31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5346 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5346  hypothetical protein  100 
 
 		 299 aa  610  9.999999999999999e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0519478  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7557  hypothetical protein  60.82 
 
 		 306 aa  366  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22530  hypothetical protein  58.48 
 
 		 296 aa  338  9e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0620133  normal  0.97816 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4107  hypothetical protein  54.93 
 
 		 289 aa  312  3.9999999999999997e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95146  normal  0.291727 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0684  hypothetical protein  51.74 
 
 		 320 aa  311  5.999999999999999e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1251  hypothetical protein  55.76 
 
 		 352 aa  310  2e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.634667  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1140  hypothetical protein  52.72 
 
 		 296 aa  302  5.000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.27456  hitchhiker  0.0000372843 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0546  hypothetical protein  48.01 
 
 		 303 aa  300  2e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3631  hypothetical protein  55.02 
 
 		 294 aa  297  2e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0176  hypothetical protein  54.9 
 
 		 286 aa  296  4e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0803  hypothetical protein  48.9 
 
 		 337 aa  290  2e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3096  hypothetical protein  52.88 
 
 		 298 aa  289  4e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162649  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2372  hypothetical protein  58.57 
 
 		 296 aa  289  4e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10940  hypothetical protein  54.3 
 
 		 295 aa  288  8e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.470015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4844  hypothetical protein  56.18 
 
 		 292 aa  287  1e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0741  hypothetical protein  56.03 
 
 		 310 aa  287  2e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3366  hypothetical protein  53.14 
 
 		 287 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2843  hypothetical protein  52.07 
 
 		 305 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.858977  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1195  hypothetical protein  51.39 
 
 		 297 aa  278  1e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.232194  normal  0.297038 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1692  hypothetical protein  50.65 
 
 		 311 aa  276  2e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0199822 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2766  hypothetical protein  51.8 
 
 		 295 aa  276  2e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.512718  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0854  hypothetical protein  50.52 
 
 		 322 aa  276  3e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2816  hypothetical protein  53.51 
 
 		 285 aa  272  6e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2860  hypothetical protein  53.51 
 
 		 285 aa  272  6e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09900  hypothetical protein  49.5 
 
 		 321 aa  269  5e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0834598 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02590  hypothetical protein  46.08 
 
 		 356 aa  267  1e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.751397  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3340  hypothetical protein  49.5 
 
 		 303 aa  266  2e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2319  hypothetical protein  50.68 
 
 		 296 aa  267  2e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1559  hypothetical protein  48.44 
 
 		 306 aa  263  2e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45924  normal  0.720346 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0087  hypothetical protein  49.44 
 
 		 312 aa  260  2e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18640  hypothetical protein  45.21 
 
 		 339 aa  243  3e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.922514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>