31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3340 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3340  hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  609  1e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1251  hypothetical protein  55.07 
 
 		 352 aa  301  9e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.634667  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4107  hypothetical protein  54.85 
 
 		 289 aa  299  4e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95146  normal  0.291727 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1140  hypothetical protein  55.33 
 
 		 296 aa  296  4e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.27456  hitchhiker  0.0000372843 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0176  hypothetical protein  54.3 
 
 		 286 aa  292  4e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7557  hypothetical protein  53.9 
 
 		 306 aa  289  3e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3631  hypothetical protein  55.79 
 
 		 294 aa  287  2e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09900  hypothetical protein  55 
 
 		 321 aa  286  2e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0834598 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10940  hypothetical protein  57.4 
 
 		 295 aa  285  5e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.470015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0546  hypothetical protein  49.66 
 
 		 303 aa  278  1e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22530  hypothetical protein  51.51 
 
 		 296 aa  277  1e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0620133  normal  0.97816 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0684  hypothetical protein  50.84 
 
 		 320 aa  275  5e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3096  hypothetical protein  50.67 
 
 		 298 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162649  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5346  hypothetical protein  49.5 
 
 		 299 aa  273  3e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0519478  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0854  hypothetical protein  52.38 
 
 		 322 aa  273  3e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0803  hypothetical protein  50 
 
 		 337 aa  272  5.000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3366  hypothetical protein  51.19 
 
 		 287 aa  267  2e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2843  hypothetical protein  52.3 
 
 		 305 aa  265  5e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.858977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2766  hypothetical protein  49.66 
 
 		 295 aa  261  8.999999999999999e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.512718  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2319  hypothetical protein  54.92 
 
 		 296 aa  261  1e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4844  hypothetical protein  54.36 
 
 		 292 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2860  hypothetical protein  54.06 
 
 		 285 aa  252  6e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2816  hypothetical protein  54.06 
 
 		 285 aa  252  6e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0741  hypothetical protein  53.03 
 
 		 310 aa  251  1e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2372  hypothetical protein  53.61 
 
 		 296 aa  243  3e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1195  hypothetical protein  48.84 
 
 		 297 aa  241  1e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.232194  normal  0.297038 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02590  hypothetical protein  49.19 
 
 		 356 aa  237  2e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.751397  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1692  hypothetical protein  45.13 
 
 		 311 aa  235  5.0000000000000005e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0199822 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18640  hypothetical protein  46.1 
 
 		 339 aa  224  2e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.922514  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1559  hypothetical protein  49.46 
 
 		 306 aa  219  3.9999999999999997e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45924  normal  0.720346 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0087  hypothetical protein  45.91 
 
 		 312 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>