More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3373 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3373  S-adenosylmethionine synthetase  100 
 
 		 402 aa  823    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.304144 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0284  S-adenosylmethionine synthetase  85.32 
 
 		 401 aa  679    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3139  S-adenosylmethionine synthetase  78.97 
 
 		 406 aa  654    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3623  S-adenosylmethionine synthetase  64.09 
 
 		 389 aa  505  9.999999999999999e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2439  S-adenosylmethionine synthetase  65.34 
 
 		 388 aa  488  1e-137  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1062  methionine adenosyltransferase  63.02 
 
 		 398 aa  478  1e-133  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.323236  normal  0.678652 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1012  S-adenosylmethionine synthetase  62.34 
 
 		 394 aa  474  1e-132  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0706  S-adenosylmethionine synthetase  62.84 
 
 		 393 aa  471  1e-132  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.479174 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4493  methionine adenosyltransferase  62.87 
 
 		 392 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5908  S-adenosylmethionine synthetase  62.62 
 
 		 392 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.545702  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0193  S-adenosylmethionine synthetase  62.09 
 
 		 393 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.390697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5288  methionine adenosyltransferase  63.12 
 
 		 392 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.344896 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1816  methionine adenosyltransferase  61.61 
 
 		 397 aa  465  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0159943  normal  0.205319 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0027  S-adenosylmethionine synthetase  62.38 
 
 		 407 aa  466  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1596  S-adenosylmethionine synthetase  61.41 
 
 		 398 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3629  Methionine adenosyltransferase  62.03 
 
 		 391 aa  463  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0654869  normal  0.253839 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5699  S-adenosylmethionine synthetase  61.89 
 
 		 399 aa  462  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.464938 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3306  methionine adenosyltransferase  62.03 
 
 		 391 aa  463  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.636766 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3506  Methionine adenosyltransferase  61.79 
 
 		 391 aa  461  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.996413  normal  0.604274 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1588  S-adenosylmethionine synthetase  60.92 
 
 		 398 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4154  S-adenosylmethionine synthetase  61.74 
 
 		 398 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.509299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2753  S-adenosylmethionine synthetase  60.44 
 
 		 398 aa  455  1e-127  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293666  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4546  S-adenosylmethionine synthetase  59.95 
 
 		 398 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2378  S-adenosylmethionine synthetase  60.29 
 
 		 398 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.989714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3776  S-adenosylmethionine synthetase  59.6 
 
 		 389 aa  442  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0013  S-adenosylmethionine synthetase  59.23 
 
 		 412 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.303357  normal  0.0988559 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1873  S-adenosylmethionine synthetase  58.85 
 
 		 388 aa  440  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.176283  normal  0.7494 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0015  S-adenosylmethionine synthetase  59.47 
 
 		 412 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000616083 
 
 
-
 
NC_004310  BR2160  S-adenosylmethionine synthetase  57.65 
 
 		 421 aa  431  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00603906  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0046  S-adenosylmethionine synthetase  58.23 
 
 		 426 aa  433  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0624552  hitchhiker  0.00000000150767 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0444  S-adenosylmethionine synthetase  57.98 
 
 		 412 aa  431  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00664731  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3595  S-adenosylmethionine synthetase  58.85 
 
 		 388 aa  432  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0230155  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1970  S-adenosylmethionine synthetase  58.42 
 
 		 395 aa  434  1e-120  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3280  S-adenosylmethionine synthetase  58.85 
 
 		 388 aa  432  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.861099 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2072  S-adenosylmethionine synthetase  57.65 
 
 		 421 aa  432  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0645702  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1054  S-adenosylmethionine synthetase  59.26 
 
 		 395 aa  429  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0752  S-adenosylmethionine synthetase  57.41 
 
 		 420 aa  427  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3877  S-adenosylmethionine synthetase  58.52 
 
 		 388 aa  428  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1249  S-adenosylmethionine synthetase  56.47 
 
 		 426 aa  418  1e-116  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4320  methionine adenosyltransferase  54.7 
 
 		 387 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0850  S-adenosylmethionine synthetase  54.48 
 
 		 388 aa  413  1e-114  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.876069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3924  S-adenosylmethionine synthetase  57.45 
 
 		 426 aa  414  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0828  S-adenosylmethionine synthetase  53.73 
 
 		 388 aa  411  1e-113  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.296122  normal  0.0311874 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0683  S-adenosylmethionine synthetase  55.39 
 
 		 393 aa  408  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.842341  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3252  S-adenosylmethionine synthetase  54.3 
 
 		 393 aa  411  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4844  S-adenosylmethionine synthetase  55.14 
 
 		 403 aa  405  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.277601 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1256  S-adenosylmethionine synthetase  51.96 
 
 		 395 aa  406  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.247936  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5604  S-adenosylmethionine synthetase  54.3 
 
 		 393 aa  407  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.617182 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0705  S-adenosylmethionine synthetase  55.14 
 
 		 393 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.102884 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0660  S-adenosylmethionine synthetase  54.05 
 
