More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5288 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3629  Methionine adenosyltransferase  87.72 
 
 		 391 aa  671    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0654869  normal  0.253839 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3506  Methionine adenosyltransferase  87.98 
 
 		 391 aa  670    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.996413  normal  0.604274 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5908  S-adenosylmethionine synthetase  95.15 
 
 		 392 aa  737    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.545702  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3306  methionine adenosyltransferase  87.72 
 
 		 391 aa  671    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.636766 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5288  methionine adenosyltransferase  100 
 
 		 392 aa  794    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.344896 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4493  methionine adenosyltransferase  87.76 
 
 		 392 aa  673    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1816  methionine adenosyltransferase  75.94 
 
 		 397 aa  588  1e-167  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0159943  normal  0.205319 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1062  methionine adenosyltransferase  75.44 
 
 		 398 aa  587  1e-166  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.323236  normal  0.678652 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0706  S-adenosylmethionine synthetase  71.65 
 
 		 393 aa  556  1e-157  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.479174 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1596  S-adenosylmethionine synthetase  70.18 
 
 		 398 aa  554  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2753  S-adenosylmethionine synthetase  70.18 
 
 		 398 aa  556  1e-157  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293666  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4546  S-adenosylmethionine synthetase  69.67 
 
 		 398 aa  554  1e-156  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1588  S-adenosylmethionine synthetase  70.43 
 
 		 398 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4154  S-adenosylmethionine synthetase  70.18 
 
 		 398 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.509299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2378  S-adenosylmethionine synthetase  69.92 
 
 		 398 aa  551  1e-155  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.989714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3623  S-adenosylmethionine synthetase  69.57 
 
 		 389 aa  547  1e-154  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1012  S-adenosylmethionine synthetase  69.54 
 
 		 394 aa  542  1e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5699  S-adenosylmethionine synthetase  69.33 
 
 		 399 aa  543  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.464938 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0193  S-adenosylmethionine synthetase  69.37 
 
 		 393 aa  544  1e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.390697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3776  S-adenosylmethionine synthetase  68.29 
 
 		 389 aa  531  1e-150  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0013  S-adenosylmethionine synthetase  68.46 
 
 		 412 aa  530  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.303357  normal  0.0988559 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0015  S-adenosylmethionine synthetase  68.46 
 
 		 412 aa  529  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000616083 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0752  S-adenosylmethionine synthetase  65.48 
 
 		 420 aa  524  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2072  S-adenosylmethionine synthetase  65.48 
 
 		 421 aa  525  1e-148  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0645702  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2160  S-adenosylmethionine synthetase  65.24 
 
 		 421 aa  523  1e-147  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00603906  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0046  S-adenosylmethionine synthetase  66.75 
 
 		 426 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0624552  hitchhiker  0.00000000150767 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2439  S-adenosylmethionine synthetase  68.29 
 
 		 388 aa  509  1e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1873  S-adenosylmethionine synthetase  66.84 
 
 		 388 aa  508  1e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.176283  normal  0.7494 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1054  S-adenosylmethionine synthetase  67.26 
 
 		 395 aa  504  1e-141  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3924  S-adenosylmethionine synthetase  65.48 
 
 		 426 aa  501  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1249  S-adenosylmethionine synthetase  61.67 
 
 		 426 aa  500  1e-140  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0444  S-adenosylmethionine synthetase  66.5 
 
 		 412 aa  500  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00664731  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3877  S-adenosylmethionine synthetase  66.58 
 
 		 388 aa  494  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1970  S-adenosylmethionine synthetase  67.09 
 
 		 395 aa  495  1e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3595  S-adenosylmethionine synthetase  65.82 
 
 		 388 aa  491  1e-137  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0230155  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3280  S-adenosylmethionine synthetase  65.82 
 
 		 388 aa  491  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.861099 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3139  S-adenosylmethionine synthetase  61.52 
 
 		 406 aa  480  1e-134  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0027  S-adenosylmethionine synthetase  64.04 
 
 		 407 aa  478  1e-133  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3373  S-adenosylmethionine synthetase  63.12 
 
 		 402 aa  468  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.304144 
 
 
-
 
NC_002978  WD0136  S-adenosylmethionine synthetase  57.22 
 
 		 390 aa  448  1e-125  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0284  S-adenosylmethionine synthetase  61.63 
 
 		 401 aa  435  1e-121  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0945  S-adenosylmethionine synthetase  52.31 
 
 		 393 aa  427  1e-118  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0018  S-adenosylmethionine synthetase  53.35 
 
 		 392 aa  426  1e-118  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0470  S-adenosylmethionine synthetase  55.73 
 
 		 382 aa  421  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2004  S-adenosylmethionine synthetase  53.35 
 
 		 382 aa  409  1e-113  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4320  methionine adenosyltransferase  53.45 
 
 		 387 aa  408  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2262  S-adenosylmethionine synthetase  55.27 
 
 		 385 aa  409  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3252  S-adenosylmethionine synthetase  54.66 
 
