More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3332 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3332  S-adenosylmethionine synthetase  100 
 
 
389 aa  798    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0532  S-adenosylmethionine synthetase  70.44 
 
 
389 aa  566  1e-160  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.347962  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0690  Methionine adenosyltransferase  70.44 
 
 
389 aa  566  1e-160  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0374372  hitchhiker  0.00000199833 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2521  S-adenosylmethionine synthetase  66.32 
 
 
388 aa  556  1e-157  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1821  S-adenosylmethionine synthetase  67.97 
 
 
385 aa  554  1e-156  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0267535  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1290  S-adenosylmethionine synthetase  68.48 
 
 
389 aa  548  1e-155  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000134106  hitchhiker  0.0000021958 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1880  S-adenosylmethionine synthetase  67.18 
 
 
387 aa  542  1e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000337587  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1341  S-adenosylmethionine synthetase  66.93 
 
 
389 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000125757  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0349  S-adenosylmethionine synthetase  66.84 
 
 
388 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000664302  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2943  S-adenosylmethionine synthetase  66.93 
 
 
389 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2541  S-adenosylmethionine synthetase  66.23 
 
 
399 aa  538  9.999999999999999e-153  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.245618  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1332  S-adenosylmethionine synthetase  66.67 
 
 
389 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000124955  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0470  S-adenosylmethionine synthetase  66.41 
 
 
382 aa  538  9.999999999999999e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0044  S-adenosylmethionine synthetase  65.98 
 
 
388 aa  541  9.999999999999999e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000084119  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1928  S-adenosylmethionine synthetase  65.28 
 
 
389 aa  532  1e-150  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.10598e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0156  S-adenosylmethionine synthetase  65.9 
 
 
387 aa  532  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0201  S-adenosylmethionine synthetase  65.13 
 
 
387 aa  528  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3840  S-adenosylmethionine synthetase  65.19 
 
 
387 aa  526  1e-148  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.50059  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0413  S-adenosylmethionine synthetase  64.68 
 
 
390 aa  526  1e-148  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0737611  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0139  S-adenosylmethionine synthetase  63.24 
 
 
389 aa  522  1e-147  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0351  S-adenosylmethionine synthetase  67.35 
 
 
396 aa  524  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.756862 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2678  S-adenosylmethionine synthetase  63.9 
 
 
403 aa  522  1e-147  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.257721  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4371  S-adenosylmethionine synthetase  67.35 
 
 
396 aa  523  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5604  S-adenosylmethionine synthetase  65.4 
 
 
393 aa  522  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.617182 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0850  S-adenosylmethionine synthetase  63.08 
 
 
388 aa  520  1e-146  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.876069  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2262  S-adenosylmethionine synthetase  63.21 
 
 
385 aa  520  1e-146  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0879  S-adenosylmethionine synthetase  62.69 
 
 
388 aa  519  1e-146  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000307684  hitchhiker  0.000000742555 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0828  S-adenosylmethionine synthetase  62.56 
 
 
388 aa  516  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.296122  normal  0.0311874 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3252  S-adenosylmethionine synthetase  64.56 
 
 
393 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3346  S-adenosylmethionine synthetase  63.73 
 
 
384 aa  516  1.0000000000000001e-145  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.274047  decreased coverage  0.00210424 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0078  S-adenosylmethionine synthetase  66.07 
 
 
395 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0174  S-adenosylmethionine synthetase  65.9 
 
 
395 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02772  S-adenosylmethionine synthetase  62.95 
 
 
384 aa  512  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.374196  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0753  Non-specific protein-tyrosine kinase  62.95 
 
 
384 aa  512  1e-144  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4967  S-adenosylmethionine synthetase  61.9 
 
 
396 aa  511  1e-144  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3549  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3284  S-adenosylmethionine synthetase  62.95 
 
 
384 aa  512  1e-144  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4244  S-adenosylmethionine synthetase  62.95 
 
 
384 aa  512  1e-144  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.908743  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3262  S-adenosylmethionine synthetase  65.9 
 
 
395 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5016  S-adenosylmethionine synthetase  61.9 
 
 
396 aa  511  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.330289 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0188  S-adenosylmethionine synthetase  65.12 
 
 
387 aa  512  1e-144  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0395  S-adenosylmethionine synthetase  65.9 
 
 
395 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3424  S-adenosylmethionine synthetase  65.9 
 
 
395 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2924  S-adenosylmethionine synthetase  65.9 
 
 
395 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3099  S-adenosylmethionine synthetase  65.64 
 
 
395 aa  512  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3880  S-adenosylmethionine synthetase  64.56 
 
 
393 aa  514  1e-144  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.356419  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0385  S-adenosylmethionine synthetase  62.35 
 
 
406 aa  511  1e-144  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2467  S-adenosylmethionine synthetase  65.64 
 
 
395 aa  512  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3331  S-adenosylmethionine synthetase  62.95 
 
 
383 aa  511  1e-144  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02735  hypothetical protein  62.95 
 
 
384 aa  512  1e-144  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0772  S-adenosylmethionine synthetase  62.95 
 
