127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1389 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1389  RNA-binding protein  100 
 
 		 73 aa  135  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0563249  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3759  hypothetical protein  52.11 
 
 		 76 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0453276  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0968  hypothetical protein  52.11 
 
 		 76 aa  67.4  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000604549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1089  nucleic acid binding protein  47.95 
 
 		 83 aa  67  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000185572  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0768  nucleic acid binding protein  49.3 
 
 		 76 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000813244  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1415  hypothetical protein  50.7 
 
 		 75 aa  65.9  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00178468  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1980  RNA-binding protein  50.68 
 
 		 78 aa  65.5  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1353  RNA-binding protein (contains KH domain)-like protein  49.28 
 
 		 89 aa  64.7  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000330341  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1198  hypothetical protein  47.89 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00403857  normal  0.0990302 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2054  hypothetical protein  49.3 
 
 		 75 aa  64.3  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000563212  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0021  hypothetical protein  42.25 
 
 		 78 aa  63.9  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.055536  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1802  hypothetical protein  43.66 
 
 		 76 aa  63.9  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.116861  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1379  KH domain protein  48 
 
 		 84 aa  62.8  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000155975  normal  0.609629 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1711  hypothetical protein  46.48 
 
 		 75 aa  62.4  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000142636  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0711  nucleic acid binding protein  46.48 
 
 		 77 aa  62.8  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000841646  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1965  hypothetical protein  43.66 
 
 		 75 aa  61.2  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.780518  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1683  hypothetical protein  43.66 
 
 		 75 aa  61.2  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000180762  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0657  hypothetical protein  49.3 
 
 		 75 aa  61.6  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000412714  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1496  nucleic acid binding protein  43.66 
 
 		 78 aa  60.5  0.000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0525102  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1370  RNA-binding protein (KH domain)  45.07 
 
 		 76 aa  60.5  0.000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209331  normal  0.279466 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2873  RNA-binding protein  41.1 
 
 		 84 aa  60.1  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2998  hypothetical protein  43.66 
 
 		 77 aa  59.7  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000253135  normal  0.811405 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3040  hypothetical protein  43.66 
 
 		 77 aa  59.7  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000354702  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07310  nucleic acid binding protein, containing KH domain  45.07 
 
 		 75 aa  60.1  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.97111e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0969  RNA-binding protein  46.48 
 
 		 77 aa  59.7  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000537782  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2771  hypothetical protein  43.84 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.341296 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2143  hypothetical protein  40.85 
 
 		 77 aa  57.8  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2308  hypothetical protein  36.62 
 
 		 78 aa  56.6  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000463939  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2886  hypothetical protein  40.85 
 
 		 77 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.404491 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2024  hypothetical protein  45.33 
 
 		 77 aa  55.5  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000350692  normal  0.0107931 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2223  RNA-binding protein  39.73 
 
 		 77 aa  54.7  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.17627e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00320  RNA-binding protein (KH domain)  45.95 
 
 		 84 aa  54.7  0.0000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000739144  hitchhiker  0.00000000000355006 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2482  hypothetical protein  47.22 
 
 		 80 aa  54.3  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0272988  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1093  R-binding protein (contains KH domain)  38.36 
 
 		 80 aa  54.3  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  5.71907e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3306  RNA-binding protein (KH domain)  38.03 
 
 		 77 aa  53.9  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2407  RNA binding protein  46.48 
 
 		 76 aa  53.9  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000104085  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3681  hypothetical protein  54.67 
 
 		 77 aa  53.5  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.989233 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0882  hypothetical protein  35.62 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000154321  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1662  RNA-binding protein  44.78 
 
 		 79 aa  52.8  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000201798  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1097  KH domain-containing protein  36.36 
 
 		 76 aa  52.8  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00599879  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0689  RNA-binding protein (contains KH domain protein)-like protein  42.47 
 
 		 100 aa  52.8  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000409438  hitchhiker  0.000420996 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1416  KH type 2 domain protein  48.15 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000861561  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2495  KH domain-containing protein  33.8 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000287664  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1955  RNA-binding protein (contains KH domain)-like protein  34.62 
 
 		 145 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1982  RNA-binding protein contains KH domain  34.62 
 
 		 145 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000742091  normal  0.027281 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0644  KH domain-containing protein  37.88 
 
 		 76 aa  51.2  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.20541  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3694  KH domain-containing protein  32.39 
 
