63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2220 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2220  IS21 family transposase  100 
 
 
189 aa  397  9.999999999999999e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0716  Integrase catalytic region  29.03 
 
 
524 aa  79  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.323373  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0737  transposase (22)  30.65 
 
 
253 aa  76.3  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1557  integrase catalytic subunit  28.49 
 
 
523 aa  75.1  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.124198  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1281  integrase catalytic subunit  28.49 
 
 
523 aa  75.1  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.942736  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2110  integrase catalytic subunit  28.49 
 
 
523 aa  75.1  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.728344  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1751  integrase catalytic subunit  28.49 
 
 
523 aa  75.1  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1452  integrase catalytic subunit  28.49 
 
 
523 aa  75.1  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.618875  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1348  integrase catalytic subunit  28.49 
 
 
523 aa  75.1  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.554323  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1136  integrase catalytic subunit  28.49 
 
 
523 aa  75.1  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.728344  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0642  integrase catalytic subunit  28.49 
 
 
523 aa  75.1  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0328  integrase catalytic subunit  28.49 
 
 
523 aa  75.1  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.67866  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0273  integrase catalytic subunit  28.49 
 
 
523 aa  75.1  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0076  integrase catalytic subunit  28.49 
 
 
523 aa  75.1  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0008  integrase catalytic subunit  28.49 
 
 
523 aa  75.1  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2041  integrase catalytic subunit  28.49 
 
 
523 aa  75.1  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00623438  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2211  integrase catalytic subunit  28.49 
 
 
523 aa  75.1  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2309  integrase catalytic subunit  28.49 
 
 
523 aa  75.1  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2321  integrase catalytic subunit  28.49 
 
 
523 aa  75.1  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0179767  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2384  integrase catalytic subunit  28.49 
 
 
523 aa  75.1  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2568  integrase catalytic subunit  28.49 
 
 
523 aa  75.1  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.467785  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2653  integrase catalytic subunit  28.49 
 
 
523 aa  75.1  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2658  integrase catalytic subunit  28.49 
 
 
523 aa  75.1  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2174  integrase catalytic subunit  28.49 
 
 
523 aa  74.3  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.377816  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2216  integrase catalytic subunit  26.47 
 
 
512 aa  68.2  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0026  integrase catalytic subunit  26.47 
 
 
512 aa  68.2  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1296  integrase catalytic subunit  26.47 
 
 
512 aa  68.2  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.709062  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2334  integrase catalytic subunit  28.41 
 
 
523 aa  65.9  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1530  integrase catalytic subunit  28.41 
 
 
523 aa  65.9  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0210  transposase, IS21 family  27.27 
 
 
417 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000847159 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03420  transposase  25.32 
 
 
405 aa  52.4  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.869961  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7013  hypothetical protein  25 
 
 
427 aa  52  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1464  integrase catalytic region  25 
 
 
427 aa  52  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1510  integrase catalytic region  25 
 
 
427 aa  52  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2452  integrase catalytic region  25 
 
 
427 aa  52  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2798  integrase catalytic region  25 
 
 
427 aa  52  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3888  integrase catalytic region  25 
 
 
427 aa  52  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4700  integrase catalytic region  25 
 
 
427 aa  52  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670986  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5534  integrase catalytic region  25 
 
 
427 aa  52  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6916  integrase catalytic region  25 
 
 
427 aa  52  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2239  integrase catalytic subunit  27.53 
 
 
495 aa  51.6  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0237102 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0662  integrase catalytic subunit  27.53 
 
 
495 aa  51.6  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0102982  hitchhiker  0.000000317754 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0649  integrase catalytic subunit  27.53 
 
 
306 aa  51.6  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00201548 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0290  integrase catalytic subunit  27.53 
 
 
495 aa  51.6  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.196451  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0376  Integrase catalytic region  25.75 
 
 
426 aa  50.8  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2305  Integrase catalytic region  25.75 
 
 
426 aa  50.8  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2884  hypothetical protein  26.34 
 
 
348 aa  51.2  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0020  hypothetical protein  26.34 
 
 
348 aa  51.2  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1563  hypothetical protein  26.47 
 
 
340 aa  47.8  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2538  integrase catalytic subunit  23.49 
 
 
424 aa  47.8  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178355  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3717  integrase catalytic subunit  34.72 
 
 
412 aa  43.9  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1554  Integrase catalytic region  25.15 
 
 
413 aa  44.3  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0009  Integrase catalytic region  23.86 
 
 
523 aa  43.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0359  Integrase catalytic region  23.86 
 
 
518 aa  43.1  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.694452  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1310  Integrase catalytic region  23.86 
 
 
518 aa  43.1  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1893  Integrase catalytic region  23.86 
 
 
518 aa  43.1  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.265792  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4252  Integrase catalytic region  23.86 
 
 
518 aa  43.1  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2854  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 
412 aa  42.4  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230802  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1319  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 
412 aa  42.4  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0119  Integrase catalytic region  21.62 
 
 
449 aa  42.7  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1009  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 
412 aa  42.4  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00535974  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1081  Integrase catalytic region  21.62 
 
 
449 aa  42.7  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.333924  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1865  Integrase catalytic region  36.67 
 
 
413 aa  42  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>