 		 393 aa  408  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0139  S-adenosylmethionine synthetase  54.5 
 
 		 389 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1256  S-adenosylmethionine synthetase  53.79 
 
 		 395 aa  405  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.247936  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5604  S-adenosylmethionine synthetase  54.16 
 
 		 393 aa  408  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.617182 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1999  S-adenosylmethionine synthetase  53.09 
 
 		 382 aa  407  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0660  S-adenosylmethionine synthetase  54.27 
 
 		 395 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00877697  decreased coverage  0.0019474 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0201  S-adenosylmethionine synthetase  54.73 
 
 		 387 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0126  S-adenosylmethionine synthetase  54.04 
 
 		 393 aa  405  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0156  S-adenosylmethionine synthetase  54.22 
 
 		 387 aa  402  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03161  S-adenosylmethionine synthetase  54.24 
 
 		 381 aa  402  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0705  S-adenosylmethionine synthetase  54.24 
 
 		 393 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.102884 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3880  S-adenosylmethionine synthetase  51.77 
 
 		 393 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.356419  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0767  S-adenosylmethionine synthetase  54.36 
 
 		 393 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0683  S-adenosylmethionine synthetase  54.5 
 
 		 393 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.842341  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3331  S-adenosylmethionine synthetase  54.26 
 
 		 383 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0413  S-adenosylmethionine synthetase  53.89 
 
 		 390 aa  400  9.999999999999999e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0737611  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1126  S-adenosylmethionine synthetase  54.4 
 
 		 393 aa  396  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0979  S-adenosylmethionine synthetase  53.98 
 
 		 393 aa  398  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2894  S-adenosylmethionine synthetase  54.66 
 
 		 391 aa  392  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2521  S-adenosylmethionine synthetase  52.42 
 
 		 388 aa  394  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1821  S-adenosylmethionine synthetase  52.59 
 
 		 385 aa  392  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0267535  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1179  Methionine adenosyltransferase  53.87 
 
 		 389 aa  392  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4844  S-adenosylmethionine synthetase  53.47 
 
 		 403 aa  394  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.277601 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02772  S-adenosylmethionine synthetase  53.35 
 
 		 384 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.374196  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0753  Non-specific protein-tyrosine kinase  53.35 
 
 		 384 aa  389  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4840  S-adenosylmethionine synthetase  52.64 
 
 		 396 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.905564  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4967  S-adenosylmethionine synthetase  52.64 
 
 		 396 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3084  S-adenosylmethionine synthetase  53.35 
 
 		 384 aa  389  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.383726  hitchhiker  0.000161028 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5016  S-adenosylmethionine synthetase  52.64 
 
 		 396 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330289 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0772  S-adenosylmethionine synthetase  53.35 
 
 		 384 aa  389  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0501612  hitchhiker  0.00139149 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0349  S-adenosylmethionine synthetase  52.7 
 
 		 388 aa  390  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000664302  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3374  S-adenosylmethionine synthetase  53.35 
 
 		 384 aa  390  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5269  S-adenosylmethionine synthetase  52.39 
 
 		 396 aa  391  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.613554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1777  S-adenosylmethionine synthetase  50.9 
 
 		 392 aa  390  1e-107  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0871  S-adenosylmethionine synthetase  52.85 
 
 		 383 aa  389  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1082  S-adenosylmethionine synthetase  52.85 
 
 		 383 aa  389  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0507835  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3284  S-adenosylmethionine synthetase  53.35 
 
 		 384 aa  389  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3099  S-adenosylmethionine synthetase  53.35 
 
 		 384 aa  389  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0499  S-adenosylmethionine synthetase  52.39 
 
 		 396 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2574  S-adenosylmethionine synthetase  52.79 
 
 		 395 aa  389  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0485425  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02735  hypothetical protein  53.35 
 
 		 384 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4244  S-adenosylmethionine synthetase  53.35 
 
 		 384 aa  389  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.908743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3346  S-adenosylmethionine synthetase  53.09 
 
 		 384 aa  387  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.274047  decreased coverage  0.00210424 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3263  S-adenosylmethionine synthetase  53.09 
 
 		 384 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0673019  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2541  S-adenosylmethionine synthetase  54.1 
 
 		 399 aa  387  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.245618  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0385  S-adenosylmethionine synthetase  52.23 
 
 		 406 aa  387  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3328  S-adenosylmethionine synthetase  53.09 
 
 		 384 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.196348  normal  0.570149 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3660  S-adenosylmethionine synthetase  52.33 
 
 		 383 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.2045 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07090  S-adenosylmethionine synthetase  52.9 
 
 		 396 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.905662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3433  S-adenosylmethionine synthetase  52.84 
 
 		 384 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223184 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0841  S-adenosylmethionine synthetase  52.97 
 
 		 384 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3354  S-adenosylmethionine synthetase  53.37 
 
 		 383 aa  387  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2760  S-adenosylmethionine synthetase  52.33 
 
 		 383 aa  387  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>