47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_16520 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_16520  putative exporter of polyketide antibiotics  100 
 
 		 555 aa  1044    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.674167  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0536  anibiotic ABC transporter efflux pump  43.58 
 
 		 531 aa  333  6e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0146  hypothetical protein  36.07 
 
 		 565 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3675  anibiotic ABC transporter efflux pump  38.64 
 
 		 532 aa  247  3e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3550  anibiotic ABC transporter efflux pump  44.35 
 
 		 549 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.195384 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0324  hypothetical protein  31.27 
 
 		 534 aa  242  2e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.235362 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0013  hypothetical protein  32.98 
 
 		 555 aa  234  2.0000000000000002e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.837368 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3202  hypothetical protein  35.33 
 
 		 550 aa  229  8e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3998  putative ABC transporter membrane-spanning protein  35.83 
 
 		 532 aa  216  8e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0900776  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4072  putative ABC transporter membrane-spanning protein  35.83 
 
 		 532 aa  216  8e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0567085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4012  putative ABC transporter membrane-spanning protein  35.83 
 
 		 532 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0436493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2781  hypothetical protein  34.62 
 
 		 552 aa  212  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998834  decreased coverage  0.000210195 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2584  hypothetical protein  36.04 
 
 		 552 aa  206  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.455058 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2196  putative ABC transporter membrane-spanning protein  36 
 
 		 541 aa  204  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4500  putative ABC transporter membrane-spanning protein  35.22 
 
 		 540 aa  200  6e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.949978  normal  0.795337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5633  ABC transporter membrane-spanning protein  30.43 
 
 		 566 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00963141 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36960  putative exporter of polyketide antibiotics  33.63 
 
 		 561 aa  187  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0634645 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0998  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  32.71 
 
 		 529 aa  185  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1835  putative ABC-2 type transport system permease protein  29.63 
 
 		 534 aa  180  7e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0100  anibiotic ABC transporter efflux pump  32.81 
 
 		 526 aa  179  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.995514  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0321  putative ABC-2 type transport system permease protein  32.71 
 
 		 545 aa  172  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2560  putative ABC transporter  33.02 
 
 		 523 aa  167  5.9999999999999996e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.211639  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11241  tetronasin ABC transporter membrane protein  32.5 
 
 		 548 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.157324  normal  0.0850249 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2539  hypothetical protein  34.01 
 
 		 540 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4602  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  33.04 
 
 		 652 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5389  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  38.18 
 
 		 533 aa  164  5.0000000000000005e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.195066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2718  hypothetical protein  34.69 
 
 		 539 aa  161  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1756  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  30.55 
 
 		 551 aa  159  9e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0241834  normal  0.235687 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25810  putative exporter of polyketide antibiotics  33.52 
 
 		 532 aa  158  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5389  hypothetical protein  35.7 
 
 		 529 aa  154  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.539443 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2619  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  32.21 
 
 		 527 aa  153  8e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000786426  normal  0.0934856 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1666  putative ABC antibiotics transporter  32.2 
 
 		 548 aa  140  7.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0957326  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0250  putative exporter of polyketide antibiotics  29.21 
 
 		 530 aa  140  8.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06700  putative exporter of polyketide antibiotics  28.72 
 
 		 496 aa  129  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1052  putative exporter of polyketide antibiotics  25.25 
 
 		 500 aa  128  3e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2212  putative ABC antibiotics transporter  32.1 
 
 		 528 aa  117  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3754  putative ABC transporter permease protein  29.21 
 
 		 551 aa  115  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.572399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2194  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  28.79 
 
 		 542 aa  108  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0742009  normal  0.0623246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2205  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  28.86 
 
 		 542 aa  107  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.526145  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2251  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  28.86 
 
 		 542 aa  107  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.845086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22140  putative exporter of polyketide antibiotics  28.25 
 
 		 527 aa  105  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.357083 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1177  putative exporter of polyketide antibiotics  20.75 
 
 		 536 aa  92.4  2e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.9044  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5315  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  29.91 
 
 		 533 aa  88.2  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.52035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3297  putative ABC transporter  29.27 
 
 		 527 aa  85.5  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1680  putative ABC antibiotics transporter  30.46 
 
 		 544 aa  77  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.506245 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2921  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  30.06 
 
 		 546 aa  60.8  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.595685  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0567  hypothetical protein  35.59 
 
 		 143 aa  50.1  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.939774  hitchhiker  0.00416939 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>