More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4546 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5699  S-adenosylmethionine synthetase  88.94 
 
 		 399 aa  718    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.464938 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2378  S-adenosylmethionine synthetase  88.69 
 
 		 398 aa  718    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.989714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4546  S-adenosylmethionine synthetase  100 
 
 		 398 aa  822    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1588  S-adenosylmethionine synthetase  93.47 
 
 		 398 aa  753    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4154  S-adenosylmethionine synthetase  91.96 
 
 		 398 aa  746    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.509299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1596  S-adenosylmethionine synthetase  92.46 
 
 		 398 aa  743    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2753  S-adenosylmethionine synthetase  88.69 
 
 		 398 aa  719    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293666  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1062  methionine adenosyltransferase  73.62 
 
 		 398 aa  592  1e-168  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.323236  normal  0.678652 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1816  methionine adenosyltransferase  72.8 
 
 		 397 aa  587  1e-166  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0159943  normal  0.205319 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5288  methionine adenosyltransferase  69.67 
 
 		 392 aa  552  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.344896 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4493  methionine adenosyltransferase  68.92 
 
 		 392 aa  548  1e-155  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5908  S-adenosylmethionine synthetase  69.17 
 
 		 392 aa  548  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.545702  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3623  S-adenosylmethionine synthetase  67.01 
 
 		 389 aa  545  1e-154  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2160  S-adenosylmethionine synthetase  65.55 
 
 		 421 aa  541  1e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00603906  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3306  methionine adenosyltransferase  69.1 
 
 		 391 aa  544  1e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.636766 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3629  Methionine adenosyltransferase  69.1 
 
 		 391 aa  544  1e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0654869  normal  0.253839 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2072  S-adenosylmethionine synthetase  65.79 
 
 		 421 aa  542  1e-153  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0645702  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0013  S-adenosylmethionine synthetase  67.55 
 
 		 412 aa  544  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.303357  normal  0.0988559 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0015  S-adenosylmethionine synthetase  67.31 
 
 		 412 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000616083 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0752  S-adenosylmethionine synthetase  66.03 
 
 		 420 aa  539  9.999999999999999e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3506  Methionine adenosyltransferase  68.59 
 
 		 391 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.996413  normal  0.604274 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0046  S-adenosylmethionine synthetase  66.18 
 
 		 426 aa  536  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0624552  hitchhiker  0.00000000150767 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0444  S-adenosylmethionine synthetase  66.18 
 
 		 412 aa  525  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00664731  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3924  S-adenosylmethionine synthetase  65.63 
 
 		 426 aa  521  1e-147  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0706  S-adenosylmethionine synthetase  66.33 
 
 		 393 aa  520  1e-146  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.479174 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1012  S-adenosylmethionine synthetase  66.67 
 
 		 394 aa  520  1e-146  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1249  S-adenosylmethionine synthetase  62.68 
 
 		 426 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0193  S-adenosylmethionine synthetase  65.59 
 
 		 393 aa  511  1e-144  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.390697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3280  S-adenosylmethionine synthetase  64.84 
 
 		 388 aa  501  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.861099 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3595  S-adenosylmethionine synthetase  64.84 
 
 		 388 aa  501  1e-140  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0230155  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3877  S-adenosylmethionine synthetase  64.59 
 
 		 388 aa  496  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3776  S-adenosylmethionine synthetase  62.88 
 
 		 389 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1873  S-adenosylmethionine synthetase  62.34 
 
 		 388 aa  484  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.176283  normal  0.7494 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2439  S-adenosylmethionine synthetase  63.71 
 
 		 388 aa  484  1e-135  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1054  S-adenosylmethionine synthetase  62.34 
 
 		 395 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0027  S-adenosylmethionine synthetase  60.44 
 
 		 407 aa  461  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3139  S-adenosylmethionine synthetase  56.87 
 
 		 406 aa  459  9.999999999999999e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1970  S-adenosylmethionine synthetase  61.5 
 
 		 395 aa  456  1e-127  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3373  S-adenosylmethionine synthetase  59.95 
 
 		 402 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.304144 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0945  S-adenosylmethionine synthetase  54.06 
 
 		 393 aa  432  1e-120  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0136  S-adenosylmethionine synthetase  54.48 
 
 		 390 aa  429  1e-119  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0284  S-adenosylmethionine synthetase  58.64 
 
 		 401 aa  427  1e-118  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0018  S-adenosylmethionine synthetase  53.55 
 
 		 392 aa  427  1e-118  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1256  S-adenosylmethionine synthetase  52.48 
 
 		 395 aa  400  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.247936  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0413  S-adenosylmethionine synthetase  54.57 
 
 		 390 aa  398  9.999999999999999e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0737611  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4320  methionine adenosyltransferase  52.75 
 
 		 387 aa  399  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238534  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0139  S-adenosylmethionine synthetase  52.5 
 
 		 389 aa  396  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1179  Methionine adenosyltransferase  52.75 
 
 		 389 aa  395  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0087  S-adenosylmethionine synthetase  52.49 
 
