79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2008 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2008  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 		 274 aa  568  1e-161  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0739573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2009  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  31.8 
 
 		 307 aa  94  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.133996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3662  guanylate kinase/L-type calcium channel region  30.17 
 
 		 509 aa  70.1  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.447167 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004318  carbon-nitrogen hydrolase  26.96 
 
 		 514 aa  62.8  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1442  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  24.51 
 
 		 506 aa  59.3  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3658  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  24.74 
 
 		 509 aa  55.8  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.15562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07450  Nitrilase/cyanide hydratase  25.33 
 
 		 293 aa  53.9  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0409  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  24.15 
 
 		 276 aa  54.7  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0532  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  25.57 
 
 		 522 aa  54.3  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.479467  normal  0.372381 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2710  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  25.42 
 
 		 528 aa  53.5  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2425  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N- acyltransferase  24.68 
 
 		 522 aa  53.5  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.48789  decreased coverage  0.00000000100435 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4092  carbon-nitrogen family hydrolase  24.69 
 
 		 282 aa  53.1  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1892  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  27.01 
 
 		 501 aa  52.4  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00510  putative carbon-nitrogen hydrolase  26.29 
 
 		 510 aa  51.6  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.856557  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1417  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  27.2 
 
 		 508 aa  51.6  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0869  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  27.8 
 
 		 522 aa  51.2  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.659492  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3328  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  23.31 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4155  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  27.78 
 
 		 305 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.67193 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0564  nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  27.17 
 
 		 281 aa  50.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2774  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  26.07 
 
 		 516 aa  49.7  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0511  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  27.1 
 
 		 507 aa  49.3  0.00006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.957509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07460  Nitrilase/cyanide hydratase  27.04 
 
 		 349 aa  49.3  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0678  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  24.12 
 
 		 360 aa  49.3  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00114453  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0615  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  26.51 
 
 		 535 aa  48.1  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5899  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  25.62 
 
 		 299 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.124023 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5155  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  27.69 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.263526 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0936  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  25.95 
 
 		 557 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0656  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  25.61 
 
 		 522 aa  47.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0366  putative amidohydrolase protein  25.11 
 
 		 545 aa  47  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1983  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N- acyltransferase  29.32 
 
 		 570 aa  46.6  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.314908  normal  0.0215342 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3717  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N- acyltransferase  26.29 
 
 		 511 aa  46.6  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.904376  normal  0.0271118 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3063  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N- acyltransferase  24.22 
 
 		 280 aa  46.6  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2352  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  25.61 
 
 		 517 aa  46.6  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.348804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1548  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  28.57 
 
 		 273 aa  46.6  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3748  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  24.89 
 
 		 279 aa  46.2  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3867  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  25.95 
 
 		 557 aa  46.2  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0941  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  24.59 
 
 		 278 aa  45.8  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0528  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  24.6 
 
 		 276 aa  45.8  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0566  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  24.78 
 
 		 545 aa  45.8  0.0008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00404029 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3014  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  23.95 
 
 		 579 aa  45.8  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0407  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  25.11 
 
 		 545 aa  45.8  0.0008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01767  predicted amidohydrolase  24.89 
 
 		 518 aa  45.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.252184  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2994  putative N-carbamoyl-D-amino acid hydrolase  27.27 
 
 		 276 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1336  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  24.85 
 
 		 280 aa  44.3  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.999002  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0485  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  22.88 
 
 		 282 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.840175 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3466  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  22.88 
 
 		 282 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3872  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  25.64 
 
 		 520 aa  44.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00254916  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0142  carbon-nitrogen family hydrolase  25.58 
 
 		 291 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06801  putative nitrilase  24.7 
 
 		 275 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.105351  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0657  carbon-nitrogen family hydrolase  23.32 
 
 		 290 aa  43.5  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1728  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N- acyltransferase  26.84 
 
 		 535 aa  43.9  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.309327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1196  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  25 
 
 		 299 aa  43.5  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0571  putative carbon-nitrogen hydrolase  26.14 
 
 		 317 aa  43.5  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4396  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  26.02 
 
 		 244 aa  43.5  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0171854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0580  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  24.6 
 
 		 276 aa  43.5  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4696  N-carbamoylputrescine amidase  25 
 
 		 292 aa  43.5  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.582983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1192  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  24.02 
 
 		 298 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.775768 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2623  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N- acyltransferase  25 
 
 		 299 aa  43.5  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1970  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  28.46 
 
 		 519 aa  43.1  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1585  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N- acyltransferase  21.65 
 
 		 290 aa  43.5  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2456  N-carbamoylputrescine amidase  22.49 
 
 		 291 aa  43.1  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.288229 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0125  carbon-nitrogen family hydrolase  26.73 
 
 		 291 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.592103  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0524  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  24.22 
 
 		 276 aa  43.1  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2333  carbon-nitrogen family hydrolase  26.73 
 
 		 291 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2310  carbon-nitrogen family hydrolase  26.73 
 
 		 291 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0127  carbon-nitrogen family hydrolase  26.73 
 
 		 291 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2259  carbon-nitrogen family hydrolase  26.73 
 
 		 291 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2826  carbon-nitrogen family hydrolase  26.73 
 
 		 291 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48470  putative N-carbamoylputrescine amidohydrolase  25.16 
 
 		 303 aa  43.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000172873  normal  0.138984 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1012  hypothetical protein  22.57 
 
 		 268 aa  42.7  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0333  carbon-nitrogen family hydrolase  26.94 
 
 		 291 aa  42.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.168329  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3536  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  23.86 
 
 		 259 aa  42.7  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000952449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0503  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  24.21 
 
 		 276 aa  42.7  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3816  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  23.05 
 
 		 276 aa  42.7  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3876  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  24.4 
 
 		 271 aa  42.4  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1383  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  24.13 
 
 		 300 aa  42.4  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0736  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  24.7 
 
 		 266 aa  42.4  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.034467  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0615  putative nitrilase  23.93 
 
 		 275 aa  42  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0979  hypothetical protein  22.18 
 
 		 268 aa  42  0.01  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>