More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0193 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0706  S-adenosylmethionine synthetase  80.41 
 
 		 393 aa  642    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.479174 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0193  S-adenosylmethionine synthetase  100 
 
 		 393 aa  806    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.390697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1012  S-adenosylmethionine synthetase  81.89 
 
 		 394 aa  647    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1873  S-adenosylmethionine synthetase  75.38 
 
 		 388 aa  582  1.0000000000000001e-165  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.176283  normal  0.7494 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3877  S-adenosylmethionine synthetase  76.84 
 
 		 388 aa  578  1e-164  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3595  S-adenosylmethionine synthetase  76.34 
 
 		 388 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0230155  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3280  S-adenosylmethionine synthetase  76.34 
 
 		 388 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.861099 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5288  methionine adenosyltransferase  69.37 
 
 		 392 aa  543  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.344896 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4493  methionine adenosyltransferase  70.13 
 
 		 392 aa  543  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5908  S-adenosylmethionine synthetase  69.11 
 
 		 392 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.545702  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3306  methionine adenosyltransferase  69.54 
 
 		 391 aa  535  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.636766 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3629  Methionine adenosyltransferase  69.54 
 
 		 391 aa  535  1e-151  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0654869  normal  0.253839 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3506  Methionine adenosyltransferase  69.54 
 
 		 391 aa  533  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.996413  normal  0.604274 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1062  methionine adenosyltransferase  68.32 
 
 		 398 aa  525  1e-148  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.323236  normal  0.678652 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1816  methionine adenosyltransferase  68 
 
 		 397 aa  523  1e-147  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0159943  normal  0.205319 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3623  S-adenosylmethionine synthetase  64.97 
 
 		 389 aa  514  1.0000000000000001e-145  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4546  S-adenosylmethionine synthetase  65.59 
 
 		 398 aa  511  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1588  S-adenosylmethionine synthetase  65.34 
 
 		 398 aa  511  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1596  S-adenosylmethionine synthetase  65.59 
 
 		 398 aa  511  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4154  S-adenosylmethionine synthetase  65.09 
 
 		 398 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.509299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2753  S-adenosylmethionine synthetase  64.84 
 
 		 398 aa  508  1e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293666  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2378  S-adenosylmethionine synthetase  64.84 
 
 		 398 aa  506  9.999999999999999e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.989714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2439  S-adenosylmethionine synthetase  66.67 
 
 		 388 aa  506  9.999999999999999e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5699  S-adenosylmethionine synthetase  65.01 
 
 		 399 aa  501  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.464938 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0013  S-adenosylmethionine synthetase  66.01 
 
 		 412 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.303357  normal  0.0988559 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0046  S-adenosylmethionine synthetase  65.28 
 
 		 426 aa  493  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0624552  hitchhiker  0.00000000150767 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3776  S-adenosylmethionine synthetase  65.31 
 
 		 389 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0015  S-adenosylmethionine synthetase  66.01 
 
 		 412 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000616083 
 
 
-
 
NC_004310  BR2160  S-adenosylmethionine synthetase  63.01 
 
 		 421 aa  484  1e-136  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00603906  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2072  S-adenosylmethionine synthetase  62.77 
 
 		 421 aa  482  1e-135  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0645702  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0752  S-adenosylmethionine synthetase  62.29 
 
 		 420 aa  479  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1249  S-adenosylmethionine synthetase  61.19 
 
 		 426 aa  471  1e-132  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3373  S-adenosylmethionine synthetase  62.09 
 
 		 402 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.304144 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3924  S-adenosylmethionine synthetase  63.96 
 
 		 426 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0027  S-adenosylmethionine synthetase  61.73 
 
 		 407 aa  465  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0444  S-adenosylmethionine synthetase  63.08 
 
 		 412 aa  467  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00664731  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3139  S-adenosylmethionine synthetase  58.66 
 
 		 406 aa  464  9.999999999999999e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1054  S-adenosylmethionine synthetase  62.24 
 
 		 395 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1970  S-adenosylmethionine synthetase  61.27 
 
 		 395 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0284  S-adenosylmethionine synthetase  61.25 
 
 		 401 aa  441  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4320  methionine adenosyltransferase  57.33 
 
 		 387 aa  433  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0470  S-adenosylmethionine synthetase  57.47 
 
 		 382 aa  430  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4967  S-adenosylmethionine synthetase  54.94 
 
 		 396 aa  421  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5016  S-adenosylmethionine synthetase  54.94 
 
 		 396 aa  421  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330289 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0413  S-adenosylmethionine synthetase  56.99 
 
 		 390 aa  424  1e-117  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0737611  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0945  S-adenosylmethionine synthetase  52.97 
 
 		 393 aa  422  1e-117  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1179  Methionine adenosyltransferase  57.36 
 
 		 389 aa  424  1e-117  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1821  S-adenosylmethionine synthetase  55.98 
 
