45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1040 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1040  membrane protein-like protein  100 
 
 		 156 aa  300  6.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1044  membrane protein-like protein  98.08 
 
 		 156 aa  294  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.610119 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1162  membrane protein-like protein  90.26 
 
 		 154 aa  258  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0683  membrane protein-like  90.26 
 
 		 154 aa  258  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4274  membrane protein-like  92.21 
 
 		 154 aa  256  7e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.634529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1138  membrane protein-like protein  90.91 
 
 		 154 aa  252  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2143  membrane protein-like protein  84.42 
 
 		 154 aa  240  5e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1759  hypothetical protein  72.67 
 
 		 153 aa  216  7e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0570  hypothetical protein  74 
 
 		 254 aa  214  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2868  hypothetical protein  73.33 
 
 		 153 aa  214  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.665694  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2844  hypothetical protein  73.33 
 
 		 153 aa  214  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.715344  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2436  hypothetical protein  73.33 
 
 		 153 aa  214  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.190819  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2809  hypothetical protein  73.33 
 
 		 153 aa  214  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0363655  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2749  hypothetical protein  72.67 
 
 		 153 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.194759  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0863  membrane protein-like protein  66.01 
 
 		 152 aa  200  6e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.534912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1247  hypothetical protein  59.33 
 
 		 154 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2876  hypothetical protein  57.33 
 
 		 154 aa  164  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218241  normal  0.0209609 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1911  hypothetical protein  54.67 
 
 		 151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00157166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0330  putative transmembrane protein  36.42 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0341  putative transmembrane protein  35.76 
 
 		 151 aa  73.6  0.0000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0848  transmembrane protein  35.71 
 
 		 151 aa  73.6  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0742  putative transmembrane protein  35.71 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152888  normal  0.552808 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0412  putative transmembrane protein  40 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0829  hypothetical protein  34.19 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.018742  normal  0.139665 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0795  hypothetical protein  37.38 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0458  putative transmembrane protein  32 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0668  putative transmembrane protein  35.76 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796642 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0728  membrane protein-like protein  41.67 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18271  hypothetical protein  26.97 
 
 		 156 aa  57  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.146013 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63840  hypothetical protein  33.05 
 
 		 151 aa  57  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.530683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1658  hypothetical protein  28.1 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.962451 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5547  hypothetical protein  32.73 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0812  hypothetical protein  35.71 
 
 		 150 aa  53.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353127  normal  0.980165 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15341  hypothetical protein  23.81 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14221  hypothetical protein  26.67 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045747 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1243  hypothetical protein  28.29 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.563341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0906  hypothetical protein  27.03 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0209666  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1465  hypothetical protein  23.81 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00433461  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1252  hypothetical protein  38.46 
 
 		 180 aa  48.5  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.380543  normal  0.0148003 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15561  hypothetical protein  23.81 
 
 		 161 aa  47.8  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00215073  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1001  hypothetical protein  25.34 
 
 		 163 aa  47.8  0.00006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.379029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16701  hypothetical protein  23.97 
 
 		 162 aa  47.4  0.00008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15711  hypothetical protein  23.81 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.627984  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0819  hypothetical protein  23.49 
 
 		 160 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.490622  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3410  hypothetical protein  31.69 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0778209 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>