45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4274 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4274  membrane protein-like  100 
 
 
154 aa  297  4e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.634529  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1162  membrane protein-like protein  92.86 
 
 
154 aa  266  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0683  membrane protein-like  92.86 
 
 
154 aa  266  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1138  membrane protein-like protein  92.21 
 
 
154 aa  259  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1040  membrane protein-like protein  92.21 
 
 
156 aa  257  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1044  membrane protein-like protein  90.26 
 
 
156 aa  252  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.610119 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2143  membrane protein-like protein  88.96 
 
 
154 aa  251  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1759  hypothetical protein  69.08 
 
 
153 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2749  hypothetical protein  70.39 
 
 
153 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.194759  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2844  hypothetical protein  69.74 
 
 
153 aa  210  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.715344  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2809  hypothetical protein  69.74 
 
 
153 aa  210  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0363655  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2436  hypothetical protein  69.74 
 
 
153 aa  210  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.190819  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2868  hypothetical protein  69.74 
 
 
153 aa  210  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.665694  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0570  hypothetical protein  70.67 
 
 
254 aa  209  1e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0863  membrane protein-like protein  67.32 
 
 
152 aa  207  5e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.534912  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1247  hypothetical protein  63.16 
 
 
154 aa  181  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2876  hypothetical protein  58.55 
 
 
154 aa  173  7e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218241  normal  0.0209609 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1911  hypothetical protein  56.67 
 
 
151 aa  148  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00157166  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0742  putative transmembrane protein  36.84 
 
 
150 aa  75.5  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152888  normal  0.552808 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0848  transmembrane protein  35.48 
 
 
151 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0330  putative transmembrane protein  35.53 
 
 
151 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0341  putative transmembrane protein  35.53 
 
 
151 aa  72  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0795  hypothetical protein  40 
 
 
150 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0829  hypothetical protein  33.33 
 
 
151 aa  66.2  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.018742  normal  0.139665 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0412  putative transmembrane protein  40.19 
 
 
162 aa  65.5  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1658  hypothetical protein  29.03 
 
 
152 aa  60.5  0.000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.962451 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18271  hypothetical protein  27.52 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.146013 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0458  putative transmembrane protein  34.58 
 
 
150 aa  58.9  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15341  hypothetical protein  26.85 
 
 
161 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0668  putative transmembrane protein  35.76 
 
 
148 aa  55.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.796642 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0906  hypothetical protein  28.67 
 
 
163 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0209666  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0812  hypothetical protein  37.21 
 
 
150 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353127  normal  0.980165 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0728  membrane protein-like protein  40.28 
 
 
151 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16701  hypothetical protein  26.17 
 
 
162 aa  55.1  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14221  hypothetical protein  27.63 
 
 
158 aa  54.7  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0045747 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63840  hypothetical protein  32.45 
 
 
151 aa  54.3  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.530683  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0819  hypothetical protein  26.97 
 
 
160 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.490622  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5547  hypothetical protein  34.23 
 
 
151 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1465  hypothetical protein  28.7 
 
 
161 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00433461  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1243  hypothetical protein  29.94 
 
 
149 aa  51.6  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.563341  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15561  hypothetical protein  28.44 
 
 
161 aa  51.2  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00215073  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1252  hypothetical protein  34.23 
 
 
180 aa  49.7  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.380543  normal  0.0148003 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15711  hypothetical protein  24 
 
 
161 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.627984  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1001  hypothetical protein  25.68 
 
 
163 aa  49.7  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.379029  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_86791  predicted protein  26.61 
 
 
183 aa  41.2  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>