31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_22530 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_22530  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  606  9.999999999999999e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0620133  normal  0.97816 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7557  hypothetical protein  61.25 
 
 		 306 aa  350  2e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5346  hypothetical protein  58.48 
 
 		 299 aa  338  9e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0519478  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1251  hypothetical protein  53.93 
 
 		 352 aa  296  3e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.634667  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3366  hypothetical protein  55.23 
 
 		 287 aa  292  4e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0176  hypothetical protein  54.74 
 
 		 286 aa  290  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3096  hypothetical protein  52.98 
 
 		 298 aa  290  2e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162649  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4107  hypothetical protein  54.06 
 
 		 289 aa  290  2e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95146  normal  0.291727 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0741  hypothetical protein  55.59 
 
 		 310 aa  290  3e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0803  hypothetical protein  49.68 
 
 		 337 aa  287  2e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0684  hypothetical protein  51.01 
 
 		 320 aa  286  2.9999999999999996e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3631  hypothetical protein  57.85 
 
 		 294 aa  281  6.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1140  hypothetical protein  52.14 
 
 		 296 aa  281  1e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.27456  hitchhiker  0.0000372843 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0546  hypothetical protein  48.32 
 
 		 303 aa  280  3e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2766  hypothetical protein  50.34 
 
 		 295 aa  278  6e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.512718  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2843  hypothetical protein  53.15 
 
 		 305 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.858977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0087  hypothetical protein  51.71 
 
 		 312 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3340  hypothetical protein  50.84 
 
 		 303 aa  268  7e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2319  hypothetical protein  53.55 
 
 		 296 aa  268  1e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4844  hypothetical protein  55.32 
 
 		 292 aa  268  1e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10940  hypothetical protein  50.17 
 
 		 295 aa  263  2e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.470015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2816  hypothetical protein  54.14 
 
 		 285 aa  263  4e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2860  hypothetical protein  54.14 
 
 		 285 aa  263  4e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1559  hypothetical protein  49.82 
 
 		 306 aa  257  2e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45924  normal  0.720346 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1692  hypothetical protein  49 
 
 		 311 aa  256  4e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0199822 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1195  hypothetical protein  49.83 
 
 		 297 aa  255  6e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.232194  normal  0.297038 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09900  hypothetical protein  47.6 
 
 		 321 aa  255  7e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0834598 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0854  hypothetical protein  48.2 
 
 		 322 aa  249  4e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2372  hypothetical protein  51.94 
 
 		 296 aa  243  3.9999999999999997e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02590  hypothetical protein  46.39 
 
 		 356 aa  237  2e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.751397  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18640  hypothetical protein  57.23 
 
 		 339 aa  190  2e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.922514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>