48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2560 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2560  putative ABC transporter  100 
 
 		 523 aa  1000    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.211639  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5633  ABC transporter membrane-spanning protein  36.11 
 
 		 566 aa  277  4e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00963141 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36960  putative exporter of polyketide antibiotics  39.85 
 
 		 561 aa  276  6e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0634645 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4602  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  40.19 
 
 		 652 aa  276  7e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3202  hypothetical protein  39.58 
 
 		 550 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0536  anibiotic ABC transporter efflux pump  37.5 
 
 		 531 aa  266  5.999999999999999e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5389  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  41.21 
 
 		 533 aa  254  3e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.195066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0324  hypothetical protein  31.32 
 
 		 534 aa  253  6e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.235362 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0013  hypothetical protein  33.65 
 
 		 555 aa  252  1e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.837368 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11241  tetronasin ABC transporter membrane protein  36.9 
 
 		 548 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.157324  normal  0.0850249 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0998  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  34.09 
 
 		 529 aa  241  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2781  hypothetical protein  36.04 
 
 		 552 aa  239  6.999999999999999e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998834  decreased coverage  0.000210195 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2584  hypothetical protein  35.97 
 
 		 552 aa  231  3e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.455058 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3675  anibiotic ABC transporter efflux pump  35.93 
 
 		 532 aa  225  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1756  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  34.55 
 
 		 551 aa  219  1e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0241834  normal  0.235687 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2718  hypothetical protein  36.97 
 
 		 539 aa  217  4e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0146  hypothetical protein  34.89 
 
 		 565 aa  212  1e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0321  putative ABC-2 type transport system permease protein  37.15 
 
 		 545 aa  209  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3754  putative ABC transporter permease protein  38.65 
 
 		 551 aa  206  7e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.572399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2539  hypothetical protein  37.45 
 
 		 540 aa  205  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5389  hypothetical protein  36.55 
 
 		 529 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.539443 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25810  putative exporter of polyketide antibiotics  34.52 
 
 		 532 aa  204  3e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0100  anibiotic ABC transporter efflux pump  34.44 
 
 		 526 aa  202  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.995514  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2196  putative ABC transporter membrane-spanning protein  34.92 
 
 		 541 aa  193  6e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3550  anibiotic ABC transporter efflux pump  39.42 
 
 		 549 aa  192  1e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.195384 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3998  putative ABC transporter membrane-spanning protein  35.77 
 
 		 532 aa  189  8e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0900776  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4072  putative ABC transporter membrane-spanning protein  35.77 
 
 		 532 aa  189  8e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0567085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4012  putative ABC transporter membrane-spanning protein  34.9 
 
 		 532 aa  189  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0436493  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0250  putative exporter of polyketide antibiotics  32.83 
 
 		 530 aa  187  5e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2212  putative ABC antibiotics transporter  34.15 
 
 		 528 aa  187  5e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16520  putative exporter of polyketide antibiotics  34.06 
 
 		 555 aa  182  1e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.674167  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1835  putative ABC-2 type transport system permease protein  29.32 
 
 		 534 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1666  putative ABC antibiotics transporter  38.14 
 
 		 548 aa  181  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0957326  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4500  putative ABC transporter membrane-spanning protein  34.69 
 
 		 540 aa  171  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.949978  normal  0.795337 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2619  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  30.69 
 
 		 527 aa  162  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000786426  normal  0.0934856 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06700  putative exporter of polyketide antibiotics  31.59 
 
 		 496 aa  147  3e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1052  putative exporter of polyketide antibiotics  26.43 
 
 		 500 aa  145  3e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5315  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  32.98 
 
 		 533 aa  144  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.52035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22140  putative exporter of polyketide antibiotics  31.55 
 
 		 527 aa  120  6e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.357083 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3297  putative ABC transporter  30.23 
 
 		 527 aa  120  7.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1177  putative exporter of polyketide antibiotics  22.62 
 
 		 536 aa  116  7.999999999999999e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.9044  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1680  putative ABC antibiotics transporter  32.28 
 
 		 544 aa  97.8  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.506245 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2194  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  29.48 
 
 		 542 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0742009  normal  0.0623246 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2251  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  29.17 
 
 		 542 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.845086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2205  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  29.17 
 
 		 542 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.526145  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0567  hypothetical protein  41.86 
 
 		 143 aa  56.6  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.939774  hitchhiker  0.00416939 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2921  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  29.61 
 
 		 546 aa  56.2  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.595685  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5398  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  36.07 
 
 		 270 aa  50.1  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>