 		 396 aa  397  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000221578  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3252  S-adenosylmethionine synthetase  51.84 
 
 		 393 aa  397  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1821  S-adenosylmethionine synthetase  52.93 
 
 		 385 aa  395  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0267535  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3880  S-adenosylmethionine synthetase  50.49 
 
 		 393 aa  396  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.356419  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2574  S-adenosylmethionine synthetase  53.2 
 
 		 395 aa  396  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0485425  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2777  S-adenosylmethionine synthetase  54.98 
 
 		 403 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102854  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0470  S-adenosylmethionine synthetase  52.79 
 
 		 382 aa  392  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3874  methionine adenosyltransferase  51.96 
 
 		 396 aa  393  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000696498  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2262  S-adenosylmethionine synthetase  52.01 
 
 		 385 aa  392  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0659  S-adenosylmethionine synthetase  54.36 
 
 		 403 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5269  S-adenosylmethionine synthetase  52.33 
 
 		 396 aa  391  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.613554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0879  S-adenosylmethionine synthetase  51.26 
 
 		 388 aa  389  1e-107  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000307684  hitchhiker  0.000000742555 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0085  methionine adenosyltransferase  51.13 
 
 		 388 aa  391  1e-107  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.486268 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0767  S-adenosylmethionine synthetase  51.38 
 
 		 393 aa  388  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0660  S-adenosylmethionine synthetase  50.62 
 
 		 395 aa  390  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00877697  decreased coverage  0.0019474 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0499  S-adenosylmethionine synthetase  52.09 
 
 		 396 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0873  S-adenosylmethionine synthetase  52.15 
 
 		 383 aa  386  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4967  S-adenosylmethionine synthetase  52.33 
 
 		 396 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0349  S-adenosylmethionine synthetase  51.13 
 
 		 388 aa  387  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000664302  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09860  Methionine adenosyltransferase  51.99 
 
 		 402 aa  387  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5016  S-adenosylmethionine synthetase  52.33 
 
 		 396 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330289 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2251  methionine adenosyltransferase  50.74 
 
 		 397 aa  385  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000460807  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2521  S-adenosylmethionine synthetase  51.75 
 
 		 388 aa  387  1e-106  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0705  S-adenosylmethionine synthetase  51.13 
 
 		 393 aa  386  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.102884 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4840  S-adenosylmethionine synthetase  52.33 
 
 		 396 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.905564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1082  S-adenosylmethionine synthetase  51.9 
 
 		 383 aa  385  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0507835  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0850  S-adenosylmethionine synthetase  51.39 
 
 		 388 aa  388  1e-106  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.876069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3331  S-adenosylmethionine synthetase  51.01 
 
 		 383 aa  387  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2391  S-adenosylmethionine synthetase  52.74 
 
 		 390 aa  386  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.855704  normal  0.120433 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0646  S-adenosylmethionine synthetase  52.15 
 
 		 383 aa  386  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00167645  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0126  S-adenosylmethionine synthetase  50.99 
 
 		 393 aa  387  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0979  S-adenosylmethionine synthetase  51.38 
 
 		 393 aa  387  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1171  S-adenosylmethionine synthetase  51.86 
 
 		 395 aa  385  1e-106  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000972386  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1133  S-adenosylmethionine synthetase  51.86 
 
 		 395 aa  385  1e-106  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000111198  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0683  S-adenosylmethionine synthetase  51.38 
 
 		 393 aa  387  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.842341  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03161  S-adenosylmethionine synthetase  51.88 
 
 		 381 aa  387  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0871  S-adenosylmethionine synthetase  52.41 
 
 		 383 aa  388  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3252  S-adenosylmethionine synthetase  51.26 
 
 		 384 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0015174  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3336  S-adenosylmethionine synthetase  51.51 
 
 		 384 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.216224  normal  0.254076 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0929  S-adenosylmethionine synthetase  51.65 
 
 		 383 aa  384  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2004  S-adenosylmethionine synthetase  50.25 
 
 		 382 aa  384  1e-105  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1999  S-adenosylmethionine synthetase  50.25 
 
 		 382 aa  383  1e-105  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4794  S-adenosylmethionine synthetase  53.02 
 
 		 396 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494476 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0828  S-adenosylmethionine synthetase  50.63 
 
 		 388 aa  384  1e-105  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.296122  normal  0.0311874 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0201  S-adenosylmethionine synthetase  52 
 
 		 387 aa  383  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5017  S-adenosylmethionine synthetase  52.96 
 
 		 399 aa  382  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00446313  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3263  S-adenosylmethionine synthetase  51.51 
 
 		 384 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0673019  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3374  S-adenosylmethionine synthetase  51.51 
 
 		 384 aa  382  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2161  S-adenosylmethionine synthetase  50.61 
 
 		 399 aa  382  1e-105  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3328  S-adenosylmethionine synthetase  51.51 
 
 		 384 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.196348  normal  0.570149 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3354  S-adenosylmethionine synthetase  51.9 
 
 		 383 aa  384  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2760  S-adenosylmethionine synthetase  51.14 
 
 		 383 aa  382  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>