 		 385 aa  424  1e-117  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0267535  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4840  S-adenosylmethionine synthetase  54.94 
 
 		 396 aa  421  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.905564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0018  S-adenosylmethionine synthetase  54.52 
 
 		 392 aa  424  1e-117  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2262  S-adenosylmethionine synthetase  56.63 
 
 		 385 aa  423  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0871  S-adenosylmethionine synthetase  54.9 
 
 		 383 aa  420  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3541  S-adenosylmethionine synthetase  55.15 
 
 		 383 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0929  S-adenosylmethionine synthetase  55.15 
 
 		 383 aa  421  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3660  S-adenosylmethionine synthetase  55.15 
 
 		 383 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.2045 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3466  S-adenosylmethionine synthetase  55.15 
 
 		 383 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5269  S-adenosylmethionine synthetase  54.43 
 
 		 396 aa  418  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.613554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0826  S-adenosylmethionine synthetase  54.9 
 
 		 383 aa  418  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232254  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1082  S-adenosylmethionine synthetase  55.27 
 
 		 383 aa  419  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0507835  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0646  S-adenosylmethionine synthetase  55.27 
 
 		 383 aa  419  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00167645  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0499  S-adenosylmethionine synthetase  54.68 
 
 		 396 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02772  S-adenosylmethionine synthetase  54.87 
 
 		 384 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.374196  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0753  Non-specific protein-tyrosine kinase  54.87 
 
 		 384 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0126  S-adenosylmethionine synthetase  54.14 
 
 		 393 aa  416  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3284  S-adenosylmethionine synthetase  54.87 
 
 		 384 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0139  S-adenosylmethionine synthetase  54.22 
 
 		 389 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02735  hypothetical protein  54.87 
 
 		 384 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4244  S-adenosylmethionine synthetase  54.87 
 
 		 384 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.908743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3084  S-adenosylmethionine synthetase  54.87 
 
 		 384 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.383726  hitchhiker  0.000161028 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05530  S-adenosylmethionine synthetase  55.47 
 
 		 396 aa  415  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0385  S-adenosylmethionine synthetase  54.57 
 
 		 406 aa  416  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3374  S-adenosylmethionine synthetase  54.87 
 
 		 384 aa  417  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0873  S-adenosylmethionine synthetase  54.9 
 
 		 383 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3252  S-adenosylmethionine synthetase  54 
 
 		 393 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3331  S-adenosylmethionine synthetase  53.85 
 
 		 383 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3099  S-adenosylmethionine synthetase  54.87 
 
 		 384 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0772  S-adenosylmethionine synthetase  54.87 
 
 		 384 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0501612  hitchhiker  0.00139149 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0772  S-adenosylmethionine synthetase  54.64 
 
 		 383 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3251  S-adenosylmethionine synthetase  54.64 
 
 		 383 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03161  S-adenosylmethionine synthetase  54.22 
 
 		 381 aa  417  9.999999999999999e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3354  S-adenosylmethionine synthetase  54.64 
 
 		 383 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0751  S-adenosylmethionine synthetase  54.9 
 
 		 383 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3042  S-adenosylmethionine synthetase  55.22 
 
 		 396 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.983396  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2760  S-adenosylmethionine synthetase  53.35 
 
 		 383 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3328  S-adenosylmethionine synthetase  54.36 
 
 		 384 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.196348  normal  0.570149 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3263  S-adenosylmethionine synthetase  54.36 
 
 		 384 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0673019  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3252  S-adenosylmethionine synthetase  54.1 
 
 		 384 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0015174  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3336  S-adenosylmethionine synthetase  54.36 
 
 		 384 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.216224  normal  0.254076 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0660  S-adenosylmethionine synthetase  53.5 
 
 		 395 aa  413  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00877697  decreased coverage  0.0019474 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3433  S-adenosylmethionine synthetase  54.1 
 
 		 384 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223184 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3227  S-adenosylmethionine synthetase  54.59 
 
 		 382 aa  411  1e-114  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.359365 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1256  S-adenosylmethionine synthetase  53.62 
 
 		 395 aa  410  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.247936  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4794  S-adenosylmethionine synthetase  55.44 
 
 		 396 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494476 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0979  S-adenosylmethionine synthetase  54.34 
 
 		 393 aa  409  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3974  S-adenosylmethionine synthetase  53.71 
 
 		 384 aa  410  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0454  S-adenosylmethionine synthetase  54.68 
 
 		 396 aa  409  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3880  S-adenosylmethionine synthetase  52.88 
 
 		 393 aa  411  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.356419  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07090  S-adenosylmethionine synthetase  55.3 
 
 		 396 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.905662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3346  S-adenosylmethionine synthetase  53.85 
 
 		 384 aa  409  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.274047  decreased coverage  0.00210424 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0649  S-adenosylmethionine synthetase  55.3 
 
 		 396 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>