49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0995 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0995  hypothetical protein  100 
 
 		 81 aa  162  1.0000000000000001e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.889011  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0811  hypothetical protein  70 
 
 		 80 aa  119  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.266588  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0734  hypothetical protein  70 
 
 		 80 aa  119  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.213275  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1432  hypothetical protein  75 
 
 		 80 aa  118  3e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0727534  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1295  hypothetical protein  68.75 
 
 		 80 aa  117  3.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1037  hypothetical protein  67.9 
 
 		 81 aa  110  6e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0558589  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1648  hypothetical protein  54.32 
 
 		 81 aa  98.6  3e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0558  hypothetical protein  58.54 
 
 		 80 aa  92  2e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0452  hypothetical protein  48.75 
 
 		 79 aa  78.2  0.00000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3759  hypothetical protein  36.76 
 
 		 76 aa  51.6  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0453276  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1053  hypothetical protein  38.03 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0325  hypothetical protein  37.5 
 
 		 77 aa  47  0.00008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.851867 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2277  hypothetical protein  41.38 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0054158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1980  RNA-binding protein  44.44 
 
 		 78 aa  45.4  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0711  nucleic acid binding protein  37.04 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000841646  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1370  RNA-binding protein (KH domain)  40 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209331  normal  0.279466 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0969  RNA-binding protein  36.76 
 
 		 77 aa  43.9  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000537782  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2054  hypothetical protein  38.33 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000563212  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1415  hypothetical protein  40 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00178468  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3885  KH domain-containing protein  37.88 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000801997  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0986  KH domain protein  32.81 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.0000000000116002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3891  KH domain protein  37.88 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000683055  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1711  hypothetical protein  35.38 
 
 		 75 aa  42  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000142636  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1168  hypothetical protein  33.33 
 
 		 79 aa  42  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225392  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1389  RNA-binding protein  31.75 
 
 		 73 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0563249  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1198  hypothetical protein  40 
 
 		 75 aa  41.6  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00403857  normal  0.0990302 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1513  hypothetical protein  30 
 
 		 79 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.155704 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1828  KH domain protein  31.75 
 
 		 80 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0800729 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1471  KH domain protein  30 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0670497 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1153  hypothetical protein  26.03 
 
 		 86 aa  41.6  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000910841  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1484  hypothetical protein  34.55 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00652286  normal  0.748996 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4007  hypothetical protein  35.94 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3584  hypothetical protein  37.88 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  7.1205e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3602  hypothetical protein  37.88 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000183566  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1379  KH domain protein  28.38 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000155975  normal  0.609629 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3694  KH domain-containing protein  37.88 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000170601  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3981  kh domain-containing protein  37.88 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000103911  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3857  KH domain protein  37.88 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.50741e-63 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0980  hypothetical protein  34.38 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.747535  normal  0.258716 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1633  RNA-binding protein  29.51 
 
 		 81 aa  41.2  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3259  hypothetical protein  31.75 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1089  nucleic acid binding protein  40 
 
 		 83 aa  40.4  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000185572  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1965  hypothetical protein  38.98 
 
 		 75 aa  40.8  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.780518  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1683  hypothetical protein  38.98 
 
 		 75 aa  40.8  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000180762  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2495  KH domain-containing protein  30.26 
 
 		 75 aa  40.4  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000287664  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1093  R-binding protein (contains KH domain)  37.68 
 
 		 80 aa  40.4  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  5.71907e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3422  KH domain-containing protein  31.15 
 
 		 80 aa  40.4  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0313217  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3040  hypothetical protein  32.35 
 
 		 77 aa  40  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000354702  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2998  hypothetical protein  32.35 
 
 		 77 aa  40  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000253135  normal  0.811405 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>