48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0829 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0829  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  302  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.018742  normal  0.139665 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0848  transmembrane protein  85.23 
 
 		 151 aa  256  7e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0795  hypothetical protein  62 
 
 		 150 aa  192  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0742  putative transmembrane protein  56.67 
 
 		 150 aa  185  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152888  normal  0.552808 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0812  hypothetical protein  57.33 
 
 		 150 aa  170  6.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353127  normal  0.980165 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0412  putative transmembrane protein  46.62 
 
 		 162 aa  130  5e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0330  putative transmembrane protein  43.33 
 
 		 151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0341  putative transmembrane protein  43.33 
 
 		 151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0458  putative transmembrane protein  39.33 
 
 		 150 aa  117  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1252  hypothetical protein  38 
 
 		 180 aa  107  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.380543  normal  0.0148003 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1243  hypothetical protein  38.93 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.563341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0668  putative transmembrane protein  39.6 
 
 		 148 aa  105  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796642 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63840  hypothetical protein  41.72 
 
 		 151 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.530683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5547  hypothetical protein  41.33 
 
 		 151 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1658  hypothetical protein  35.71 
 
 		 152 aa  92.8  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.962451 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0728  membrane protein-like protein  36.29 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2876  hypothetical protein  33.77 
 
 		 154 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218241  normal  0.0209609 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15341  hypothetical protein  30.87 
 
 		 161 aa  79.7  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1465  hypothetical protein  30.87 
 
 		 161 aa  79.7  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00433461  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15561  hypothetical protein  30.87 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00215073  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14221  hypothetical protein  32.03 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045747 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15711  hypothetical protein  30.87 
 
 		 161 aa  77.4  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.627984  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1247  hypothetical protein  33.11 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_7235  predicted protein  28.38 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18271  hypothetical protein  27.92 
 
 		 156 aa  72  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.146013 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3410  hypothetical protein  30.14 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0778209 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16701  hypothetical protein  27.74 
 
 		 162 aa  67.4  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1162  membrane protein-like protein  34.39 
 
 		 154 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0683  membrane protein-like  34.39 
 
 		 154 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1138  membrane protein-like protein  34.39 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0819  hypothetical protein  27.63 
 
 		 160 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.490622  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1001  hypothetical protein  25.68 
 
 		 163 aa  63.5  0.0000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.379029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1759  hypothetical protein  35.45 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0863  membrane protein-like protein  29.61 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.534912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2809  hypothetical protein  34.26 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0363655  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2749  hypothetical protein  34.26 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.194759  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2844  hypothetical protein  34.26 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.715344  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2436  hypothetical protein  34.26 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.190819  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2868  hypothetical protein  34.26 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.665694  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_86791  predicted protein  27.03 
 
 		 183 aa  60.1  0.000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0906  hypothetical protein  25.49 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0209666  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4274  membrane protein-like  33.33 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.634529  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0570  hypothetical protein  35.78 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2143  membrane protein-like protein  34.81 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1040  membrane protein-like protein  34.19 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1911  hypothetical protein  37.1 
 
 		 151 aa  57  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00157166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1044  membrane protein-like protein  33.55 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.610119 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1983  hypothetical protein  31.03 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>