31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4107 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_4107  hypothetical protein  100 
 
 
289 aa  574  1.0000000000000001e-163  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95146  normal  0.291727 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7557  hypothetical protein  62.2 
 
 
306 aa  344  8e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10940  hypothetical protein  60.14 
 
 
295 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.470015  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5346  hypothetical protein  54.93 
 
 
299 aa  312  3.9999999999999997e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0519478  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0741  hypothetical protein  62.45 
 
 
310 aa  310  2e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1692  hypothetical protein  57.24 
 
 
311 aa  307  2.0000000000000002e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0199822 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3631  hypothetical protein  58.19 
 
 
294 aa  301  8.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1195  hypothetical protein  56.99 
 
 
297 aa  300  1e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.232194  normal  0.297038 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0546  hypothetical protein  51.69 
 
 
303 aa  299  3e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2372  hypothetical protein  62.26 
 
 
296 aa  295  5e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4844  hypothetical protein  61.21 
 
 
292 aa  295  6e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1251  hypothetical protein  55.4 
 
 
352 aa  294  9e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.634667  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0684  hypothetical protein  53.14 
 
 
320 aa  292  3e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3340  hypothetical protein  54.85 
 
 
303 aa  290  1e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22530  hypothetical protein  54.06 
 
 
296 aa  290  2e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0620133  normal  0.97816 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3366  hypothetical protein  56.07 
 
 
287 aa  290  3e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0854  hypothetical protein  54.04 
 
 
322 aa  290  3e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09900  hypothetical protein  54.18 
 
 
321 aa  287  1e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0834598 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1140  hypothetical protein  53.24 
 
 
296 aa  286  2e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.27456  hitchhiker  0.0000372843 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0176  hypothetical protein  54.68 
 
 
286 aa  285  5.999999999999999e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1559  hypothetical protein  58.95 
 
 
306 aa  282  5.000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45924  normal  0.720346 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3096  hypothetical protein  54.87 
 
 
298 aa  281  8.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162649  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02590  hypothetical protein  52.31 
 
 
356 aa  277  1e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.751397  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2843  hypothetical protein  54.04 
 
 
305 aa  269  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.858977  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2766  hypothetical protein  53.96 
 
 
295 aa  268  7e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.512718  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0803  hypothetical protein  48.24 
 
 
337 aa  266  2e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2816  hypothetical protein  57.14 
 
 
285 aa  259  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2860  hypothetical protein  57.14 
 
 
285 aa  259  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18640  hypothetical protein  48.36 
 
 
339 aa  256  2e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.922514  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2319  hypothetical protein  54.87 
 
 
296 aa  253  2.0000000000000002e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0087  hypothetical protein  50 
 
 
312 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>