 		 395 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00877697  decreased coverage  0.0019474 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0470  S-adenosylmethionine synthetase  54.5 
 
 		 382 aa  405  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0139  S-adenosylmethionine synthetase  53.23 
 
 		 389 aa  402  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0126  S-adenosylmethionine synthetase  53.94 
 
 		 393 aa  403  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1777  S-adenosylmethionine synthetase  52 
 
 		 392 aa  402  1e-111  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0979  S-adenosylmethionine synthetase  54.89 
 
 		 393 aa  404  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3880  S-adenosylmethionine synthetase  53.2 
 
 		 393 aa  404  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.356419  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0767  S-adenosylmethionine synthetase  54.14 
 
 		 393 aa  401  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2084  methionine adenosyltransferase  52.93 
 
 		 395 aa  404  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.191002  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4967  S-adenosylmethionine synthetase  53.17 
 
 		 396 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0413  S-adenosylmethionine synthetase  53.65 
 
 		 390 aa  398  9.999999999999999e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0737611  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03161  S-adenosylmethionine synthetase  53.12 
 
 		 381 aa  400  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4840  S-adenosylmethionine synthetase  53.17 
 
 		 396 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.905564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5016  S-adenosylmethionine synthetase  53.17 
 
 		 396 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330289 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0156  S-adenosylmethionine synthetase  52.84 
 
 		 387 aa  400  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0879  S-adenosylmethionine synthetase  53.48 
 
 		 388 aa  398  9.999999999999999e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000307684  hitchhiker  0.000000742555 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0499  S-adenosylmethionine synthetase  52.93 
 
 		 396 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1179  Methionine adenosyltransferase  52.85 
 
 		 389 aa  398  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1126  S-adenosylmethionine synthetase  54.29 
 
 		 393 aa  397  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2004  S-adenosylmethionine synthetase  51.86 
 
 		 382 aa  397  1e-109  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1999  S-adenosylmethionine synthetase  51.86 
 
 		 382 aa  397  1e-109  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2521  S-adenosylmethionine synthetase  52.1 
 
 		 388 aa  397  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2574  S-adenosylmethionine synthetase  52.08 
 
 		 395 aa  395  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0485425  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0385  S-adenosylmethionine synthetase  51.31 
 
 		 406 aa  395  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3331  S-adenosylmethionine synthetase  53 
 
 		 383 aa  395  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2262  S-adenosylmethionine synthetase  52.5 
 
 		 385 aa  395  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0690  Methionine adenosyltransferase  55.28 
 
 		 389 aa  394  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0374372  hitchhiker  0.00000199833 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0201  S-adenosylmethionine synthetase  52.35 
 
 		 387 aa  394  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2251  methionine adenosyltransferase  51.72 
 
 		 397 aa  392  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000460807  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0532  S-adenosylmethionine synthetase  55.28 
 
 		 389 aa  394  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.347962  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0087  S-adenosylmethionine synthetase  50.61 
 
 		 396 aa  392  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000221578  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1880  S-adenosylmethionine synthetase  52.38 
 
 		 387 aa  390  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000337587  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2894  S-adenosylmethionine synthetase  54.52 
 
 		 391 aa  391  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3374  S-adenosylmethionine synthetase  51 
 
 		 384 aa  389  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5269  S-adenosylmethionine synthetase  51.71 
 
 		 396 aa  390  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.613554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3227  S-adenosylmethionine synthetase  53.5 
 
 		 382 aa  388  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.359365 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2391  S-adenosylmethionine synthetase  54.32 
 
 		 390 aa  390  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.855704  normal  0.120433 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0646  S-adenosylmethionine synthetase  52.25 
 
 		 383 aa  390  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00167645  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3565  S-adenosylmethionine synthetase  53.06 
 
 		 403 aa  389  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814506  normal  0.982729 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0753  Non-specific protein-tyrosine kinase  51 
 
 		 384 aa  388  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0841  S-adenosylmethionine synthetase  51.37 
 
 		 384 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3263  S-adenosylmethionine synthetase  50.75 
 
 		 384 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0673019  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1821  S-adenosylmethionine synthetase  52.53 
 
 		 385 aa  386  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0267535  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3974  S-adenosylmethionine synthetase  52.12 
 
 		 384 aa  387  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3347  S-adenosylmethionine synthetase  51.37 
 
 		 384 aa  387  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3251  S-adenosylmethionine synthetase  51.63 
 
 		 383 aa  385  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3252  S-adenosylmethionine synthetase  50.75 
 
 		 384 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0015174  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3346  S-adenosylmethionine synthetase  50.75 
 
 		 384 aa  385  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.274047  decreased coverage  0.00210424 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0843  S-adenosylmethionine synthetase  51.37 
 
 		 384 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000750109  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3332  S-adenosylmethionine synthetase  53.22 
 
 		 389 aa  386  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3354  S-adenosylmethionine synthetase  51.63 
 
 		 383 aa  385  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>