.530683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5547  hypothetical protein  40.56 
 
 		 151 aa  100  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_7235  predicted protein  37.84 
 
 		 153 aa  95.9  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0728  membrane protein-like protein  41.1 
 
 		 151 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0742  putative transmembrane protein  37.25 
 
 		 150 aa  87.8  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152888  normal  0.552808 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0795  hypothetical protein  34.42 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1252  hypothetical protein  34.21 
 
 		 180 aa  76.3  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.380543  normal  0.0148003 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0458  putative transmembrane protein  35.14 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3410  hypothetical protein  32.19 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0778209 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1243  hypothetical protein  31.47 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.563341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0412  putative transmembrane protein  33.77 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0341  putative transmembrane protein  31.79 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1759  hypothetical protein  34.46 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0330  putative transmembrane protein  31.13 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0812  hypothetical protein  38.56 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353127  normal  0.980165 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2809  hypothetical protein  33.78 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0363655  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2436  hypothetical protein  33.78 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.190819  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2844  hypothetical protein  33.78 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.715344  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0848  transmembrane protein  30.41 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2868  hypothetical protein  33.78 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.665694  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2749  hypothetical protein  31.76 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.194759  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0570  hypothetical protein  32.88 
 
 		 254 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0829  hypothetical protein  25.68 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.018742  normal  0.139665 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0863  membrane protein-like protein  29.17 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.534912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1247  hypothetical protein  35.78 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2876  hypothetical protein  28.57 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218241  normal  0.0209609 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0683  membrane protein-like  27.03 
 
 		 154 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1911  hypothetical protein  31.72 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00157166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1162  membrane protein-like protein  27.03 
 
 		 154 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1138  membrane protein-like protein  27.03 
 
 		 154 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4274  membrane protein-like  25.68 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.634529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0668  putative transmembrane protein  32.91 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796642 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1044  membrane protein-like protein  25.86 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.610119 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1040  membrane protein-like protein  25.34 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2143  membrane protein-like protein  26.03 
 
 		 154 aa  43.9  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1983  hypothetical protein  34.25 
 
 		 144 aa  43.9  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>