31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1140 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1140  hypothetical protein  100 
 
 
296 aa  600  1e-170  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.27456  hitchhiker  0.0000372843 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1251  hypothetical protein  87.63 
 
 
352 aa  521  1e-147  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.634667  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0176  hypothetical protein  68.1 
 
 
286 aa  371  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0684  hypothetical protein  54.27 
 
 
320 aa  311  6.999999999999999e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7557  hypothetical protein  55.99 
 
 
306 aa  307  1.0000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3631  hypothetical protein  60.75 
 
 
294 aa  306  3e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0546  hypothetical protein  52.56 
 
 
303 aa  306  3e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5346  hypothetical protein  52.72 
 
 
299 aa  302  5.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0519478  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0854  hypothetical protein  51.54 
 
 
322 aa  290  3e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3340  hypothetical protein  55.33 
 
 
303 aa  289  5.0000000000000004e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4107  hypothetical protein  53.24 
 
 
289 aa  286  2e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95146  normal  0.291727 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0803  hypothetical protein  49.19 
 
 
337 aa  283  3.0000000000000004e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22530  hypothetical protein  52.14 
 
 
296 aa  281  1e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0620133  normal  0.97816 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3096  hypothetical protein  53.1 
 
 
298 aa  278  8e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162649  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10940  hypothetical protein  53.47 
 
 
295 aa  272  4.0000000000000004e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.470015  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3366  hypothetical protein  54.78 
 
 
287 aa  272  5.000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4844  hypothetical protein  57.19 
 
 
292 aa  270  2e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0741  hypothetical protein  55.08 
 
 
310 aa  265  7e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0087  hypothetical protein  52.69 
 
 
312 aa  264  2e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09900  hypothetical protein  48.85 
 
 
321 aa  260  2e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0834598 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2766  hypothetical protein  52.35 
 
 
295 aa  260  2e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.512718  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2843  hypothetical protein  53.26 
 
 
305 aa  258  6e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.858977  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1195  hypothetical protein  53.38 
 
 
297 aa  258  8e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.232194  normal  0.297038 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2372  hypothetical protein  54.66 
 
 
296 aa  258  1e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1692  hypothetical protein  48 
 
 
311 aa  250  2e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0199822 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2319  hypothetical protein  52.33 
 
 
296 aa  249  4e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2816  hypothetical protein  54.83 
 
 
285 aa  249  4e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2860  hypothetical protein  54.83 
 
 
285 aa  249  4e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1559  hypothetical protein  52.99 
 
 
306 aa  248  1e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45924  normal  0.720346 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02590  hypothetical protein  47.3 
 
 
356 aa  242  6e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.751397  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18640  hypothetical protein  45.07 
 
 
339 aa  229  3e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.922514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>