47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5315 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5315  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  100 
 
 
533 aa  1018    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.52035  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11241  tetronasin ABC transporter membrane protein  39.15 
 
 
548 aa  252  1e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.157324  normal  0.0850249 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36960  putative exporter of polyketide antibiotics  37.2 
 
 
561 aa  232  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0634645 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5633  ABC transporter membrane-spanning protein  34.77 
 
 
566 aa  221  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00963141 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4602  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  37.29 
 
 
652 aa  221  3e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0998  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  33.09 
 
 
529 aa  205  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27333  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5389  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  41.25 
 
 
533 aa  202  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.195066  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2781  hypothetical protein  36.45 
 
 
552 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998834  decreased coverage  0.000210195 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25810  putative exporter of polyketide antibiotics  35.13 
 
 
532 aa  194  4e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5389  hypothetical protein  34.49 
 
 
529 aa  193  7e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.539443 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2718  hypothetical protein  34.99 
 
 
539 aa  188  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3202  hypothetical protein  34.77 
 
 
550 aa  187  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0536  anibiotic ABC transporter efflux pump  34.44 
 
 
531 aa  187  5e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2584  hypothetical protein  35.96 
 
 
552 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.455058 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0100  anibiotic ABC transporter efflux pump  32.59 
 
 
526 aa  182  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.995514  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0321  putative ABC-2 type transport system permease protein  35.65 
 
 
545 aa  181  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3754  putative ABC transporter permease protein  37.37 
 
 
551 aa  175  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.572399  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2212  putative ABC antibiotics transporter  33.89 
 
 
528 aa  169  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2539  hypothetical protein  34.32 
 
 
540 aa  168  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1756  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  35.27 
 
 
551 aa  164  5.0000000000000005e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0241834  normal  0.235687 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0250  putative exporter of polyketide antibiotics  34.54 
 
 
530 aa  163  7e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0013  hypothetical protein  31.71 
 
 
555 aa  160  5e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.837368 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0324  hypothetical protein  27.07 
 
 
534 aa  154  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.235362 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3675  anibiotic ABC transporter efflux pump  32.84 
 
 
532 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1835  putative ABC-2 type transport system permease protein  27.34 
 
 
534 aa  144  4e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3550  anibiotic ABC transporter efflux pump  39.23 
 
 
549 aa  139  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.195384 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2619  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  31.03 
 
 
527 aa  138  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000786426  normal  0.0934856 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2560  putative ABC transporter  31.1 
 
 
523 aa  135  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.211639  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0146  hypothetical protein  31.65 
 
 
565 aa  130  5.0000000000000004e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4072  putative ABC transporter membrane-spanning protein  32.28 
 
 
532 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0567085  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3998  putative ABC transporter membrane-spanning protein  32.28 
 
 
532 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0900776  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4012  putative ABC transporter membrane-spanning protein  32.28 
 
 
532 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0436493  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3297  putative ABC transporter  29.89 
 
 
527 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1666  putative ABC antibiotics transporter  30.25 
 
 
548 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0957326  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06700  putative exporter of polyketide antibiotics  35.34 
 
 
496 aa  102  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1680  putative ABC antibiotics transporter  31.87 
 
 
544 aa  98.2  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.506245 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16520  putative exporter of polyketide antibiotics  30.35 
 
 
555 aa  94.7  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.674167  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1052  putative exporter of polyketide antibiotics  26.04 
 
 
500 aa  93.2  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2194  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  28.54 
 
 
542 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0742009  normal  0.0623246 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2196  putative ABC transporter membrane-spanning protein  32.03 
 
 
541 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4500  putative ABC transporter membrane-spanning protein  29.98 
 
 
540 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.949978  normal  0.795337 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2205  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  28.54 
 
 
542 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.526145  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2251  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  28.54 
 
 
542 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.845086  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1177  putative exporter of polyketide antibiotics  26.84 
 
 
536 aa  81.3  0.00000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.9044  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2921  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  32 
 
 
546 aa  63.5  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.595685  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22140  putative exporter of polyketide antibiotics  32.15 
 
 
527 aa  58.9  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.357083 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5398  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  34.21 
 
 
270 aa  45.8  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>