48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5633 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5633  ABC transporter membrane-spanning protein  100 
 
 		 566 aa  1102    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00963141 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36960  putative exporter of polyketide antibiotics  41.59 
 
 		 561 aa  366  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0634645 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5389  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  48.67 
 
 		 533 aa  367  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.195066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11241  tetronasin ABC transporter membrane protein  41.47 
 
 		 548 aa  342  1e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.157324  normal  0.0850249 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0998  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  35.73 
 
 		 529 aa  293  6e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27333  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3202  hypothetical protein  38.87 
 
 		 550 aa  290  7e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25810  putative exporter of polyketide antibiotics  38.82 
 
 		 532 aa  280  6e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0536  anibiotic ABC transporter efflux pump  36.77 
 
 		 531 aa  278  2e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4602  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  37.15 
 
 		 652 aa  276  6e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5389  hypothetical protein  38.79 
 
 		 529 aa  275  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.539443 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0321  putative ABC-2 type transport system permease protein  37.35 
 
 		 545 aa  270  4e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3675  anibiotic ABC transporter efflux pump  37.27 
 
 		 532 aa  265  2e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2212  putative ABC antibiotics transporter  39.22 
 
 		 528 aa  263  8e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0324  hypothetical protein  30.68 
 
 		 534 aa  259  9e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.235362 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2718  hypothetical protein  36.94 
 
 		 539 aa  252  1e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2560  putative ABC transporter  36.11 
 
 		 523 aa  251  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.211639  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1756  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  35.03 
 
 		 551 aa  243  1e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0241834  normal  0.235687 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2781  hypothetical protein  37.18 
 
 		 552 aa  240  4e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998834  decreased coverage  0.000210195 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2539  hypothetical protein  36.5 
 
 		 540 aa  239  1e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2584  hypothetical protein  36.65 
 
 		 552 aa  238  2e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.455058 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0100  anibiotic ABC transporter efflux pump  34.14 
 
 		 526 aa  238  2e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.995514  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0250  putative exporter of polyketide antibiotics  31.58 
 
 		 530 aa  224  4e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1835  putative ABC-2 type transport system permease protein  30.94 
 
 		 534 aa  220  7e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2619  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  34.7 
 
 		 527 aa  207  3e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000786426  normal  0.0934856 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0013  hypothetical protein  30.86 
 
 		 555 aa  206  8e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.837368 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3754  putative ABC transporter permease protein  36.36 
 
 		 551 aa  201  3e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.572399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5315  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  34.91 
 
 		 533 aa  199  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.52035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2196  putative ABC transporter membrane-spanning protein  34.67 
 
 		 541 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16520  putative exporter of polyketide antibiotics  31.14 
 
 		 555 aa  186  1.0000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.674167  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1666  putative ABC antibiotics transporter  33.97 
 
 		 548 aa  184  3e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0957326  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0146  hypothetical protein  29.41 
 
 		 565 aa  184  5.0000000000000004e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4072  putative ABC transporter membrane-spanning protein  34.27 
 
 		 532 aa  178  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0567085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3998  putative ABC transporter membrane-spanning protein  34.27 
 
 		 532 aa  178  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0900776  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4012  putative ABC transporter membrane-spanning protein  34.27 
 
 		 532 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0436493  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3550  anibiotic ABC transporter efflux pump  33.47 
 
 		 549 aa  168  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.195384 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4500  putative ABC transporter membrane-spanning protein  33.47 
 
 		 540 aa  157  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.949978  normal  0.795337 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3297  putative ABC transporter  28.71 
 
 		 527 aa  150  9e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1177  putative exporter of polyketide antibiotics  25.74 
 
 		 536 aa  147  7.0000000000000006e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.9044  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1052  putative exporter of polyketide antibiotics  24.18 
 
 		 500 aa  145  1e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22140  putative exporter of polyketide antibiotics  31.97 
 
 		 527 aa  141  3e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.357083 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2205  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  28.71 
 
 		 542 aa  135  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.526145  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2251  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  28.71 
 
 		 542 aa  135  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.845086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2194  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  29.04 
 
 		 542 aa  134  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0742009  normal  0.0623246 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06700  putative exporter of polyketide antibiotics  28.63 
 
 		 496 aa  126  1e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1680  putative ABC antibiotics transporter  31.95 
 
 		 544 aa  124  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.506245 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2921  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  30.89 
 
 		 546 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.595685  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5398  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  37.41 
 
 		 270 aa  63.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0567  hypothetical protein  34.43 
 
 		 143 aa  50.1  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.939774  hitchhiker  0.00416939 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>