47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11241 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11241  tetronasin ABC transporter membrane protein  100 
 
 
548 aa  1053    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.157324  normal  0.0850249 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36960  putative exporter of polyketide antibiotics  44.05 
 
 
561 aa  361  2e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0634645 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0998  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  42.53 
 
 
529 aa  355  1e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27333  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5633  ABC transporter membrane-spanning protein  39.82 
 
 
566 aa  346  8e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00963141 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25810  putative exporter of polyketide antibiotics  42.59 
 
 
532 aa  326  6e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5389  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  45.11 
 
 
533 aa  312  9e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.195066  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2212  putative ABC antibiotics transporter  41.92 
 
 
528 aa  291  2e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2539  hypothetical protein  41 
 
 
540 aa  289  7e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2718  hypothetical protein  41.64 
 
 
539 aa  289  8e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3202  hypothetical protein  40.99 
 
 
550 aa  278  1e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5389  hypothetical protein  40.3 
 
 
529 aa  277  4e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.539443 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0321  putative ABC-2 type transport system permease protein  41.52 
 
 
545 aa  276  9e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4602  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  40.15 
 
 
652 aa  268  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0324  hypothetical protein  34.64 
 
 
534 aa  268  2e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.235362 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0100  anibiotic ABC transporter efflux pump  37.06 
 
 
526 aa  261  3e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.995514  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0536  anibiotic ABC transporter efflux pump  36.7 
 
 
531 aa  243  5e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2781  hypothetical protein  39.13 
 
 
552 aa  242  1e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998834  decreased coverage  0.000210195 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0013  hypothetical protein  34.3 
 
 
555 aa  233  5e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.837368 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5315  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  39.11 
 
 
533 aa  233  7.000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.52035  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0250  putative exporter of polyketide antibiotics  36.43 
 
 
530 aa  233  7.000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1756  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  36.88 
 
 
551 aa  230  5e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0241834  normal  0.235687 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2584  hypothetical protein  37.31 
 
 
552 aa  226  7e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.455058 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2560  putative ABC transporter  37.36 
 
 
523 aa  221  3e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.211639  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3754  putative ABC transporter permease protein  36.85 
 
 
551 aa  219  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.572399  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0146  hypothetical protein  34.81 
 
 
565 aa  218  2.9999999999999998e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3675  anibiotic ABC transporter efflux pump  36.26 
 
 
532 aa  217  4e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1835  putative ABC-2 type transport system permease protein  33.08 
 
 
534 aa  200  5e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1666  putative ABC antibiotics transporter  34.84 
 
 
548 aa  189  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0957326  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3550  anibiotic ABC transporter efflux pump  38.76 
 
 
549 aa  179  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.195384 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3998  putative ABC transporter membrane-spanning protein  37.44 
 
 
532 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0900776  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4072  putative ABC transporter membrane-spanning protein  37.44 
 
 
532 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0567085  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4012  putative ABC transporter membrane-spanning protein  37.44 
 
 
532 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0436493  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2196  putative ABC transporter membrane-spanning protein  32.97 
 
 
541 aa  172  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4500  putative ABC transporter membrane-spanning protein  35.7 
 
 
540 aa  171  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.949978  normal  0.795337 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3297  putative ABC transporter  28.84 
 
 
527 aa  171  5e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06700  putative exporter of polyketide antibiotics  33.05 
 
 
496 aa  164  5.0000000000000005e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16520  putative exporter of polyketide antibiotics  32.34 
 
 
555 aa  153  7e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.674167  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2619  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  30 
 
 
527 aa  153  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000786426  normal  0.0934856 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1052  putative exporter of polyketide antibiotics  26.73 
 
 
500 aa  146  8.000000000000001e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1177  putative exporter of polyketide antibiotics  25.05 
 
 
536 aa  119  1.9999999999999998e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.9044  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1680  putative ABC antibiotics transporter  33.16 
 
 
544 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.506245 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2194  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  27.57 
 
 
542 aa  108  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0742009  normal  0.0623246 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2251  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  27.72 
 
 
542 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.845086  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2205  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  27.72 
 
 
542 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.526145  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2921  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  31.86 
 
 
546 aa  98.6  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.595685  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22140  putative exporter of polyketide antibiotics  33.2 
 
 
527 aa  96.7  9e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.357083 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5398  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  43.06 
 
 
270 aa  47  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>