18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1432 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1432  hypothetical protein  100 
 
 
80 aa  159  1e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0727534  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1037  hypothetical protein  78.75 
 
 
81 aa  122  2e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0558589  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0995  hypothetical protein  75 
 
 
81 aa  118  3e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.889011  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1295  hypothetical protein  71.25 
 
 
80 aa  117  3.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0811  hypothetical protein  71.25 
 
 
80 aa  117  7e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.266588  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0734  hypothetical protein  71.25 
 
 
80 aa  117  7e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.213275  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1648  hypothetical protein  64.1 
 
 
81 aa  105  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0558  hypothetical protein  67.5 
 
 
80 aa  97.4  6e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0452  hypothetical protein  55 
 
 
79 aa  89.4  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1980  RNA-binding protein  41.79 
 
 
78 aa  45.4  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3759  hypothetical protein  33.82 
 
 
76 aa  44.3  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0453276  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0711  nucleic acid binding protein  35.8 
 
 
77 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000841646  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0030  hypothetical protein  35.38 
 
 
78 aa  42.7  0.002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00000268476  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3191  hypothetical protein  38.46 
 
 
81 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.954364  normal  0.892869 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1357  KH domain-containing protein  33.33 
 
 
80 aa  41.2  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000570865  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0768  nucleic acid binding protein  34.18 
 
 
76 aa  40.4  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000813244  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1370  RNA-binding protein (KH domain)  36.36 
 
 
76 aa  40  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209331  normal  0.279466 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0968  hypothetical protein  31.65 
 
 
76 aa  40  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000604549  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>