49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2584 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2781  hypothetical protein  90.94 
 
 		 552 aa  872    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998834  decreased coverage  0.000210195 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2584  hypothetical protein  100 
 
 		 552 aa  1043    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.455058 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0013  hypothetical protein  39.21 
 
 		 555 aa  349  1e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.837368 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0536  anibiotic ABC transporter efflux pump  40.45 
 
 		 531 aa  323  4e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3202  hypothetical protein  41.11 
 
 		 550 aa  316  6e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0324  hypothetical protein  33.46 
 
 		 534 aa  285  1.0000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.235362 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3675  anibiotic ABC transporter efflux pump  37.92 
 
 		 532 aa  279  1e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36960  putative exporter of polyketide antibiotics  37.92 
 
 		 561 aa  275  2.0000000000000002e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0634645 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0146  hypothetical protein  37.45 
 
 		 565 aa  266  5e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0998  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  37.11 
 
 		 529 aa  257  4e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4602  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  38.57 
 
 		 652 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3550  anibiotic ABC transporter efflux pump  41.84 
 
 		 549 aa  248  3e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.195384 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5633  ABC transporter membrane-spanning protein  36.65 
 
 		 566 aa  246  6.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00963141 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2196  putative ABC transporter membrane-spanning protein  38.71 
 
 		 541 aa  234  3e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2539  hypothetical protein  39.37 
 
 		 540 aa  231  3e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11241  tetronasin ABC transporter membrane protein  37.35 
 
 		 548 aa  230  5e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.157324  normal  0.0850249 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5389  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  38.85 
 
 		 533 aa  228  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.195066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4072  putative ABC transporter membrane-spanning protein  37.74 
 
 		 532 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0567085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2718  hypothetical protein  38.4 
 
 		 539 aa  223  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3998  putative ABC transporter membrane-spanning protein  37.74 
 
 		 532 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0900776  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4012  putative ABC transporter membrane-spanning protein  37.74 
 
 		 532 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0436493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25810  putative exporter of polyketide antibiotics  35.69 
 
 		 532 aa  217  4e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2560  putative ABC transporter  36.67 
 
 		 523 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.211639  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5389  hypothetical protein  35.13 
 
 		 529 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.539443 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4500  putative ABC transporter membrane-spanning protein  37.5 
 
 		 540 aa  210  5e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.949978  normal  0.795337 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0321  putative ABC-2 type transport system permease protein  36.15 
 
 		 545 aa  210  7e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16520  putative exporter of polyketide antibiotics  36.27 
 
 		 555 aa  206  1e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.674167  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0100  anibiotic ABC transporter efflux pump  34.19 
 
 		 526 aa  205  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.995514  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2619  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  33.27 
 
 		 527 aa  203  8e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000786426  normal  0.0934856 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3754  putative ABC transporter permease protein  34.84 
 
 		 551 aa  202  9e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.572399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1835  putative ABC-2 type transport system permease protein  30.35 
 
 		 534 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1756  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  32.88 
 
 		 551 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0241834  normal  0.235687 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1666  putative ABC antibiotics transporter  35.86 
 
 		 548 aa  194  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0957326  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2212  putative ABC antibiotics transporter  36.13 
 
 		 528 aa  190  5e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5315  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  34.91 
 
 		 533 aa  188  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.52035  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0250  putative exporter of polyketide antibiotics  35.36 
 
 		 530 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22140  putative exporter of polyketide antibiotics  32.94 
 
 		 527 aa  169  1e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.357083 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1052  putative exporter of polyketide antibiotics  25.65 
 
 		 500 aa  132  2.0000000000000002e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2194  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  31.76 
 
 		 542 aa  128  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0742009  normal  0.0623246 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06700  putative exporter of polyketide antibiotics  30.82 
 
 		 496 aa  127  6e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1680  putative ABC antibiotics transporter  35.29 
 
 		 544 aa  123  7e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.506245 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1177  putative exporter of polyketide antibiotics  23.28 
 
 		 536 aa  123  9.999999999999999e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.9044  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2205  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  31.35 
 
 		 542 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.526145  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2251  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  31.35 
 
 		 542 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.845086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3297  putative ABC transporter  26.63 
 
 		 527 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2921  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  28.49 
 
 		 546 aa  71.2  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.595685  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5398  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  33.08 
 
 		 270 aa  52  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0567  hypothetical protein  38.02 
 
 		 143 aa  46.2  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.939774  hitchhiker  0.00416939 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0483  hypothetical protein  23.53 
 
 		 574 aa  43.5  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>