31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_10940 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_10940  hypothetical protein  100 
 
 
295 aa  602  1.0000000000000001e-171  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.470015  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2372  hypothetical protein  68.82 
 
 
296 aa  348  8e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4844  hypothetical protein  65.6 
 
 
292 aa  346  3e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1692  hypothetical protein  58.47 
 
 
311 aa  337  9.999999999999999e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0199822 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1195  hypothetical protein  62.07 
 
 
297 aa  334  1e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.232194  normal  0.297038 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4107  hypothetical protein  60.34 
 
 
289 aa  330  2e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95146  normal  0.291727 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0741  hypothetical protein  59.69 
 
 
310 aa  298  8e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1251  hypothetical protein  55.02 
 
 
352 aa  296  4e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.634667  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7557  hypothetical protein  54.67 
 
 
306 aa  295  5e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5346  hypothetical protein  54.3 
 
 
299 aa  295  5e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0519478  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3631  hypothetical protein  55.51 
 
 
294 aa  295  6e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0546  hypothetical protein  50.83 
 
 
303 aa  290  2e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0684  hypothetical protein  51.69 
 
 
320 aa  288  1e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1140  hypothetical protein  53.47 
 
 
296 aa  285  8e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.27456  hitchhiker  0.0000372843 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0854  hypothetical protein  52.54 
 
 
322 aa  285  9e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3340  hypothetical protein  54.46 
 
 
303 aa  280  1e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0176  hypothetical protein  52.25 
 
 
286 aa  277  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3096  hypothetical protein  51.21 
 
 
298 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162649  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1559  hypothetical protein  53.31 
 
 
306 aa  273  3e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45924  normal  0.720346 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2319  hypothetical protein  53.19 
 
 
296 aa  270  2.9999999999999997e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3366  hypothetical protein  51.25 
 
 
287 aa  268  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22530  hypothetical protein  50.17 
 
 
296 aa  268  7e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0620133  normal  0.97816 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09900  hypothetical protein  50.99 
 
 
321 aa  266  2e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0834598 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02590  hypothetical protein  50.31 
 
 
356 aa  259  5.0000000000000005e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.751397  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2843  hypothetical protein  50.17 
 
 
305 aa  255  5e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.858977  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2766  hypothetical protein  49.31 
 
 
295 aa  252  6e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.512718  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18640  hypothetical protein  48.14 
 
 
339 aa  249  3e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.922514  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2860  hypothetical protein  51.67 
 
 
285 aa  249  4e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2816  hypothetical protein  51.67 
 
 
285 aa  249  4e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0803  hypothetical protein  46.35 
 
 
337 aa  243  1.9999999999999999e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0087  hypothetical protein  49.81 
 
 
312 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>