31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1559 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1559  hypothetical protein  100 
 
 
306 aa  613  9.999999999999999e-175  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45924  normal  0.720346 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1195  hypothetical protein  60.07 
 
 
297 aa  329  4e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.232194  normal  0.297038 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4844  hypothetical protein  62.72 
 
 
292 aa  310  2e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4107  hypothetical protein  58.95 
 
 
289 aa  291  7e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95146  normal  0.291727 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0546  hypothetical protein  51.19 
 
 
303 aa  287  1e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2372  hypothetical protein  60.32 
 
 
296 aa  286  4e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0741  hypothetical protein  56.87 
 
 
310 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0684  hypothetical protein  51.36 
 
 
320 aa  281  1e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7557  hypothetical protein  54.27 
 
 
306 aa  279  4e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10940  hypothetical protein  53.31 
 
 
295 aa  275  8e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.470015  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0854  hypothetical protein  53.27 
 
 
322 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3631  hypothetical protein  56.11 
 
 
294 aa  270  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1692  hypothetical protein  51.86 
 
 
311 aa  268  5.9999999999999995e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0199822 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5346  hypothetical protein  48.44 
 
 
299 aa  266  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0519478  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09900  hypothetical protein  50.17 
 
 
321 aa  267  2e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0834598 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22530  hypothetical protein  49.82 
 
 
296 aa  260  2e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0620133  normal  0.97816 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2766  hypothetical protein  50 
 
 
295 aa  260  3e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.512718  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1251  hypothetical protein  52.38 
 
 
352 aa  256  5e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.634667  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1140  hypothetical protein  51.23 
 
 
296 aa  253  3e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.27456  hitchhiker  0.0000372843 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0176  hypothetical protein  54.45 
 
 
286 aa  250  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2319  hypothetical protein  52.98 
 
 
296 aa  249  4e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3366  hypothetical protein  49.64 
 
 
287 aa  247  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18640  hypothetical protein  47.67 
 
 
339 aa  239  2.9999999999999997e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.922514  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3096  hypothetical protein  48.38 
 
 
298 aa  239  5e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162649  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02590  hypothetical protein  48.77 
 
 
356 aa  236  3e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.751397  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0803  hypothetical protein  43.87 
 
 
337 aa  221  9.999999999999999e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3340  hypothetical protein  47.78 
 
 
303 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2843  hypothetical protein  47.02 
 
 
305 aa  219  7e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.858977  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0087  hypothetical protein  47.86 
 
 
312 aa  218  1e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2860  hypothetical protein  50 
 
 
285 aa  216  4e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2816  hypothetical protein  50 
 
 
285 aa  216  4e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>