16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4464 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4464  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  178  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.171251 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1787  helix-turn-helix domain-containing protein  75 
 
 		 265 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00189431 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2127  helix-turn-helix domain-containing protein  56.58 
 
 		 268 aa  79.7  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0935212  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4868  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  50 
 
 		 269 aa  61.6  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0639407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1433  hypothetical protein  41.94 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.669776  hitchhiker  0.000487487 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0102  hypothetical protein  43.28 
 
 		 255 aa  53.9  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1378  hypothetical protein  41.94 
 
 		 255 aa  52.4  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.508501  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1415  hypothetical protein  41.94 
 
 		 255 aa  51.2  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0574374 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0098  hypothetical protein  41.54 
 
 		 255 aa  50.4  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0255741  hitchhiker  0.000835874 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14260  Helix-turn-helix protein  41.54 
 
 		 291 aa  49.7  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1414  transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 		 268 aa  47.8  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0188268  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4505  helix-turn-helix domain-containing protein  37.7 
 
 		 262 aa  45.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.832195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4236  helix-turn-helix domain-containing protein  34.18 
 
 		 270 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.359637 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0926  helix-turn-helix domain-containing protein  45.16 
 
 		 265 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7764  hypothetical protein  32.81 
 
 		 217 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3502  hypothetical protein  36.07 
 
 		 164 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.219081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>