38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1648 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1648  hypothetical protein  100 
 
 		 81 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1432  hypothetical protein  64.1 
 
 		 80 aa  105  2e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0727534  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1037  hypothetical protein  58.02 
 
 		 81 aa  99.8  1e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0558589  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0995  hypothetical protein  54.32 
 
 		 81 aa  98.6  3e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.889011  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1295  hypothetical protein  55.13 
 
 		 80 aa  97.4  6e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0811  hypothetical protein  55.13 
 
 		 80 aa  96.3  1e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.266588  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0734  hypothetical protein  55.13 
 
 		 80 aa  96.3  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.213275  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0558  hypothetical protein  53.75 
 
 		 80 aa  89.7  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0452  hypothetical protein  56.41 
 
 		 79 aa  87.8  4e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1980  RNA-binding protein  35 
 
 		 78 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0882  hypothetical protein  36.36 
 
 		 77 aa  47.8  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000154321  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3759  hypothetical protein  35.29 
 
 		 76 aa  47.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0453276  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1496  nucleic acid binding protein  40.58 
 
 		 78 aa  47  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0525102  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1633  RNA-binding protein  29.87 
 
 		 81 aa  46.2  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3040  hypothetical protein  35.29 
 
 		 77 aa  45.1  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000354702  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2998  hypothetical protein  35.29 
 
 		 77 aa  45.1  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000253135  normal  0.811405 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1513  hypothetical protein  38.67 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.155704 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1153  hypothetical protein  27.5 
 
 		 86 aa  44.3  0.0006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000910841  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2308  hypothetical protein  37.31 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000463939  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0663  hypothetical protein  40.32 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.82455  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4007  hypothetical protein  35.29 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1149  hypothetical protein  35.29 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0258994 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0644  KH domain-containing protein  31.88 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.20541  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07310  nucleic acid binding protein, containing KH domain  31.88 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.97111e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09160  RNA-binding protein (KH domain)  33.33 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.880979  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2143  hypothetical protein  33.82 
 
 		 77 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0980  hypothetical protein  36.92 
 
 		 75 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.747535  normal  0.258716 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2870  KH, type 1  30.88 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000364358  hitchhiker  0.000000513189 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2188  hypothetical protein  34.92 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0391463  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2539  hypothetical protein  32.35 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160005  normal  0.11735 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0969  RNA-binding protein  37.5 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000537782  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3306  RNA-binding protein (KH domain)  35.29 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1168  RNA-binding protein (KH domain)  34.29 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1008  RNA-binding protein (KH domain)  34.48 
 
 		 74 aa  40.8  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0103799  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3593  hypothetical protein  32.35 
 
 		 77 aa  40.4  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12922  hypothetical protein  34.92 
 
 		 80 aa  40.4  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.856852  normal  0.613221 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3259  hypothetical protein  31.43 
 
 		 80 aa  40.4  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1471  KH domain protein  32.86 
 
 		 79 aa  40  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0670497 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>