47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0321 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0321  putative ABC-2 type transport system permease protein  100 
 
 		 545 aa  1033    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5633  ABC transporter membrane-spanning protein  36.86 
 
 		 566 aa  301  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00963141 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11241  tetronasin ABC transporter membrane protein  41.38 
 
 		 548 aa  286  9e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.157324  normal  0.0850249 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5389  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  44.34 
 
 		 533 aa  281  2e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.195066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0998  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  37.43 
 
 		 529 aa  279  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36960  putative exporter of polyketide antibiotics  37.57 
 
 		 561 aa  270  4e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0634645 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0536  anibiotic ABC transporter efflux pump  37.22 
 
 		 531 aa  259  1e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4602  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  39.67 
 
 		 652 aa  258  2e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3202  hypothetical protein  37.64 
 
 		 550 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5389  hypothetical protein  39.81 
 
 		 529 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.539443 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0324  hypothetical protein  30.97 
 
 		 534 aa  236  7e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.235362 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2718  hypothetical protein  38.2 
 
 		 539 aa  233  9e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25810  putative exporter of polyketide antibiotics  37.18 
 
 		 532 aa  228  2e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0100  anibiotic ABC transporter efflux pump  38.52 
 
 		 526 aa  228  3e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.995514  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2539  hypothetical protein  37.92 
 
 		 540 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0013  hypothetical protein  31.99 
 
 		 555 aa  216  8e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.837368 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2781  hypothetical protein  34.48 
 
 		 552 aa  216  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998834  decreased coverage  0.000210195 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3675  anibiotic ABC transporter efflux pump  37.78 
 
 		 532 aa  214  3.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2212  putative ABC antibiotics transporter  37.71 
 
 		 528 aa  213  7e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0250  putative exporter of polyketide antibiotics  32.96 
 
 		 530 aa  211  3e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0146  hypothetical protein  31.59 
 
 		 565 aa  210  6e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2560  putative ABC transporter  36.43 
 
 		 523 aa  204  3e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.211639  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1756  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  35.01 
 
 		 551 aa  204  4e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0241834  normal  0.235687 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2584  hypothetical protein  34.98 
 
 		 552 aa  203  6e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.455058 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1835  putative ABC-2 type transport system permease protein  30.78 
 
 		 534 aa  197  4.0000000000000005e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5315  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  36.15 
 
 		 533 aa  186  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.52035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1666  putative ABC antibiotics transporter  35.51 
 
 		 548 aa  184  5.0000000000000004e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0957326  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16520  putative exporter of polyketide antibiotics  32.21 
 
 		 555 aa  181  4e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.674167  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3550  anibiotic ABC transporter efflux pump  35.85 
 
 		 549 aa  170  5e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.195384 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2619  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  31.12 
 
 		 527 aa  168  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000786426  normal  0.0934856 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2196  putative ABC transporter membrane-spanning protein  32.91 
 
 		 541 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4012  putative ABC transporter membrane-spanning protein  31.7 
 
 		 532 aa  166  9e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0436493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3998  putative ABC transporter membrane-spanning protein  32.01 
 
 		 532 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0900776  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4072  putative ABC transporter membrane-spanning protein  32.01 
 
 		 532 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0567085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3754  putative ABC transporter permease protein  34.36 
 
 		 551 aa  161  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.572399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4500  putative ABC transporter membrane-spanning protein  33 
 
 		 540 aa  143  9e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.949978  normal  0.795337 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1052  putative exporter of polyketide antibiotics  26.55 
 
 		 500 aa  134  3e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22140  putative exporter of polyketide antibiotics  31.76 
 
 		 527 aa  132  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.357083 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3297  putative ABC transporter  26.97 
 
 		 527 aa  124  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06700  putative exporter of polyketide antibiotics  32.83 
 
 		 496 aa  122  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1680  putative ABC antibiotics transporter  34.46 
 
 		 544 aa  109  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.506245 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1177  putative exporter of polyketide antibiotics  24.19 
 
 		 536 aa  107  7e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.9044  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2194  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  28.38 
 
 		 542 aa  103  9e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0742009  normal  0.0623246 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2251  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  29.84 
 
 		 542 aa  97.8  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.845086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2205  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  29.84 
 
 		 542 aa  97.8  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.526145  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2921  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  29.74 
 
 		 546 aa  77.8  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.595685  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0567  hypothetical protein  38.46 
 
 		 143 aa  55.5  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.939774  hitchhiker  0.00416939 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>