46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0536 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0536  anibiotic ABC transporter efflux pump  100 
 
 		 531 aa  998    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3675  anibiotic ABC transporter efflux pump  45.11 
 
 		 532 aa  355  1e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0146  hypothetical protein  43.2 
 
 		 565 aa  351  2e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0324  hypothetical protein  34.97 
 
 		 534 aa  333  4e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.235362 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2781  hypothetical protein  42.12 
 
 		 552 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998834  decreased coverage  0.000210195 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3202  hypothetical protein  40.27 
 
 		 550 aa  300  6e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16520  putative exporter of polyketide antibiotics  43.58 
 
 		 555 aa  297  3e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.674167  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2584  hypothetical protein  40 
 
 		 552 aa  295  1e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.455058 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3998  putative ABC transporter membrane-spanning protein  40.64 
 
 		 532 aa  276  8e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0900776  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4072  putative ABC transporter membrane-spanning protein  40.64 
 
 		 532 aa  276  8e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0567085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4012  putative ABC transporter membrane-spanning protein  40.77 
 
 		 532 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0436493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2196  putative ABC transporter membrane-spanning protein  41.37 
 
 		 541 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3550  anibiotic ABC transporter efflux pump  41.55 
 
 		 549 aa  271  2.9999999999999997e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.195384 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5633  ABC transporter membrane-spanning protein  36.77 
 
 		 566 aa  263  4e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00963141 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0013  hypothetical protein  32.33 
 
 		 555 aa  260  3e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.837368 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4602  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  39.55 
 
 		 652 aa  256  7e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0998  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  36.78 
 
 		 529 aa  254  3e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4500  putative ABC transporter membrane-spanning protein  40.23 
 
 		 540 aa  253  8.000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.949978  normal  0.795337 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5389  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  42.38 
 
 		 533 aa  250  4e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.195066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1756  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  37.07 
 
 		 551 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0241834  normal  0.235687 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2539  hypothetical protein  40.29 
 
 		 540 aa  240  4e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5389  hypothetical protein  36.85 
 
 		 529 aa  234  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.539443 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2718  hypothetical protein  38.93 
 
 		 539 aa  232  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2560  putative ABC transporter  37 
 
 		 523 aa  231  3e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.211639  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1835  putative ABC-2 type transport system permease protein  32.58 
 
 		 534 aa  229  8e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36960  putative exporter of polyketide antibiotics  35.34 
 
 		 561 aa  221  3e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0634645 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11241  tetronasin ABC transporter membrane protein  38.15 
 
 		 548 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.157324  normal  0.0850249 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0321  putative ABC-2 type transport system permease protein  36.24 
 
 		 545 aa  214  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0100  anibiotic ABC transporter efflux pump  33.21 
 
 		 526 aa  201  3e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.995514  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25810  putative exporter of polyketide antibiotics  34.52 
 
 		 532 aa  195  2e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2619  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  34.34 
 
 		 527 aa  195  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000786426  normal  0.0934856 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3754  putative ABC transporter permease protein  36.88 
 
 		 551 aa  187  5e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.572399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2212  putative ABC antibiotics transporter  33.96 
 
 		 528 aa  176  8e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1666  putative ABC antibiotics transporter  34.62 
 
 		 548 aa  176  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0957326  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0250  putative exporter of polyketide antibiotics  32.58 
 
 		 530 aa  173  9e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1177  putative exporter of polyketide antibiotics  23.68 
 
 		 536 aa  159  9e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.9044  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1052  putative exporter of polyketide antibiotics  26.31 
 
 		 500 aa  155  1e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5315  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  34.81 
 
 		 533 aa  156  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.52035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06700  putative exporter of polyketide antibiotics  33.55 
 
 		 496 aa  147  3e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3297  putative ABC transporter  29.68 
 
 		 527 aa  124  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22140  putative exporter of polyketide antibiotics  35.53 
 
 		 527 aa  123  8e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.357083 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1680  putative ABC antibiotics transporter  34.29 
 
 		 544 aa  118  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.506245 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2194  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  30.38 
 
 		 542 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0742009  normal  0.0623246 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2251  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  30.83 
 
 		 542 aa  115  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.845086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2205  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  30.83 
 
 		 542 aa  115  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.526145  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2921  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  27.22 
 
 		 546 aa  60.5  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.595685  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>