48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5547 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5547  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  284  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63840  hypothetical protein  94.04 
 
 
151 aa  250  5.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.530683  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0728  membrane protein-like protein  64.24 
 
 
151 aa  161  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1658  hypothetical protein  42 
 
 
152 aa  124  5e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.962451 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18271  hypothetical protein  42.66 
 
 
156 aa  116  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.146013 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1001  hypothetical protein  40.56 
 
 
163 aa  114  5e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.379029  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0906  hypothetical protein  42.66 
 
 
163 aa  113  6.9999999999999995e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0209666  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0742  putative transmembrane protein  42.86 
 
 
150 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152888  normal  0.552808 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14221  hypothetical protein  39.46 
 
 
158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0045747 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1465  hypothetical protein  38.1 
 
 
161 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00433461  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3410  hypothetical protein  43.66 
 
 
149 aa  105  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0778209 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15341  hypothetical protein  36.05 
 
 
161 aa  104  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0829  hypothetical protein  41.06 
 
 
151 aa  104  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.018742  normal  0.139665 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15561  hypothetical protein  38.1 
 
 
161 aa  104  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00215073  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0848  transmembrane protein  40.67 
 
 
151 aa  104  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15711  hypothetical protein  38.1 
 
 
161 aa  103  6e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.627984  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0795  hypothetical protein  44.59 
 
 
150 aa  102  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0819  hypothetical protein  36.24 
 
 
160 aa  99.4  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.490622  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0458  putative transmembrane protein  39.86 
 
 
150 aa  97.8  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16701  hypothetical protein  35.33 
 
 
162 aa  98.2  4e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0412  putative transmembrane protein  44.37 
 
 
162 aa  96.7  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0812  hypothetical protein  40.14 
 
 
150 aa  88.6  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353127  normal  0.980165 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0341  putative transmembrane protein  39.33 
 
 
151 aa  87.4  6e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0330  putative transmembrane protein  39.07 
 
 
151 aa  86.7  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_86791  predicted protein  35.14 
 
 
183 aa  84  7e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1252  hypothetical protein  38.36 
 
 
180 aa  79.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.380543  normal  0.0148003 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1243  hypothetical protein  33.1 
 
 
149 aa  74.7  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.563341  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0668  putative transmembrane protein  38.4 
 
 
148 aa  70.1  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.796642 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_7235  predicted protein  31.58 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2876  hypothetical protein  36.52 
 
 
154 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218241  normal  0.0209609 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1247  hypothetical protein  33.63 
 
 
154 aa  62  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0863  membrane protein-like protein  36.29 
 
 
152 aa  62  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.534912  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0683  membrane protein-like  34.87 
 
 
154 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1162  membrane protein-like protein  34.87 
 
 
154 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2809  hypothetical protein  31.97 
 
 
153 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0363655  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2844  hypothetical protein  31.97 
 
 
153 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.715344  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1759  hypothetical protein  32.89 
 
 
153 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2868  hypothetical protein  31.97 
 
 
153 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.665694  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2436  hypothetical protein  31.97 
 
 
153 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.190819  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2749  hypothetical protein  31.97 
 
 
153 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.194759  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1040  membrane protein-like protein  35.17 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1138  membrane protein-like protein  34.87 
 
 
154 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0570  hypothetical protein  31.72 
 
 
254 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4274  membrane protein-like  34.23 
 
 
154 aa  57  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.634529  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1044  membrane protein-like protein  34.48 
 
 
156 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.610119 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1983  hypothetical protein  40.27 
 
 
144 aa  54.7  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1911  hypothetical protein  40.68 
 
 
151 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00157166  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2143  membrane protein-like protein  31.54 
 
 
154 aa  47.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>