35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0558 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0558  hypothetical protein  100 
 
 
80 aa  161  2.0000000000000002e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1295  hypothetical protein  62.5 
 
 
80 aa  102  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1037  hypothetical protein  66.67 
 
 
81 aa  102  2e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0558589  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0811  hypothetical protein  62.5 
 
 
80 aa  101  4e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.266588  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0734  hypothetical protein  62.5 
 
 
80 aa  101  4e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.213275  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1432  hypothetical protein  67.5 
 
 
80 aa  97.4  6e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0727534  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0995  hypothetical protein  58.54 
 
 
81 aa  92  2e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.889011  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1648  hypothetical protein  53.75 
 
 
81 aa  89.7  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0452  hypothetical protein  51.95 
 
 
79 aa  85.5  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4007  hypothetical protein  33.33 
 
 
78 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5925  hypothetical protein  30.3 
 
 
79 aa  44.3  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.159157  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1980  RNA-binding protein  37.88 
 
 
78 aa  43.9  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1633  RNA-binding protein  31.67 
 
 
81 aa  42.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1168  hypothetical protein  34.38 
 
 
79 aa  42  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225392  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2998  hypothetical protein  33.33 
 
 
77 aa  41.2  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000253135  normal  0.811405 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2539  hypothetical protein  32 
 
 
78 aa  41.6  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160005  normal  0.11735 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3040  hypothetical protein  33.33 
 
 
77 aa  41.2  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000354702  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3593  hypothetical protein  31.82 
 
 
77 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1149  hypothetical protein  31.82 
 
 
77 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0258994 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0711  nucleic acid binding protein  34.33 
 
 
77 aa  41.2  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000841646  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0030  hypothetical protein  31.82 
 
 
78 aa  40.8  0.006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00000268476  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1089  nucleic acid binding protein  37.29 
 
 
83 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000185572  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1966  hypothetical protein  27.27 
 
 
80 aa  40.4  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.179038  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4174  hypothetical protein  27.27 
 
 
80 aa  40.4  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1946  hypothetical protein  27.27 
 
 
80 aa  40.4  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.801249  normal  0.846266 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2012  hypothetical protein  27.27 
 
 
80 aa  40.4  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.313357 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3759  hypothetical protein  33.33 
 
 
76 aa  40.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0453276  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2188  hypothetical protein  27.27 
 
 
80 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0391463  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0986  KH domain protein  33.87 
 
 
79 aa  40.4  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.0000000000116002  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0515  hypothetical protein  47.73 
 
 
84 aa  40  0.01  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1618  hypothetical protein  30.3 
 
 
82 aa  40  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0250504  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3422  KH domain-containing protein  37.1 
 
 
80 aa  40  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0313217  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2084  hypothetical protein  28.79 
 
 
80 aa  40  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0021  hypothetical protein  38.33 
 
 
78 aa  40  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.055536  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0644  KH domain-containing protein  34.38 
 
 
76 aa  40  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.20541  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>