30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0811 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0811  hypothetical protein  100 
 
 
80 aa  162  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.266588  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0734  hypothetical protein  100 
 
 
80 aa  162  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.213275  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1295  hypothetical protein  98.75 
 
 
80 aa  160  4.0000000000000004e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0995  hypothetical protein  70 
 
 
81 aa  119  9.999999999999999e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.889011  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1432  hypothetical protein  71.25 
 
 
80 aa  117  7e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0727534  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1037  hypothetical protein  70 
 
 
81 aa  116  9.999999999999999e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0558589  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0558  hypothetical protein  62.5 
 
 
80 aa  101  4e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1648  hypothetical protein  55.13 
 
 
81 aa  96.3  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0452  hypothetical protein  51.25 
 
 
79 aa  82  0.000000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3759  hypothetical protein  35.29 
 
 
76 aa  45.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0453276  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1980  RNA-binding protein  38.81 
 
 
78 aa  45.1  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2870  KH, type 1  35.94 
 
 
76 aa  44.7  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000364358  hitchhiker  0.000000513189 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1370  RNA-binding protein (KH domain)  40.68 
 
 
76 aa  44.3  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209331  normal  0.279466 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0969  RNA-binding protein  35 
 
 
77 aa  43.9  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000537782  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3191  hypothetical protein  37.93 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.954364  normal  0.892869 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1097  KH domain-containing protein  34.38 
 
 
76 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00599879  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0711  nucleic acid binding protein  32.5 
 
 
77 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000841646  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3040  hypothetical protein  34.33 
 
 
77 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000354702  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2024  hypothetical protein  32.84 
 
 
77 aa  42.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000350692  normal  0.0107931 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2998  hypothetical protein  34.33 
 
 
77 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000253135  normal  0.811405 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0644  KH domain-containing protein  35.59 
 
 
76 aa  41.6  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.20541  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3430  KH, type 1, domain protein  38.98 
 
 
76 aa  41.2  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000151777  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3492  KH, type 1, domain protein  38.98 
 
 
76 aa  41.2  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.05823e-30 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1149  hypothetical protein  30.43 
 
 
77 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0258994 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1415  hypothetical protein  33.8 
 
 
75 aa  40.8  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00178468  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0968  hypothetical protein  32.88 
 
 
76 aa  40.8  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000604549  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2143  hypothetical protein  32.84 
 
 
77 aa  40.4  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07310  nucleic acid binding protein, containing KH domain  31.51 
 
 
75 aa  40.8  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.97111e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1168  hypothetical protein  30.77 
 
 
79 aa  40.4  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225392  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0768  nucleic acid binding protein  34.21 
 
 
76 aa  40  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000813244  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>