75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0452 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0452  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  157  3e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1432  hypothetical protein  55 
 
 		 80 aa  89.4  2e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0727534  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1037  hypothetical protein  55 
 
 		 81 aa  88.2  3e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0558589  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1648  hypothetical protein  56.41 
 
 		 81 aa  87.8  4e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0558  hypothetical protein  51.95 
 
 		 80 aa  85.5  2e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1295  hypothetical protein  51.25 
 
 		 80 aa  82.8  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0734  hypothetical protein  51.25 
 
 		 80 aa  82  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.213275  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0811  hypothetical protein  51.25 
 
 		 80 aa  82  0.000000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.266588  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0995  hypothetical protein  48.75 
 
 		 81 aa  78.2  0.00000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.889011  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1618  hypothetical protein  36.36 
 
 		 82 aa  53.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0250504  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2084  hypothetical protein  33.33 
 
 		 80 aa  51.2  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1093  R-binding protein (contains KH domain)  36.92 
 
 		 80 aa  50.1  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  5.71907e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0968  hypothetical protein  34.67 
 
 		 76 aa  48.9  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000604549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2143  hypothetical protein  34.85 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1662  RNA-binding protein  37.29 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000201798  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2886  hypothetical protein  34.85 
 
 		 77 aa  48.1  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.404491 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3759  hypothetical protein  28.77 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0453276  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1496  nucleic acid binding protein  36.84 
 
 		 78 aa  48.5  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0525102  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0969  RNA-binding protein  35.44 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000537782  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07310  nucleic acid binding protein, containing KH domain  32.88 
 
 		 75 aa  47  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.97111e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2998  hypothetical protein  31.82 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000253135  normal  0.811405 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3040  hypothetical protein  31.82 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000354702  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3593  hypothetical protein  30.67 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3306  RNA-binding protein (KH domain)  34.85 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0298  hypothetical protein  36.11 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000067955  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1053  hypothetical protein  36.51 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1353  RNA-binding protein (contains KH domain)-like protein  25.37 
 
 		 89 aa  45.4  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000330341  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1149  hypothetical protein  30.67 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0258994 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1802  hypothetical protein  32.26 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.116861  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2222  hypothetical protein  29.33 
 
 		 80 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000657625 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3191  hypothetical protein  35.38 
 
 		 81 aa  45.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.954364  normal  0.892869 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1198  hypothetical protein  36.51 
 
 		 75 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00403857  normal  0.0990302 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5925  hypothetical protein  27.27 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.159157  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2024  hypothetical protein  33.33 
 
 		 77 aa  44.7  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000350692  normal  0.0107931 
 
 
-
 
NC_002620  TC0030  hypothetical protein  30.56 
 
 		 78 aa  44.7  0.0005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00000268476  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0325  hypothetical protein  31.34 
 
 		 77 aa  44.3  0.0006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.851867 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1370  RNA-binding protein (KH domain)  31.58 
 
 		 76 aa  44.3  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209331  normal  0.279466 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0768  nucleic acid binding protein  30.26 
 
 		 76 aa  43.9  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000813244  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2188  hypothetical protein  27.27 
 
 		 80 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0391463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4174  hypothetical protein  27.27 
 
 		 80 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1946  hypothetical protein  27.27 
 
 		 80 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.801249  normal  0.846266 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2012  hypothetical protein  27.27 
 
 		 80 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.313357 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1966  hypothetical protein  27.27 
 
 		 80 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.179038  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1980  RNA-binding protein  36.99 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12922  hypothetical protein  27.27 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.856852  normal  0.613221 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1168  hypothetical protein  31.34 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225392  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0882  hypothetical protein  32 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000154321  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1357  KH domain-containing protein  29.23 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000570865  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0711  nucleic acid binding protein  26.67 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000841646  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2482  hypothetical protein  26.67 
 
 		 80 aa  42.7  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0272988  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1471  KH domain protein  30.88 
 
 		 79 aa  42.7  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0670497 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2277  hypothetical protein  36.84 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0054158  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3492  KH, type 1, domain protein  33.85 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.05823e-30 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1008  RNA-binding protein (KH domain)  30 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0103799  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0021  hypothetical protein  30.56 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.055536  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3259  hypothetical protein  29.41 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3430  KH, type 1, domain protein  33.85 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000151777  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1415  hypothetical protein  30.77 
 
 		 75 aa  42  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00178468  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1711  hypothetical protein  34.67 
 
 		 75 aa  42  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000142636  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00320  RNA-binding protein (KH domain)  33.9 
 
 		 84 aa  42  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000739144  hitchhiker  0.00000000000355006 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2308  hypothetical protein  31.75 
 
 		 78 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000463939  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2870  KH, type 1  32.31 
 
 		 76 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000364358  hitchhiker  0.000000513189 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1683  hypothetical protein  33.85 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000180762  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1965  hypothetical protein  33.85 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.780518  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1399  hypothetical protein  28 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00422733 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3135  KH domain-containing protein  29.33 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.020256  normal  0.101558 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0657  hypothetical protein  32 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000412714  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1633  RNA-binding protein  28.99 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0644  KH domain-containing protein  30.77 
 
 		 76 aa  40.8  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.20541  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0986  KH domain protein  30 
 
 		 79 aa  40.4  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.0000000000116002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2054  hypothetical protein  32.81 
 
 		 75 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000563212  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1389  RNA-binding protein  27.94 
 
 		 73 aa  40.4  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0563249  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1513  hypothetical protein  28 
 
 		 79 aa  40.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.155704 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09760  hypothetical protein  29.73 
 
 		 79 aa  40  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0801933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0515  hypothetical protein  38.6 
 
 		 84 aa  40  0.01  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>