31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0087 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0087  hypothetical protein  100 
 
 		 312 aa  632  1e-180  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22530  hypothetical protein  50.69 
 
 		 296 aa  284  1.0000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0620133  normal  0.97816 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1251  hypothetical protein  51.19 
 
 		 352 aa  281  1e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.634667  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7557  hypothetical protein  52.08 
 
 		 306 aa  278  7e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1140  hypothetical protein  51.24 
 
 		 296 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.27456  hitchhiker  0.0000372843 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5346  hypothetical protein  49.47 
 
 		 299 aa  272  6e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0519478  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0176  hypothetical protein  50.52 
 
 		 286 aa  263  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3366  hypothetical protein  49.45 
 
 		 287 aa  260  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3096  hypothetical protein  48.1 
 
 		 298 aa  256  4e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162649  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3631  hypothetical protein  50 
 
 		 294 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0546  hypothetical protein  47.04 
 
 		 303 aa  249  3e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2766  hypothetical protein  48.12 
 
 		 295 aa  246  3e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.512718  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0684  hypothetical protein  47.44 
 
 		 320 aa  244  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4107  hypothetical protein  48.38 
 
 		 289 aa  243  3e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95146  normal  0.291727 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2319  hypothetical protein  50.69 
 
 		 296 aa  242  5e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1692  hypothetical protein  46.76 
 
 		 311 aa  239  2.9999999999999997e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0199822 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0803  hypothetical protein  45.19 
 
 		 337 aa  235  9e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4844  hypothetical protein  49.3 
 
 		 292 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10940  hypothetical protein  49.81 
 
 		 295 aa  233  3e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.470015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0741  hypothetical protein  47.39 
 
 		 310 aa  228  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1195  hypothetical protein  45.54 
 
 		 297 aa  225  6e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.232194  normal  0.297038 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3340  hypothetical protein  46.13 
 
 		 303 aa  224  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2372  hypothetical protein  49.8 
 
 		 296 aa  222  6e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0854  hypothetical protein  47 
 
 		 322 aa  221  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2843  hypothetical protein  45.33 
 
 		 305 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.858977  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1559  hypothetical protein  47.12 
 
 		 306 aa  218  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45924  normal  0.720346 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09900  hypothetical protein  43.57 
 
 		 321 aa  216  2.9999999999999998e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0834598 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2860  hypothetical protein  47.29 
 
 		 285 aa  215  7e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2816  hypothetical protein  47.29 
 
 		 285 aa  215  7e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02590  hypothetical protein  44.16 
 
 		 356 aa  210  2e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.751397  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18640  hypothetical protein  40 
 
 		 339 aa  189  5.999999999999999e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.922514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>