46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A2844 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0570  hypothetical protein  99.34 
 
 
254 aa  295  2e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2868  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  294  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.665694  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2809  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  294  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0363655  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2844  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  294  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.715344  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2436  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  294  2e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.190819  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2749  hypothetical protein  99.35 
 
 
153 aa  293  6e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.194759  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1759  hypothetical protein  90.85 
 
 
153 aa  272  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1162  membrane protein-like protein  70.39 
 
 
154 aa  202  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0683  membrane protein-like  70.39 
 
 
154 aa  202  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1040  membrane protein-like protein  73.33 
 
 
156 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1138  membrane protein-like protein  70.39 
 
 
154 aa  196  7e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1044  membrane protein-like protein  73.65 
 
 
156 aa  196  9e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.610119 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4274  membrane protein-like  69.74 
 
 
154 aa  194  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.634529  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2143  membrane protein-like protein  70.67 
 
 
154 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0863  membrane protein-like protein  60.26 
 
 
152 aa  184  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.534912  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1247  hypothetical protein  59.33 
 
 
154 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2876  hypothetical protein  54.67 
 
 
154 aa  166  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218241  normal  0.0209609 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1911  hypothetical protein  52.67 
 
 
151 aa  142  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00157166  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0341  putative transmembrane protein  36.18 
 
 
151 aa  74.3  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0330  putative transmembrane protein  35.53 
 
 
151 aa  73.6  0.0000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18271  hypothetical protein  33.11 
 
 
156 aa  72.4  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.146013 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0458  putative transmembrane protein  35.53 
 
 
150 aa  70.1  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0906  hypothetical protein  32.89 
 
 
163 aa  69.3  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0209666  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0848  transmembrane protein  35.85 
 
 
151 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0742  putative transmembrane protein  35.14 
 
 
150 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152888  normal  0.552808 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1465  hypothetical protein  31.76 
 
 
161 aa  67.8  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00433461  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15341  hypothetical protein  31.08 
 
 
161 aa  67.4  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15561  hypothetical protein  32.43 
 
 
161 aa  67.4  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00215073  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1658  hypothetical protein  32.89 
 
 
152 aa  66.2  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.962451 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15711  hypothetical protein  32.43 
 
 
161 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.627984  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1001  hypothetical protein  33.78 
 
 
163 aa  66.6  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.379029  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0412  putative transmembrane protein  37.93 
 
 
162 aa  65.5  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16701  hypothetical protein  32 
 
 
162 aa  61.6  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0795  hypothetical protein  33.96 
 
 
150 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0829  hypothetical protein  34.26 
 
 
151 aa  61.2  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.018742  normal  0.139665 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0819  hypothetical protein  31.76 
 
 
160 aa  60.5  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.490622  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63840  hypothetical protein  30.51 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.530683  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0812  hypothetical protein  35.63 
 
 
150 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353127  normal  0.980165 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14221  hypothetical protein  27.52 
 
 
158 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0045747 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0668  putative transmembrane protein  32.03 
 
 
148 aa  52  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.796642 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5547  hypothetical protein  30.17 
 
 
151 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0728  membrane protein-like protein  30.09 
 
 
151 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1243  hypothetical protein  30.77 
 
 
149 aa  48.9  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.563341  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_86791  predicted protein  27.78 
 
 
183 aa  48.1  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_7235  predicted protein  29.49 
 
 
153 aa  45.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1252  hypothetical protein  33.64 
 
 
180 aa  45.1  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.380543  normal  0.0148003 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>