 
384 aa  512  1e-144  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0501612  hitchhiker  0.00139149 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2165  S-adenosylmethionine synthetase  65.9 
 
 
395 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0126  S-adenosylmethionine synthetase  64.56 
 
 
393 aa  512  1e-144  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3099  S-adenosylmethionine synthetase  62.95 
 
 
384 aa  512  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0211  S-adenosylmethionine synthetase  65.9 
 
 
395 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.357003  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3081  S-adenosylmethionine synthetase  65.64 
 
 
395 aa  512  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.735784  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4840  S-adenosylmethionine synthetase  61.9 
 
 
396 aa  511  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.905564  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0199  S-adenosylmethionine synthetase  65.9 
 
 
395 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3084  S-adenosylmethionine synthetase  62.95 
 
 
384 aa  512  1e-144  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.383726  hitchhiker  0.000161028 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05530  S-adenosylmethionine synthetase  62.66 
 
 
396 aa  511  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4320  methionine adenosyltransferase  62.56 
 
 
387 aa  510  1e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238534  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3328  S-adenosylmethionine synthetase  62.44 
 
 
384 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.196348  normal  0.570149 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2992  S-adenosylmethionine synthetase  64.87 
 
 
395 aa  508  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0235224 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3336  S-adenosylmethionine synthetase  62.44 
 
 
384 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.216224  normal  0.254076 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0499  S-adenosylmethionine synthetase  61.65 
 
 
396 aa  510  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3252  S-adenosylmethionine synthetase  62.18 
 
 
384 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0015174  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6431  S-adenosylmethionine synthetase  65.38 
 
 
395 aa  510  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.335957 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3078  S-adenosylmethionine synthetase  65.37 
 
 
407 aa  508  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.138759 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0683  S-adenosylmethionine synthetase  65.4 
 
 
393 aa  508  1e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.842341  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0705  S-adenosylmethionine synthetase  65.4 
 
 
393 aa  509  1e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.102884 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0649  S-adenosylmethionine synthetase  62.41 
 
 
396 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0772  S-adenosylmethionine synthetase  62.18 
 
 
383 aa  508  1e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3251  S-adenosylmethionine synthetase  62.18 
 
 
383 aa  508  1e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3129  S-adenosylmethionine synthetase  64.87 
 
 
395 aa  508  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.965515  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07090  S-adenosylmethionine synthetase  62.41 
 
 
396 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.905662  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3374  S-adenosylmethionine synthetase  62.95 
 
 
384 aa  511  1e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3354  S-adenosylmethionine synthetase  62.18 
 
 
383 aa  508  1e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3263  S-adenosylmethionine synthetase  62.44 
 
 
384 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0673019  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0134  S-adenosylmethionine synthetase  64.87 
 
 
396 aa  505  9.999999999999999e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0929  S-adenosylmethionine synthetase  61.92 
 
 
383 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4844  S-adenosylmethionine synthetase  64.9 
 
 
403 aa  505  9.999999999999999e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.277601 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0087  S-adenosylmethionine synthetase  62.34 
 
 
396 aa  505  9.999999999999999e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000221578  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0454  S-adenosylmethionine synthetase  61.9 
 
 
396 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0871  S-adenosylmethionine synthetase  61.4 
 
 
383 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0053  S-adenosylmethionine synthetase  61.18 
 
 
393 aa  505  9.999999999999999e-143  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0646  S-adenosylmethionine synthetase  61.66 
 
 
383 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00167645  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03161  S-adenosylmethionine synthetase  62.3 
 
 
381 aa  506  9.999999999999999e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3433  S-adenosylmethionine synthetase  62.18 
 
 
384 aa  507  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223184 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3042  S-adenosylmethionine synthetase  62.69 
 
 
396 aa  508  9.999999999999999e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.983396  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1256  S-adenosylmethionine synthetase  60.9 
 
 
395 aa  504  1e-141  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.247936  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0841  S-adenosylmethionine synthetase  62.44 
 
 
384 aa  501  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2004  S-adenosylmethionine synthetase  62.66 
 
 
382 aa  501  1e-141  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3660  S-adenosylmethionine synthetase  62.44 
 
 
383 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.2045 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0036  S-adenosylmethionine synthetase  64.36 
 
 
396 aa  503  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.094057 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0194  S-adenosylmethionine synthetase  64.8 
 
 
387 aa  502  1e-141  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.378325  hitchhiker  0.00256294 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0767  S-adenosylmethionine synthetase  64.94 
 
 
393 aa  504  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3347  S-adenosylmethionine synthetase  62.44 
 
 
384 aa  501  1e-141  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3541  S-adenosylmethionine synthetase  62.44 
 
 
383 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0751  S-adenosylmethionine synthetase  62.18 
 
 
383 aa  501  1e-141  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0979  S-adenosylmethionine synthetase  64.9 
 
 
393 aa  503  1e-141  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0660  S-adenosylmethionine synthetase  63.07 
 
 
395 aa  502  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00877697  decreased coverage  0.0019474 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>