 		 75 aa  51.2  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000170601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3584  hypothetical protein  32.39 
 
 		 75 aa  51.2  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  7.1205e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3602  hypothetical protein  32.39 
 
 		 75 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000183566  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0325  hypothetical protein  50 
 
 		 77 aa  51.6  0.000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.851867 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1098  hypothetical protein  43.66 
 
 		 77 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.337348  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3981  kh domain-containing protein  32.39 
 
 		 75 aa  51.2  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000103911  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3191  hypothetical protein  36.49 
 
 		 81 aa  51.6  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.954364  normal  0.892869 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1053  hypothetical protein  43.48 
 
 		 77 aa  51.6  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3857  KH domain protein  32.39 
 
 		 75 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.50741e-63 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1301  KH domain protein  33.8 
 
 		 75 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000106186  unclonable  4.49317e-26 
 
 
-
 
NC_002620  TC0030  hypothetical protein  36.62 
 
 		 78 aa  50.8  0.000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00000268476  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3885  KH domain-containing protein  32.39 
 
 		 77 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000801997  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3891  KH domain protein  32.39 
 
 		 75 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000683055  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1665  RNA-binding protein  39.44 
 
 		 75 aa  50.4  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00331015  hitchhiker  0.0035897 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1536  hypothetical protein  43.66 
 
 		 76 aa  50.8  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000921217  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3942  KH domain protein  33.8 
 
 		 75 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2870  KH, type 1  36.36 
 
 		 76 aa  50.4  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000364358  hitchhiker  0.000000513189 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10980  predicted RNA-binding protein (contains KH domain)  43.06 
 
 		 85 aa  50.4  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000425582  unclonable  0.00000000129686 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1288  RNA-binding protein  39.44 
 
 		 75 aa  50.1  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1153  hypothetical protein  34.67 
 
 		 86 aa  49.7  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000910841  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2451  KH, type 1  36.36 
 
 		 76 aa  50.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000946472  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2222  hypothetical protein  44.44 
 
 		 80 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000657625 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09160  RNA-binding protein (KH domain)  47.14 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.880979  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1828  KH domain protein  47.22 
 
 		 80 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0800729 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1302  RNA-binding protein  34.78 
 
 		 74 aa  49.7  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0145961  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0144  hypothetical protein  34.29 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1357  KH domain-containing protein  32.84 
 
 		 80 aa  48.9  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000570865  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1915  hypothetical protein  38.36 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4620  RNA-binding protein  36.62 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000138257  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1964  hypothetical protein  38.36 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3430  KH, type 1, domain protein  38.24 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000151777  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2049  hypothetical protein  38.36 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.24767  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3492  KH, type 1, domain protein  38.24 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.05823e-30 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1144  hypothetical protein  38.36 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0142983  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2537  RNA-binding protein  37.33 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.0000157008  hitchhiker  0.00858549 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3259  hypothetical protein  39.71 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0741  nucleic acid binding protein  34.25 
 
 		 76 aa  48.1  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000419264 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5263  hypothetical protein  31.51 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.133032 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2673  RNA-binding protein  36.62 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0307943  hitchhiker  0.000000249091 
 
 
-
 
NC_002936  DET0567  hypothetical protein  33.8 
 
 		 75 aa  47.8  0.00005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000283736  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0541  RNA-binding protein  33.8 
 
 		 75 aa  47.8  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000338376  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2484  hypothetical protein  42.25 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.307356  normal  0.0960176 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3422  KH domain-containing protein  45.21 
 
 		 80 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0313217  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_506  hypothetical protein  35.82 
 
 		 75 aa  47.4  0.00006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000251154  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2539  hypothetical protein  45.9 
 
 		 78 aa  47.4  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160005  normal  0.11735 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3762  KH domain-containing protein  36.36 
 
 		 76 aa  47  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000539033  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3666  RNA binding protein  30.99 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000056756  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1773  hypothetical protein  34.25 
 
 		 105 aa  45.4  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1505  RNA-binding protein  32.84 
 
 		 82 aa  46.2  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000348163  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1168  RNA-binding protein (KH domain)  45.61 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1633  RNA-binding protein  35.21 
 
 		 81 aa  45.4  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1399  hypothetical protein  41.67 
 
 		 79 aa  45.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00422733 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1168  hypothetical protein  38.24 
 
 		 79 aa  45.4  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225392  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2182  KH domain-containing protein  41.67 
 
 		 75 aa  45.1  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.161429  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>